293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0315 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_0315  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  100 
 
 
210 aa  425  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0324  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  95.69 
 
 
210 aa  383  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000684842  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3776  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  87.14 
 
 
211 aa  372  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3618  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  86.19 
 
 
211 aa  368  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4267  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  76.19 
 
 
210 aa  333  7.999999999999999e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00839672 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3436  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  77.4 
 
 
210 aa  333  9e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3443  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  77.4 
 
 
210 aa  333  9e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3366  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  77.4 
 
 
210 aa  333  9e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3371  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  77.4 
 
 
210 aa  333  9e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.337716 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3538  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  77.4 
 
 
210 aa  332  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129822  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3447  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  77.11 
 
 
210 aa  331  5e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0663  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  77.4 
 
 
209 aa  328  3e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.16672  normal  0.0141721 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3212  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  77.4 
 
 
209 aa  328  3e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00741682  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02906  ADP-ribose pyrophosphatase  79.1 
 
 
209 aa  328  4e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0666  ADP-ribose diphosphatase  79.1 
 
 
209 aa  328  4e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3329  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  79.1 
 
 
209 aa  328  4e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.746955 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02856  hypothetical protein  79.1 
 
 
209 aa  328  4e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4348  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  79.1 
 
 
209 aa  328  4e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3498  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  79.1 
 
 
209 aa  328  4e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0634708  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3467  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  78.61 
 
 
209 aa  327  8e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0321029  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0655  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  76.92 
 
 
210 aa  316  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.348636  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0574  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  76.92 
 
 
210 aa  316  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0283  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  76.92 
 
 
210 aa  316  2e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00870  hypothetical protein  61.11 
 
 
216 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004521  ADP-ribose pyrophosphatase  59.6 
 
 
216 aa  246  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000302738  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3331  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  60 
 
 
208 aa  247  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0444683  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0775  ADP-ribose diphosphatase  56.7 
 
 
204 aa  246  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000156265  unclonable  0.0000000000726693 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3047  ADP-ribose diphosphatase  58.88 
 
 
204 aa  241  5e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000114185  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3562  NUDIX hydrolase  56.35 
 
 
203 aa  237  8e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2012  MutT/nudix family protein  54.81 
 
 
208 aa  237  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000517661  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0580  ADP-ribose diphosphatase  54.23 
 
 
206 aa  236  3e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4194  ADP-ribose diphosphatase  53.57 
 
 
200 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.105257  hitchhiker  0.00339235 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3359  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  54.55 
 
 
206 aa  232  3e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0950071 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0545  ADP-ribose diphosphatase  54.82 
 
 
202 aa  230  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0431  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  53.54 
 
 
206 aa  229  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000737623  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0726  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  53.27 
 
 
203 aa  228  5e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0027035  hitchhiker  0.000778949 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3235  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  54.27 
 
 
203 aa  228  6e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00707793  hitchhiker  0.00000215101 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0782  NUDIX hydrolase  53.81 
 
 
200 aa  227  8e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000245239  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0807  NUDIX hydrolase  53.81 
 
 
200 aa  227  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000627891  hitchhiker  0.0000000000549987 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0814  NUDIX hydrolase  53.81 
 
 
200 aa  227  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00725628  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3577  NUDIX hydrolase  53.81 
 
 
200 aa  227  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368158  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0754  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  53.77 
 
 
203 aa  226  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0370949  hitchhiker  0.0055541 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3903  MutT/nudix family protein  53.3 
 
 
200 aa  222  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3224  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  55.21 
 
 
207 aa  221  4.9999999999999996e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000886574  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0769  ADP-ribose diphosphatase  54.82 
 
 
200 aa  221  4.9999999999999996e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2674  ADP-ribose pyrophosphatase  52.17 
 
 
215 aa  220  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03689  ADP-ribose pyrophosphatase  52.43 
 
 
188 aa  213  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000876457  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0608  NUDIX hydrolase  51.53 
 
