More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0105 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0105  NUDIX hydrolase  100 
 
 
201 aa  409  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1092  NUDIX hydrolase  39.58 
 
 
196 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0217104  hitchhiker  0.00264715 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1238  NUDIX hydrolase  38.97 
 
 
197 aa  131  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0804984  hitchhiker  0.0000559773 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3331  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  36.65 
 
 
208 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0444683  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0027  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 
213 aa  129  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0608  NUDIX hydrolase  37.44 
 
 
199 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1063  ADP-ribose diphosphatase  39.89 
 
 
194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0547  hypothetical protein  37.97 
 
 
215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1355  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  37.76 
 
 
201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.127377  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2012  MutT/nudix family protein  35.83 
 
 
208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000517661  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3047  ADP-ribose diphosphatase  38.22 
 
 
204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000114185  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0495  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  37.31 
 
 
205 aa  125  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4973  mutT/nudix family protein  36.98 
 
 
205 aa  124  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004521  ADP-ribose pyrophosphatase  34.02 
 
 
216 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000302738  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0431  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  34.03 
 
 
206 aa  123  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000737623  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3359  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  36.79 
 
 
206 aa  121  6e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0950071 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44580  nudix hydrolase, YffH family  35.38 
 
 
205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.286548  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5700  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  37.44 
 
 
205 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65710  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  37.44 
 
 
205 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0804  NUDIX hydrolase  38.19 
 
 
206 aa  119  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00870  hypothetical protein  32.99 
 
 
216 aa  118  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1566  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  37.7 
 
 
194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4950  NUDIX hydrolase  36.9 
 
 
195 aa  116  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17081  normal  0.0998667 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3483  NUDIX hydrolase  37.91 
 
 
191 aa  116  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.142952  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0580  ADP-ribose diphosphatase  34.36 
 
 
206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4267  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  34.69 
 
 
210 aa  115  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00839672 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3618  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  35.29 
 
 
211 aa  115  6e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1992  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  36.9 
 
 
375 aa  114  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3538  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  34.54 
 
 
210 aa  114  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129822  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3447  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  35.38 
 
 
210 aa  114  7.999999999999999e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4919  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4711  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 
205 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.754787 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4795  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02906  ADP-ribose pyrophosphatase  34.18 
 
 
209 aa  112  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0666  ADP-ribose diphosphatase  34.18 
 
 
209 aa  112  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3443  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  34.02 
 
 
210 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3366  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  34.02 
 
 
210 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3371  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  34.02 
 
 
210 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.337716 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4348  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  34.18 
 
 
209 aa  112  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3329  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  34.18 
 
 
209 aa  112  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.746955 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3562  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 
203 aa  112  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02856  hypothetical protein  34.18 
 
 
209 aa  112  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3498  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  34.18 
 
 
209 aa  112  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0634708  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3212  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  34.18 
 
 
209 aa  112  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00741682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0663  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  34.18 
 
 
209 aa  112  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.16672  normal  0.0141721 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3436  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  34.02 
 
 
210 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4972  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
205 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0315  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  32.81 
 
 
210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3467  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  34.18 
 
 
209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0321029  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4180  ADP-ribose pyrophosphatase  37.78 
 
 
214 aa  112  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0775  ADP-ribose diphosphatase  34.22 
 
 
204 aa  112  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000156265  unclonable  0.0000000000726693 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3265  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
195 aa  112  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1477  hypothetical protein  36.41 
 
 
200 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3776  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  32.29 
 
 
211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0782  NUDIX hydrolase  32.46 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000245239  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0621  hypothetical protein  35.83 
 
 
224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2674  ADP-ribose pyrophosphatase  31.44 
 
 
215 aa  109  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0790  NUDIX hydrolase  33.69 
 
 
198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14892  normal  0.428027 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4194  ADP-ribose diphosphatase  32.12 
 
 
200 aa  109  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.105257  hitchhiker  0.00339235 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0814  NUDIX hydrolase  31.94 
 
 
200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00725628  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3224  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  32.12 
 
 
207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000886574  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0807  NUDIX hydrolase  31.94 
 
 
200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000627891  hitchhiker  0.0000000000549987 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3577  NUDIX hydrolase  31.94 
 
 
200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368158  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0370  ADP-ribose pyrophosphatase  34.52 
 
 
205 aa  108  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3903  MutT/nudix family protein  31.94 
 
 
200 aa  107  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3235  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  32.46 
 
 
203 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00707793  hitchhiker  0.00000215101 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0574  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  35.57 
 
 
210 aa  106  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3294  NUDIX hydrolase  34.22 
 
 
194 aa  106  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.389654  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2220  NUDIX hydrolase  32.42 
 
 
194 aa  106  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0391514  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3936  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 
195 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0283  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  35.57 
 
 
210 aa  106  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0754  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  31.94 
 
 
203 aa  106  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0370949  hitchhiker  0.0055541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0726  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  31.94 
 
 
203 aa  106  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0027035  hitchhiker  0.000778949 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0655  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  35.57 
 
 
210 aa  106  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.348636  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2315  NUDIX hydrolase  34.44 
 
 
378 aa  106  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0769  ADP-ribose diphosphatase  31.94 
 
 
200 aa  105  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0545  ADP-ribose diphosphatase  32.12 
 
 
202 aa  105  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1377  NUDIX hydrolase  36.7 
 
 
196 aa  105  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.340086  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2637  NUDIX hydrolase  41.14 
 
 
217 aa  105  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1763  hypothetical protein  34.04 
 
 
198 aa  104  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00769782  normal  0.0120574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6151  NUDIX hydrolase  31.38 
 
 
193 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.389113  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03689  ADP-ribose pyrophosphatase  30.56 
 
 
188 aa  102  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000876457  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3214  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
191 aa  102  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.157336  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0735  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 
193 aa  102  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2556  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  34.92 
 
 
209 aa  101  9e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0324  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  32.81 
 
 
210 aa  99.4  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000684842  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2291  NUDIX hydrolase  33.51 
 
 
201 aa  99  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.259047  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1170  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 
193 aa  99  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2384  hypothetical protein  36.42 
 
 
193 aa  99  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.227212  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2991  NUDIX hydrolase  33.16 
 
 
204 aa  99  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0971  NUDIX hydrolase  33.52 
 
 
193 aa  98.6  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.820775  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3688  hydrolase, NUDIX family  29.41 
 
 
191 aa  98.6  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02358  predicted NUDIX hydrolase  29.89 
 
 
191 aa  97.8  8e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1203  NUDIX hydrolase  29.89 
 
 
191 aa  97.8  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02320  hypothetical protein  29.89 
 
 
191 aa  97.8  8e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2596  NUDIX family hydrolase  29.89 
 
 
191 aa  97.8  8e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1210  NUDIX hydrolase  29.89 
 
 
191 aa  97.8  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2835  hydrolase, NUDIX family  29.89 
 
 
191 aa  98.2  8e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2746  NUDIX family hydrolase  29.89 
 
 
191 aa  98.2  8e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2793  NUDIX family hydrolase  32.62 
 
 
195 aa  97.8  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>