280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3529 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3529  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  100 
 
 		 212 aa  417  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.373019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1775  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  80.19 
 
 		 212 aa  332  2e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.515825  normal  0.0632378 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4209  NUDIX hydrolase  75.47 
 
 		 212 aa  321  6e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.146155  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3722  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  63.55 
 
 		 214 aa  266  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2637  NUDIX hydrolase  49 
 
 		 217 aa  182  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02906  ADP-ribose pyrophosphatase  38.54 
 
 		 209 aa  118  6e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0666  ADP-ribose diphosphatase  38.54 
 
 		 209 aa  118  6e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02856  hypothetical protein  38.54 
 
 		 209 aa  118  6e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3329  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  38.54 
 
 		 209 aa  118  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.746955 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3467  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  38.54 
 
 		 209 aa  118  6e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0321029  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4348  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  38.54 
 
 		 209 aa  118  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3498  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  38.54 
 
 		 209 aa  118  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0634708  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0663  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  38.54 
 
 		 209 aa  118  7e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.16672  normal  0.0141721 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3212  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  38.54 
 
 		 209 aa  118  7e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00741682  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3359  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  38.22 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0950071 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1377  NUDIX hydrolase  39.78 
 
 		 196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.340086  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3447  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  37.24 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3903  MutT/nudix family protein  34.54 
 
 		 200 aa  108  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3618  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  36.6 
 
 		 211 aa  108  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3443  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  35.35 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3366  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  35.35 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3436  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  35.35 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3371  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  35.35 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.337716 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3538  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  35.35 
 
 		 210 aa  107  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3047  ADP-ribose diphosphatase  36.36 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000114185  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4267  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  35.57 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839672 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3776  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  35.05 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0726  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  33.85 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0027035  hitchhiker  0.000778949 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0769  ADP-ribose diphosphatase  34.02 
 
 		 200 aa  104  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3235  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  34.69 
 
 		 203 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00707793  hitchhiker  0.00000215101 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0754  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  33.85 
 
 		 203 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0370949  hitchhiker  0.0055541 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65710  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  35.32 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5700  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  35.32 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4194  ADP-ribose diphosphatase  33.68 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.105257  hitchhiker  0.00339235 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3224  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  33.68 
 
 		 207 aa  99.4  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000886574  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0782  NUDIX hydrolase  31.96 
 
 		 200 aa  99.4  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000245239  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0807  NUDIX hydrolase  31.96 
 
 		 200 aa  99  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000627891  hitchhiker  0.0000000000549987 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0814  NUDIX hydrolase  31.96 
 
 		 200 aa  99  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00725628  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3577  NUDIX hydrolase  31.96 
 
 		 200 aa  99  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368158  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2991  NUDIX hydrolase  35.08 
 
 		 204 aa  98.6  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1477  hypothetical protein  39.51 
 
 		 200 aa  98.2  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0580  ADP-ribose diphosphatase  33.67 
 
 		 206 aa  98.2  8e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44580  nudix hydrolase, YffH family  36.61 
 
 		 205 aa  98.2  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.286548  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0545  ADP-ribose diphosphatase  33.51 
 
 		 202 aa  97.1  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0608  NUDIX hydrolase  34.18 
 
 		 199 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0315  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  32.47 
 
 		 210 aa  94.7  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1063  ADP-ribose diphosphatase  35.23 
 
 		 194 aa  94.7  9e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0283  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  36.73 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0574  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  36.73 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3331  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  31.98 
 
 		 208 aa  94  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0444683  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0655  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  36.73 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.348636  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0775  ADP-ribose diphosphatase  32.63 
 
 		 204 aa  94.7  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000156265  unclonable  0.0000000000726693 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0547  hypothetical protein  34.59 
 
 		 215 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2255  NUDIX hydrolase  34.95 
 
 		 198 aa  90.5  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3558  NUDIX hydrolase  31.44 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.324606  normal  0.411557 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0790  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 		 198 aa  90.5  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14892  normal  0.428027 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4973  mutT/nudix family protein  31.52 
 
 		 205 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0431  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  30.69 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000737623  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2012  MutT/nudix family protein  31.16 
 
 		 208 aa  89.7  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000517661  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4919  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 209 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4795  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 205 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0804  NUDIX hydrolase  35.23 
 
 		 206 aa  88.6  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0495  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  33.16 
 
 		 205 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1525  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  39.74 
 
 		 210 aa  88.2  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.411844  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004521  ADP-ribose pyrophosphatase  31.47 
 
 		 216 aa  88.2  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000302738  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4180  ADP-ribose pyrophosphatase  33.69 
 
 		 214 aa  87.4  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0862  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 193 aa  87.8  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102995  normal  0.491513 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1092  NUDIX hydrolase  35.03 
 
 		 196 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0217104  hitchhiker  0.00264715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4972  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00870  hypothetical protein  32.46 
 
 		 216 aa  87.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03689  ADP-ribose pyrophosphatase  30.17 
 
 		 188 aa  87.8  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000876457  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3562  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 		 203 aa  86.7  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4711  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 		 205 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.754787 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1238  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 		 197 aa  85.9  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0804984  hitchhiker  0.0000559773 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1355  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  36.2 
 
 		 201 aa  85.5  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.127377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2674  ADP-ribose pyrophosphatase  32.65 
 
 		 215 aa  85.5  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0027  NUDIX hydrolase  33 
 
 		 213 aa  85.1  7e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2556  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  33.7 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0324  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  34.02 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000684842  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0105  NUDIX hydrolase  33.52 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0370  ADP-ribose pyrophosphatase  30.05 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1164  hypothetical protein  31.9 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0273  hypothetical protein  31.9 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2947  NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes  31.9 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.78552  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2793  NUDIX family hydrolase  31.9 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3483  NUDIX hydrolase  28.04 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.142952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3294  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.389654  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0463  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  34.13 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0942  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  34.13 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0904  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.682548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0621  hypothetical protein  35.15 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01200  protein containing C-terminal region of TrgB protein  32.98 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3265  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0802  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  34.97 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1763  hypothetical protein  29.7 
 
 		 198 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00769782  normal  0.0120574 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2384  hypothetical protein  32.18 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.227212  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 180 aa  74.3  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 180 aa  74.3  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3936  NUDIX hydrolase  26.88 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2962  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.510189 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>