 
199 aa  206  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1355  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  52.06 
 
 
201 aa  202  4e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.127377  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44580  nudix hydrolase, YffH family  51.79 
 
 
205 aa  200  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.286548  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4919  NUDIX hydrolase  48.08 
 
 
209 aa  198  6e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0495  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  51.81 
 
 
205 aa  197  7e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4795  NUDIX hydrolase  50.52 
 
 
205 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4972  NUDIX hydrolase  50.52 
 
 
205 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4711  NUDIX hydrolase  50 
 
 
205 aa  194  9e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.754787 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5700  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  53.61 
 
 
205 aa  191  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65710  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  53.61 
 
 
205 aa  191  6e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0547  hypothetical protein  47.09 
 
 
215 aa  191  7e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1377  NUDIX hydrolase  49.48 
 
 
196 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.340086  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4973  mutT/nudix family protein  47.4 
 
 
205 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1063  ADP-ribose diphosphatase  50.54 
 
 
194 aa  187  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3558  NUDIX hydrolase  43.56 
 
 
206 aa  179  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.324606  normal  0.411557 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0804  NUDIX hydrolase  47.26 
 
 
206 aa  179  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0027  NUDIX hydrolase  46.91 
 
 
213 aa  179  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4180  ADP-ribose pyrophosphatase  43.13 
 
 
214 aa  173  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0370  ADP-ribose pyrophosphatase  39.09 
 
 
205 aa  167  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2556  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  45.74 
 
 
209 aa  167  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2991  NUDIX hydrolase  41.62 
 
 
204 aa  158  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1477  hypothetical protein  43.81 
 
 
200 aa  154  7e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1525  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  41.97 
 
 
210 aa  149  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.411844  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0818  NUDIX hydrolase  38.38 
 
 
362 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130315  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0820  NUDIX hydrolase  39.18 
 
 
361 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.397397  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2146  tellurite resistance protein  39.18 
 
 
361 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1992  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  37.19 
 
 
375 aa  135  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1358  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  39.68 
 
 
202 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2315  NUDIX hydrolase  38.27 
 
 
378 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3860  NUDIX hydrolase  37.13 
 
 
368 aa  116  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0105  NUDIX hydrolase  33.69 
 
 
201 aa  112  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0790  NUDIX hydrolase  33.16 
 
 
198 aa  105  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14892  normal  0.428027 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1092  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
196 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0217104  hitchhiker  0.00264715 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3722  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  35 
 
 
214 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1775  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  35.6 
 
 
212 aa  98.6  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.515825  normal  0.0632378 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1238  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 
197 aa  97.8  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0804984  hitchhiker  0.0000559773 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4209  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 
212 aa  97.8  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.146155  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1566  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  29.32 
 
 
194 aa  94.4  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4950  NUDIX hydrolase  33.16 
 
 
195 aa  92  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17081  normal  0.0998667 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3483  NUDIX hydrolase  31.91 
 
 
191 aa  90.5  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.142952  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3265  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 
195 aa  89  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3294  NUDIX hydrolase  30.96 
 
 
194 aa  88.2  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.389654  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0862  NUDIX hydrolase  30.32 
 
 
193 aa  87.8  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102995  normal  0.491513 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2255  NUDIX hydrolase  31.22 
 
 
198 aa  86.7  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2637  NUDIX hydrolase  31.94 
 
 
217 aa  85.5  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3332  NUDIX hydrolase  30.39 
 
 
202 aa  85.1  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0735  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 
193 aa  84.7  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0802  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  30.96 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5218  NUDIX hydrolase  30.9 
 
 
195 aa  82.8  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253692  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2220  NUDIX hydrolase  27.72 
 
 
194 aa  82.4  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0391514  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0904  NUDIX hydrolase  31.31 
 
 
199 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.682548 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0463  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  31.31 
 
 
199 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0942  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  31.31 
 
 
199 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>