More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4972 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4972  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 205 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4711  NUDIX hydrolase  99.02 
 
 		 205 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.754787 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4919  NUDIX hydrolase  97.56 
 
 		 209 aa  411  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4795  NUDIX hydrolase  97.56 
 
 		 205 aa  410  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0547  hypothetical protein  79.41 
 
 		 215 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0495  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  77.56 
 
 		 205 aa  345  3e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4973  mutT/nudix family protein  73.17 
 
 		 205 aa  332  3e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0608  NUDIX hydrolase  76.29 
 
 		 199 aa  315  3e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5700  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  75 
 
 		 205 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65710  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  75 
 
 		 205 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44580  nudix hydrolase, YffH family  71.57 
 
 		 205 aa  301  5.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.286548  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3331  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  51.03 
 
 		 208 aa  206  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0444683  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3447  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  51.3 
 
 		 210 aa  200  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3776  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  51.56 
 
 		 211 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2012  MutT/nudix family protein  49.05 
 
 		 208 aa  199  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000517661  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00870  hypothetical protein  50.78 
 
 		 216 aa  198  3.9999999999999996e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0315  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  50.52 
 
 		 210 aa  196  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3443  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  50.26 
 
 		 210 aa  193  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4267  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  50.52 
 
 		 210 aa  193  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839672 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3366  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  50.26 
 
 		 210 aa  193  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3618  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  50.52 
 
 		 211 aa  193  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3436  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  50.26 
 
 		 210 aa  193  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004521  ADP-ribose pyrophosphatase  48.96 
 
 		 216 aa  193  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000302738  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3371  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  50.26 
 
 		 210 aa  193  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.337716 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3212  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  47.55 
 
 		 209 aa  193  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00741682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0663  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  47.55 
 
 		 209 aa  193  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.16672  normal  0.0141721 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02906  ADP-ribose pyrophosphatase  48.96 
 
 		 209 aa  192  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0666  ADP-ribose diphosphatase  48.96 
 
 		 209 aa  192  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3538  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  50.26 
 
 		 210 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4348  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  48.96 
 
 		 209 aa  192  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3329  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  48.96 
 
 		 209 aa  192  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.746955 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2674  ADP-ribose pyrophosphatase  50.26 
 
 		 215 aa  192  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3498  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  48.96 
 
 		 209 aa  192  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0634708  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02856  hypothetical protein  48.96 
 
 		 209 aa  192  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3467  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  48.96 
 
 		 209 aa  191  4e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0321029  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0545  ADP-ribose diphosphatase  47.37 
 
 		 202 aa  191  5e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0726  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  48.22 
 
 		 203 aa  189  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0027035  hitchhiker  0.000778949 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3359  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  50.53 
 
 		 206 aa  189  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0950071 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0027  NUDIX hydrolase  51.55 
 
 		 213 aa  189  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1355  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  49.74 
 
 		 201 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.127377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3235  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  48.22 
 
 		 203 aa  187  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00707793  hitchhiker  0.00000215101 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0804  NUDIX hydrolase  50.73 
 
 		 206 aa  187  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0754  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  48.22 
 
 		 203 aa  186  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0370949  hitchhiker  0.0055541 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4180  ADP-ribose pyrophosphatase  51.67 
 
 		 214 aa  185  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0431  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  44.39 
 
 		 206 aa  185  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000737623  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0775  ADP-ribose diphosphatase  49.46 
 
 		 204 aa  184  5e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000156265  unclonable  0.0000000000726693 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0782  NUDIX hydrolase  48.15 
 
 		 200 aa  184  6e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000245239  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0807  NUDIX hydrolase  48.15 
 
 		 200 aa  184  7e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000627891  hitchhiker  0.0000000000549987 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3577  NUDIX hydrolase  48.15 
 
 		 200 aa  184  7e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368158  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0814  NUDIX hydrolase  48.15 
 
 		 200 aa  184  7e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00725628  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4194  ADP-ribose diphosphatase  47.62 
 
 		 200 aa  184  8e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.105257  hitchhiker  0.00339235 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3903  MutT/nudix family protein  48.94 
 
 		 200 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3047  ADP-ribose diphosphatase  49.47 
 
 		 204 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000114185  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3562  NUDIX hydrolase  47.87 
 
 		 203 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3224  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  47.12 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000886574  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1377  NUDIX hydrolase  48.19 
 
 		 196 aa  177  8e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.340086  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0324  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  51.56 
 
 		 210 aa  176  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000684842  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0769  ADP-ribose diphosphatase  47.87 
 
 		 200 aa  176  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0574  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  50.26 
 
 		 210 aa  175  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0580  ADP-ribose diphosphatase  43.59 
 
 		 206 aa  175  4e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0655  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  50.26 
 
 		 210 aa  175  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.348636  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0283  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  50.26 
 
 		 210 aa  175  4e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1063  ADP-ribose diphosphatase  49.45 
 
 		 194 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0370  ADP-ribose pyrophosphatase  44.15 
 
 		 205 aa  171  9e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1525  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  47.21 
 
 		 210 aa  170  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.411844  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03689  ADP-ribose pyrophosphatase  42.16 
 
 		 188 aa  169  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000876457  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1477  hypothetical protein  49.47 
 
 		 200 aa  168  4e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3558  NUDIX hydrolase  41.62 
 
 		 206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.324606  normal  0.411557 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2556  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  48.89 
 
 		 209 aa  164  6.9999999999999995e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0820  NUDIX hydrolase  40.82 
 
 		 361 aa  161  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.397397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2146  tellurite resistance protein  40.82 
 
 		 361 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0818  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 362 aa  154  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2991  NUDIX hydrolase  40.89 
 
 		 204 aa  147  8e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2315  NUDIX hydrolase  40.93 
 
 		 378 aa  145  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1358  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  41.24 
 
 		 202 aa  136  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1992  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  39.25 
 
 		 375 aa  134  9e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3860  NUDIX hydrolase  39.51 
 
 		 368 aa  116  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1092  NUDIX hydrolase  36.04 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0217104  hitchhiker  0.00264715 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0790  NUDIX hydrolase  36.87 
 
 		 198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14892  normal  0.428027 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0105  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 		 201 aa  108  8.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1238  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 197 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0804984  hitchhiker  0.0000559773 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3722  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  38.99 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4209  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 212 aa  97.8  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.146155  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2637  NUDIX hydrolase  36.87 
 
 		 217 aa  96.7  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2384  hypothetical protein  41.18 
 
 		 193 aa  95.9  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.227212  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5218  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 		 195 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1566  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  33.33 
 
 		 194 aa  92.8  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4950  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 		 195 aa  87.8  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17081  normal  0.0998667 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6151  NUDIX hydrolase  33.68 
 
 		 193 aa  86.3  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.389113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1775  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  37.16 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.515825  normal  0.0632378 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2255  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 		 198 aa  85.1  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0463  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  36.88 
 
 		 199 aa  85.1  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0904  NUDIX hydrolase  36.88 
 
 		 199 aa  85.1  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.682548 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0942  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  36.88 
 
 		 199 aa  85.1  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1763  hypothetical protein  34.1 
 
 		 198 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00769782  normal  0.0120574 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2191  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3688  hydrolase, NUDIX family  34.64 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2613  NUDIX family hydrolase  36 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.819816 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0802  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  35.58 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3483  NUDIX hydrolase  34.84 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.142952  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>