275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4209 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4209  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 212 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.146155  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1775  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  77.36 
 
 		 212 aa  316  1e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.515825  normal  0.0632378 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3529  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  75.47 
 
 		 212 aa  302  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.373019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3722  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  65.99 
 
 		 214 aa  267  8e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2637  NUDIX hydrolase  48.28 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1377  NUDIX hydrolase  39.67 
 
 		 196 aa  116  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.340086  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3618  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  35.57 
 
 		 211 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5700  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  39.2 
 
 		 205 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65710  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  39.2 
 
 		 205 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3224  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  35.12 
 
 		 207 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000886574  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4973  mutT/nudix family protein  35.39 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0547  hypothetical protein  37.3 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0608  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 		 199 aa  105  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0754  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  36.87 
 
 		 203 aa  105  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0370949  hitchhiker  0.0055541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0726  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  36.46 
 
 		 203 aa  104  8e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0027035  hitchhiker  0.000778949 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3776  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  33.51 
 
 		 211 aa  104  9e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0769  ADP-ribose diphosphatase  35.36 
 
 		 200 aa  104  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44580  nudix hydrolase, YffH family  38.33 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.286548  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3235  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  35.91 
 
 		 203 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00707793  hitchhiker  0.00000215101 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3903  MutT/nudix family protein  36.46 
 
 		 200 aa  102  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2556  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  37.14 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4919  NUDIX hydrolase  36.56 
 
 		 209 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1063  ADP-ribose diphosphatase  35.8 
 
 		 194 aa  101  8e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0663  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  32.82 
 
 		 209 aa  101  9e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.16672  normal  0.0141721 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4795  NUDIX hydrolase  36.56 
 
 		 205 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3212  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  32.82 
 
 		 209 aa  101  9e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00741682  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02906  ADP-ribose pyrophosphatase  32.82 
 
 		 209 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0666  ADP-ribose diphosphatase  32.82 
 
 		 209 aa  101  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3329  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  32.82 
 
 		 209 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.746955 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3498  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  32.82 
 
 		 209 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0634708  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02856  hypothetical protein  32.82 
 
 		 209 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0027  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4348  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  32.82 
 
 		 209 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3467  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  32.31 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0321029  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4267  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  34.01 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839672 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4194  ADP-ribose diphosphatase  33.7 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.105257  hitchhiker  0.00339235 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3359  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  34.03 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0950071 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3558  NUDIX hydrolase  34.01 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.324606  normal  0.411557 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1477  hypothetical protein  39.35 
 
 		 200 aa  99  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0782  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 200 aa  99.4  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000245239  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0814  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 200 aa  99  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00725628  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0807  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 200 aa  99  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000627891  hitchhiker  0.0000000000549987 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3577  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 200 aa  99  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368158  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0495  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  37.74 
 
 		 205 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2991  NUDIX hydrolase  32.98 
 
 		 204 aa  97.8  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0315  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  32.82 
 
 		 210 aa  97.8  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4972  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 205 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3331  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  31.58 
 
 		 208 aa  98.2  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0444683  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2674  ADP-ribose pyrophosphatase  33.67 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4711  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.754787 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0431  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  32.16 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000737623  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3447  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  33.16 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0775  ADP-ribose diphosphatase  34.42 
 
 		 204 aa  96.3  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000156265  unclonable  0.0000000000726693 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3047  ADP-ribose diphosphatase  32.63 
 
 		 204 aa  95.9  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000114185  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3538  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  30.46 
 
 		 210 aa  95.5  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004521  ADP-ribose pyrophosphatase  32.16 
 
 		 216 aa  95.1  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000302738  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0804  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 		 206 aa  94.7  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3366  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  30.46 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3443  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  30.46 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3436  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  30.46 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3371  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  30.46 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.337716 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4180  ADP-ribose pyrophosphatase  33.33 
 
 		 214 aa  93.2  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00870  hypothetical protein  31.61 
 
 		 216 aa  91.3  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1092  NUDIX hydrolase  35.67 
 
 		 196 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0217104  hitchhiker  0.00264715 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0324  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  34.02 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000684842  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1525  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  42.95 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.411844  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1355  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  35.85 
 
 		 201 aa  89.4  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.127377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0545  ADP-ribose diphosphatase  33.7 
 
 		 202 aa  89.7  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0655  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  32.21 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.348636  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0283  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  32.21 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0574  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  32.21 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2012  MutT/nudix family protein  30.46 
 
 		 208 aa  86.7  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000517661  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1238  NUDIX hydrolase  31.77 
 
 		 197 aa  85.1  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0804984  hitchhiker  0.0000559773 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0580  ADP-ribose diphosphatase  30.3 
 
 		 206 aa  85.1  7e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0790  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 		 198 aa  84.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14892  normal  0.428027 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03689  ADP-ribose pyrophosphatase  29.28 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000876457  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3562  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0820  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 		 361 aa  82  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.397397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2146  tellurite resistance protein  36.76 
 
 		 361 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0105  NUDIX hydrolase  31.49 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0818  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 		 362 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3265  NUDIX hydrolase  28.65 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2384  hypothetical protein  33.33 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.227212  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1763  hypothetical protein  27.89 
 
 		 198 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00769782  normal  0.0120574 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1358  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  32.16 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0862  NUDIX hydrolase  31.38 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102995  normal  0.491513 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0370  ADP-ribose pyrophosphatase  29.32 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2255  NUDIX hydrolase  30.6 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2220  NUDIX hydrolase  26.52 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0391514  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0971  NUDIX hydrolase  26.98 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.820775  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3294  NUDIX hydrolase  27.13 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.389654  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0324  NUDIX hydrolase  31.66 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0106053  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3483  NUDIX hydrolase  26.7 
 
 		 191 aa  74.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.142952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4842  NUDIX hydrolase  34.36 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0735  NUDIX hydrolase  26.98 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5997  NUDIX hydrolase  38.3 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1164  hypothetical protein  29.45 
 
 		 195 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0273  hypothetical protein  29.45 
 
 		 195 aa  72  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2947  NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes  29.45 
 
 		 195 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.78552  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2793  NUDIX family hydrolase  29.45 
 
 		 195 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>