More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0904 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0904  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 188 aa  371  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0381833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0864  NUDIX hydrolase  98.4 
 
 		 188 aa  368  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426746  normal  0.334935 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0832  NUDIX hydrolase  93.62 
 
 		 188 aa  331  5e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.341274  normal  0.656048 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7290  NUDIX hydrolase  63.44 
 
 		 204 aa  242  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5997  NUDIX hydrolase  62.37 
 
 		 199 aa  234  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5388  NUDIX hydrolase  61.17 
 
 		 191 aa  230  9e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0688  NUDIX hydrolase  55.85 
 
 		 189 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653338  normal  0.751646 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5441  NUDIX hydrolase  54.75 
 
 		 191 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.391972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0514  NUDIX hydrolase  53.72 
 
 		 189 aa  180  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0222532  hitchhiker  0.000757753 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1238  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 		 197 aa  131  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0804984  hitchhiker  0.0000559773 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1092  NUDIX hydrolase  39.04 
 
 		 196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0217104  hitchhiker  0.00264715 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1566  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  39.53 
 
 		 194 aa  124  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0621  hypothetical protein  47.33 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2255  NUDIX hydrolase  45.64 
 
 		 198 aa  123  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1763  hypothetical protein  36.07 
 
 		 198 aa  122  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00769782  normal  0.0120574 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4950  NUDIX hydrolase  43.71 
 
 		 195 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17081  normal  0.0998667 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0802  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  41.3 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3332  NUDIX hydrolase  42.36 
 
 		 202 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2384  hypothetical protein  43.42 
 
 		 193 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.227212  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0740  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 		 196 aa  117  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1164  hypothetical protein  36.46 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0273  hypothetical protein  36.46 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6151  NUDIX hydrolase  36.02 
 
 		 193 aa  116  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.389113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2947  NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes  36.46 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.78552  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2793  NUDIX family hydrolase  36.46 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0862  NUDIX hydrolase  41.29 
 
 		 193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102995  normal  0.491513 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3674  NUDIX hydrolase  38.86 
 
 		 199 aa  115  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.569185 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2220  NUDIX hydrolase  34.41 
 
 		 194 aa  114  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0391514  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4044  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  40.88 
 
 		 199 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1170  NUDIX hydrolase  38.16 
 
 		 193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0790  NUDIX hydrolase  37.91 
 
 		 198 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14892  normal  0.428027 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0971  NUDIX hydrolase  37.22 
 
 		 193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.820775  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0463  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  42.76 
 
 		 199 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0904  NUDIX hydrolase  42.76 
 
 		 199 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.682548 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0942  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  42.76 
 
 		 199 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5088  NUDIX hydrolase  42.28 
 
 		 200 aa  111  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0735  NUDIX hydrolase  36.56 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2191  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0324  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0106053  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3936  NUDIX hydrolase  37.24 
 
 		 195 aa  108  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2291  NUDIX hydrolase  39.87 
 
 		 201 aa  107  8.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.259047  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3265  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 195 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2613  NUDIX family hydrolase  34.46 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.819816 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3688  hydrolase, NUDIX family  33.71 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2746  NUDIX family hydrolase  33.9 
 
 		 191 aa  105  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2835  hydrolase, NUDIX family  33.9 
 
 		 191 aa  105  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02358  predicted NUDIX hydrolase  33.9 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1203  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2596  NUDIX family hydrolase  33.9 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1210  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02320  hypothetical protein  33.9 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4842  NUDIX hydrolase  38.73 
 
 		 195 aa  105  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3483  NUDIX hydrolase  34.66 
 
 		 191 aa  104  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.142952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3294  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.389654  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2736  putative hydrolase YffH  35.39 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.738659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3473  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 201 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.672777  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2710  putative hydrolase YffH  34.83 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2621  putative hydrolase YffH  34.83 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2843  putative hydrolase YffH  34.83 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2991  NUDIX hydrolase  39.27 
 
 		 204 aa  101  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2670  putative hydrolase YffH  38.67 
 
 		 191 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3214  NUDIX hydrolase  34.41 
 
 		 191 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.157336  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0219  hypothetical protein  34.3 
 
 		 192 aa  99.4  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.170349  normal  0.191205 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2962  NUDIX hydrolase  32.62 
 
 		 191 aa  98.6  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.510189 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0608  NUDIX hydrolase  40.12 
 
 		 199 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3047  ADP-ribose diphosphatase  36.51 
 
 		 204 aa  94.7  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000114185  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2697  NUDIX hydrolase  40.82 
 
 		 335 aa  93.6  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01200  protein containing C-terminal region of TrgB protein  39.04 
 
 		 236 aa  93.2  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2260  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 198 aa  93.2  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.229118  hitchhiker  0.000399165 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44580  nudix hydrolase, YffH family  37.65 
 
 		 205 aa  91.3  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.286548  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5700  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  38.89 
 
 		 205 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65710  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  38.89 
 
 		 205 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4973  mutT/nudix family protein  37.74 
 
 		 205 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3567  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  40 
 
 		 196 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4919  NUDIX hydrolase  38.27 
 
 		 209 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4795  NUDIX hydrolase  38.27 
 
 		 205 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0495  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  37.11 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0782  NUDIX hydrolase  38.85 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000245239  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0814  NUDIX hydrolase  38.85 
 
 		 200 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00725628  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0807  NUDIX hydrolase  38.85 
 
 		 200 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000627891  hitchhiker  0.0000000000549987 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3577  NUDIX hydrolase  38.85 
 
 		 200 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368158  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4711  NUDIX hydrolase  38.27 
 
 		 205 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.754787 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0547  hypothetical protein  36.48 
 
 		 215 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0545  ADP-ribose diphosphatase  37.74 
 
 		 202 aa  84.7  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0431  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  34.81 
 
 		 206 aa  84.7  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000737623  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4972  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 		 205 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 178 aa  84.3  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  36.31 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5218  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  40.65 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3224  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  36.94 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000886574  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0775  ADP-ribose diphosphatase  35.03 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000156265  unclonable  0.0000000000726693 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3903  MutT/nudix family protein  37.97 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03689  ADP-ribose pyrophosphatase  35.03 
 
 		 188 aa  80.9  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000876457  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3562  NUDIX hydrolase  35.67 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1063  ADP-ribose diphosphatase  35.67 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3331  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  35.22 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0444683  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  35.36 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3235  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  36.71 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00707793  hitchhiker  0.00000215101 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>