More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2697 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2697  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 335 aa  665    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0621  hypothetical protein  66.82 
 
 		 224 aa  286  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01200  protein containing C-terminal region of TrgB protein  60.54 
 
 		 236 aa  249  4e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1763  hypothetical protein  53.44 
 
 		 198 aa  208  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00769782  normal  0.0120574 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1164  hypothetical protein  52.63 
 
 		 195 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0273  hypothetical protein  52.63 
 
 		 195 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2947  NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes  52.63 
 
 		 195 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.78552  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2793  NUDIX family hydrolase  52.63 
 
 		 195 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3332  NUDIX hydrolase  54.3 
 
 		 202 aa  198  9e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2260  NUDIX hydrolase  55.61 
 
 		 198 aa  193  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.229118  hitchhiker  0.000399165 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2191  NUDIX hydrolase  51.61 
 
 		 199 aa  193  5e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4950  NUDIX hydrolase  55.38 
 
 		 195 aa  192  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17081  normal  0.0998667 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3265  NUDIX hydrolase  52.36 
 
 		 195 aa  192  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4842  NUDIX hydrolase  55.91 
 
 		 195 aa  191  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5088  NUDIX hydrolase  54.84 
 
 		 200 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3936  NUDIX hydrolase  48.42 
 
 		 195 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0802  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  53.44 
 
 		 201 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0904  NUDIX hydrolase  53.23 
 
 		 199 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.682548 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0463  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  53.23 
 
 		 199 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0942  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  53.23 
 
 		 199 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4044  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  53.23 
 
 		 199 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2291  NUDIX hydrolase  51.34 
 
 		 201 aa  183  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.259047  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1170  NUDIX hydrolase  47.87 
 
 		 193 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0735  NUDIX hydrolase  52.15 
 
 		 193 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2220  NUDIX hydrolase  46.88 
 
 		 194 aa  179  5.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0391514  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6151  NUDIX hydrolase  46.07 
 
 		 193 aa  178  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.389113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3294  NUDIX hydrolase  47.4 
 
 		 194 aa  177  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.389654  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0971  NUDIX hydrolase  51.09 
 
 		 193 aa  176  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.820775  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0740  NUDIX hydrolase  45.03 
 
 		 196 aa  171  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3674  NUDIX hydrolase  47.96 
 
 		 199 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.569185 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3483  NUDIX hydrolase  51.12 
 
 		 191 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.142952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3214  NUDIX hydrolase  46.56 
 
 		 191 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.157336  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02358  predicted NUDIX hydrolase  48.62 
 
 		 191 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1203  NUDIX hydrolase  48.62 
 
 		 191 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2736  putative hydrolase YffH  48.62 
 
 		 191 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.738659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2596  NUDIX family hydrolase  48.62 
 
 		 191 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1210  NUDIX hydrolase  48.62 
 
 		 191 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02320  hypothetical protein  48.62 
 
 		 191 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3567  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  48.95 
 
 		 196 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3688  hydrolase, NUDIX family  47.28 
 
 		 191 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2962  NUDIX hydrolase  45.16 
 
 		 191 aa  164  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.510189 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2835  hydrolase, NUDIX family  48.07 
 
 		 191 aa  163  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2746  NUDIX family hydrolase  48.07 
 
 		 191 aa  163  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2710  putative hydrolase YffH  48.07 
 
 		 191 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2621  putative hydrolase YffH  48.07 
 
 		 191 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2843  putative hydrolase YffH  48.07 
 
 		 191 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2670  putative hydrolase YffH  48.07 
 
 		 191 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2613  NUDIX family hydrolase  48.07 
 
 		 191 aa  162  6e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.819816 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2384  hypothetical protein  46.03 
 
 		 193 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.227212  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0324  NUDIX hydrolase  47.59 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0106053  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2787  NUDIX family hydrolase  47.12 
 
 		 198 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0175603 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1390  NUDIX hydrolase  47.12 
 
 		 198 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.136474  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1276  NUDIX family hydrolase  47.12 
 
 		 198 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0790  NUDIX hydrolase  43.16 
 
 		 198 aa  143  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14892  normal  0.428027 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3473  NUDIX hydrolase  46.7 
 
 		 201 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.672777  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2255  NUDIX hydrolase  44.15 
 
 		 198 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1566  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  42.19 
 
 		 194 aa  139  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1092  NUDIX hydrolase  42.93 
 
 		 196 aa  135  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0217104  hitchhiker  0.00264715 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1238  NUDIX hydrolase  43.98 
 
 		 197 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0804984  hitchhiker  0.0000559773 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0219  hypothetical protein  37.31 
 
 		 192 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.170349  normal  0.191205 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0862  NUDIX hydrolase  39.11 
 
 		 193 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102995  normal  0.491513 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3558  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 		 206 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.324606  normal  0.411557 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5218  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 		 195 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0832  NUDIX hydrolase  41.26 
 
 		 188 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.341274  normal  0.656048 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4973  mutT/nudix family protein  35.06 
 
 		 205 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3224  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  36.22 
 
 		 207 aa  90.1  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000886574  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0864  NUDIX hydrolase  40.56 
 
 		 188 aa  89.4  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426746  normal  0.334935 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0904  NUDIX hydrolase  40.56 
 
 		 188 aa  89  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0381833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0608  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3235  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  33.69 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00707793  hitchhiker  0.00000215101 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0726  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  33.16 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0027035  hitchhiker  0.000778949 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7290  NUDIX hydrolase  34.36 
 
 		 204 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0547  hypothetical protein  36.26 
 
 		 215 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2991  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 		 204 aa  81.6  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2012  MutT/nudix family protein  32.81 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000517661  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004521  ADP-ribose pyrophosphatase  31.13 
 
 		 216 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000302738  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1854  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 163 aa  81.6  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0754  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  33.69 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0370949  hitchhiker  0.0055541 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0105  NUDIX hydrolase  33.7 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0514  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0222532  hitchhiker  0.000757753 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1377  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.340086  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65710  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  37.27 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5700  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  37.27 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5388  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 		 191 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4919  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4795  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1063  ADP-ribose diphosphatase  34.97 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0431  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  33.33 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000737623  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4972  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2674  ADP-ribose pyrophosphatase  29.44 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3359  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  32.4 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0950071 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4711  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.754787 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  31.61 
 
 		 180 aa  75.5  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  31.61 
 
 		 180 aa  75.5  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4180  ADP-ribose pyrophosphatase  31.79 
 
 		 214 aa  75.1  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4267  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  34.94 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839672 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0782  NUDIX hydrolase  31.91 
 
 		 200 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000245239  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0545  ADP-ribose diphosphatase  32.81 
 
 		 202 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5997  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 		 199 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4194  ADP-ribose diphosphatase  32.98 
 
 		 200 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.105257  hitchhiker  0.00339235 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>