More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0790 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0790  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 198 aa  403  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14892  normal  0.428027 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1092  NUDIX hydrolase  54.5 
 
 		 196 aa  201  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0217104  hitchhiker  0.00264715 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1238  NUDIX hydrolase  54.74 
 
 		 197 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0804984  hitchhiker  0.0000559773 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3265  NUDIX hydrolase  51.89 
 
 		 195 aa  193  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4950  NUDIX hydrolase  51.83 
 
 		 195 aa  192  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17081  normal  0.0998667 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0621  hypothetical protein  50.53 
 
 		 224 aa  187  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1566  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  47.8 
 
 		 194 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3332  NUDIX hydrolase  51.35 
 
 		 202 aa  182  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0904  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 199 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.682548 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0463  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  50 
 
 		 199 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0942  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  50 
 
 		 199 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3936  NUDIX hydrolase  47.87 
 
 		 195 aa  178  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2191  NUDIX hydrolase  47.89 
 
 		 199 aa  177  8e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1763  hypothetical protein  48.44 
 
 		 198 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00769782  normal  0.0120574 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4044  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  49.47 
 
 		 199 aa  174  8e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0802  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  48.13 
 
 		 201 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6151  NUDIX hydrolase  46.91 
 
 		 193 aa  171  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.389113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2255  NUDIX hydrolase  47.83 
 
 		 198 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0971  NUDIX hydrolase  50.82 
 
 		 193 aa  169  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.820775  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3294  NUDIX hydrolase  49.18 
 
 		 194 aa  169  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.389654  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3567  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  51.31 
 
 		 196 aa  169  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2291  NUDIX hydrolase  46.84 
 
 		 201 aa  169  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.259047  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2220  NUDIX hydrolase  46.52 
 
 		 194 aa  169  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0391514  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3674  NUDIX hydrolase  47.31 
 
 		 199 aa  169  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.569185 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1170  NUDIX hydrolase  46.74 
 
 		 193 aa  167  7e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2260  NUDIX hydrolase  48.42 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.229118  hitchhiker  0.000399165 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0735  NUDIX hydrolase  48.9 
 
 		 193 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2793  NUDIX family hydrolase  46.81 
 
 		 195 aa  164  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1164  hypothetical protein  46.81 
 
 		 195 aa  164  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0273  hypothetical protein  46.81 
 
 		 195 aa  164  8e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2947  NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes  46.81 
 
 		 195 aa  164  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.78552  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0324  NUDIX hydrolase  47.62 
 
 		 209 aa  164  9e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0106053  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3214  NUDIX hydrolase  50.28 
 
 		 191 aa  160  8.000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.157336  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5088  NUDIX hydrolase  44.32 
 
 		 200 aa  160  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2613  NUDIX family hydrolase  46.37 
 
 		 191 aa  158  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.819816 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2384  hypothetical protein  46.74 
 
 		 193 aa  158  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.227212  normal  0.506207 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02358  predicted NUDIX hydrolase  45.81 
 
 		 191 aa  158  6e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1203  NUDIX hydrolase  45.81 
 
 		 191 aa  158  6e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02320  hypothetical protein  45.81 
 
 		 191 aa  158  6e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2596  NUDIX family hydrolase  45.81 
 
 		 191 aa  158  6e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1210  NUDIX hydrolase  45.81 
 
 		 191 aa  158  6e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3688  hydrolase, NUDIX family  44.57 
 
 		 191 aa  157  7e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2835  hydrolase, NUDIX family  45.81 
 
 		 191 aa  157  9e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2746  NUDIX family hydrolase  45.81 
 
 		 191 aa  157  9e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0862  NUDIX hydrolase  45.65 
 
 		 193 aa  157  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102995  normal  0.491513 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3483  NUDIX hydrolase  44.81 
 
 		 191 aa  156  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.142952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2962  NUDIX hydrolase  45.16 
 
 		 191 aa  155  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.510189 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4842  NUDIX hydrolase  45.95 
 
 		 195 aa  153  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0740  NUDIX hydrolase  43.94 
 
 		 196 aa  152  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01200  protein containing C-terminal region of TrgB protein  46.28 
 
 		 236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2621  putative hydrolase YffH  43.02 
 
 		 191 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2843  putative hydrolase YffH  43.02 
 
 		 191 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2710  putative hydrolase YffH  43.02 
 
 		 191 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2670  putative hydrolase YffH  43.02 
 
 		 191 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2736  putative hydrolase YffH  42.46 
 
 		 191 aa  144  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.738659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2697  NUDIX hydrolase  43.16 
 
 		 335 aa  143  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2787  NUDIX family hydrolase  40.66 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0175603 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1276  NUDIX family hydrolase  40.66 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1390  NUDIX hydrolase  40.66 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.136474  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0219  hypothetical protein  41.57 
 
 		 192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.170349  normal  0.191205 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3473  NUDIX hydrolase  43.43 
 
 		 201 aa  125  6e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.672777  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3447  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  39.15 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7290  NUDIX hydrolase  38.62 
 
 		 204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5388  NUDIX hydrolase  40.64 
 
 		 191 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5441  NUDIX hydrolase  39.11 
 
 		 191 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.391972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3331  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  36.22 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0444683  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0769  ADP-ribose diphosphatase  37.5 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3212  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  37.17 
 
 		 209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00741682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0663  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  37.17 
 
 		 209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.16672  normal  0.0141721 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02906  ADP-ribose pyrophosphatase  37.17 
 
 		 209 aa  112  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0666  ADP-ribose diphosphatase  37.17 
 
 		 209 aa  112  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3498  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  37.17 
 
 		 209 aa  112  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0634708  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3329  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  37.17 
 
 		 209 aa  112  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.746955 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02856  hypothetical protein  37.17 
 
 		 209 aa  112  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4348  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  37.17 
 
 		 209 aa  112  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0775  ADP-ribose diphosphatase  35.26 
 
 		 204 aa  111  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000156265  unclonable  0.0000000000726693 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3467  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  37.17 
 
 		 209 aa  111  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0321029  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2991  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 		 204 aa  111  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3436  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  37 
 
 		 210 aa  111  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3371  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  37 
 
 		 210 aa  111  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.337716 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44580  nudix hydrolase, YffH family  37.97 
 
 		 205 aa  111  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.286548  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3366  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  37 
 
 		 210 aa  111  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3443  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  37 
 
 		 210 aa  111  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0726  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  36.98 
 
 		 203 aa  110  9e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0027035  hitchhiker  0.000778949 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3538  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  36.18 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129822  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4919  NUDIX hydrolase  37.37 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0832  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.341274  normal  0.656048 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4972  NUDIX hydrolase  36.87 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0545  ADP-ribose diphosphatase  36.87 
 
 		 202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3235  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  36.13 
 
 		 203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00707793  hitchhiker  0.00000215101 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0864  NUDIX hydrolase  38.69 
 
 		 188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426746  normal  0.334935 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3359  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  34.74 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0950071 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4795  NUDIX hydrolase  37.37 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3903  MutT/nudix family protein  37.04 
 
 		 200 aa  109  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0782  NUDIX hydrolase  35.98 
 
 		 200 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000245239  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4711  NUDIX hydrolase  36.87 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.754787 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0814  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 		 200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00725628  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0807  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 		 200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000627891  hitchhiker  0.0000000000549987 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3577  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 		 200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368158  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0754  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  36.13 
 
 		 203 aa  108  6e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0370949  hitchhiker  0.0055541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>