294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3567 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3567  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  100 
 
 		 196 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4950  NUDIX hydrolase  70.77 
 
 		 195 aa  286  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17081  normal  0.0998667 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3265  NUDIX hydrolase  68.59 
 
 		 195 aa  281  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4044  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  66.15 
 
 		 199 aa  268  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2191  NUDIX hydrolase  65.26 
 
 		 199 aa  267  7e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0904  NUDIX hydrolase  65.31 
 
 		 199 aa  265  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.682548 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0463  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  65.31 
 
 		 199 aa  265  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0802  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  66.84 
 
 		 201 aa  265  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0942  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  65.31 
 
 		 199 aa  265  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3674  NUDIX hydrolase  63.27 
 
 		 199 aa  263  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.569185 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2260  NUDIX hydrolase  69.27 
 
 		 198 aa  259  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.229118  hitchhiker  0.000399165 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2291  NUDIX hydrolase  63.92 
 
 		 201 aa  258  3e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.259047  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5088  NUDIX hydrolase  61.26 
 
 		 200 aa  241  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1763  hypothetical protein  58.55 
 
 		 198 aa  240  9e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00769782  normal  0.0120574 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1164  hypothetical protein  58.55 
 
 		 195 aa  238  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0273  hypothetical protein  58.55 
 
 		 195 aa  238  5e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2947  NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes  58.55 
 
 		 195 aa  238  5e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.78552  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3332  NUDIX hydrolase  59.26 
 
 		 202 aa  238  5e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2793  NUDIX family hydrolase  58.55 
 
 		 195 aa  238  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4842  NUDIX hydrolase  60.32 
 
 		 195 aa  235  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3936  NUDIX hydrolase  59.47 
 
 		 195 aa  235  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0621  hypothetical protein  57.59 
 
 		 224 aa  229  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6151  NUDIX hydrolase  57.59 
 
 		 193 aa  229  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.389113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2384  hypothetical protein  57.98 
 
 		 193 aa  228  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.227212  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1170  NUDIX hydrolase  60.1 
 
 		 193 aa  227  8e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0740  NUDIX hydrolase  57.22 
 
 		 196 aa  224  7e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2220  NUDIX hydrolase  56.38 
 
 		 194 aa  222  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0391514  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3294  NUDIX hydrolase  58.51 
 
 		 194 aa  219  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.389654  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0971  NUDIX hydrolase  56.02 
 
 		 193 aa  216  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.820775  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0735  NUDIX hydrolase  54.4 
 
 		 193 aa  211  7.999999999999999e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0324  NUDIX hydrolase  52.91 
 
 		 209 aa  206  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0106053  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3483  NUDIX hydrolase  52.88 
 
 		 191 aa  201  6e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.142952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3214  NUDIX hydrolase  53.72 
 
 		 191 aa  200  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.157336  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2621  putative hydrolase YffH  52.36 
 
 		 191 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2962  NUDIX hydrolase  52.11 
 
 		 191 aa  196  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.510189 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2843  putative hydrolase YffH  52.36 
 
 		 191 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2710  putative hydrolase YffH  52.36 
 
 		 191 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2670  putative hydrolase YffH  52.36 
 
 		 191 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2736  putative hydrolase YffH  51.83 
 
 		 191 aa  195  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.738659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0790  NUDIX hydrolase  51.31 
 
 		 198 aa  194  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14892  normal  0.428027 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2255  NUDIX hydrolase  50.79 
 
 		 198 aa  192  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3688  hydrolase, NUDIX family  50.79 
 
 		 191 aa  192  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2613  NUDIX family hydrolase  50.79 
 
 		 191 aa  192  4e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.819816 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02358  predicted NUDIX hydrolase  50.26 
 
 		 191 aa  190  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1203  NUDIX hydrolase  50.26 
 
 		 191 aa  190  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2835  hydrolase, NUDIX family  50.26 
 
 		 191 aa  190  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2746  NUDIX family hydrolase  50.26 
 
 		 191 aa  190  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2596  NUDIX family hydrolase  50.26 
 
 		 191 aa  190  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02320  hypothetical protein  50.26 
 
 		 191 aa  190  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1210  NUDIX hydrolase  50.26 
 
 		 191 aa  190  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01200  protein containing C-terminal region of TrgB protein  51.32 
 
 		 236 aa  184  6e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1566  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  46.74 
 
 		 194 aa  181  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3473  NUDIX hydrolase  53.12 
 
 		 201 aa  181  7e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.672777  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2697  NUDIX hydrolase  49.74 
 
 		 335 aa  181  8.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1092  NUDIX hydrolase  48.17 
 
 		 196 aa  180  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0217104  hitchhiker  0.00264715 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2787  NUDIX family hydrolase  52.15 
 
 		 198 aa  179  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0175603 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1390  NUDIX hydrolase  52.15 
 
 		 198 aa  179  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.136474  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1276  NUDIX family hydrolase  52.15 
 
 		 198 aa  179  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1238  NUDIX hydrolase  47.12 
 
 		 197 aa  169  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0804984  hitchhiker  0.0000559773 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0219  hypothetical protein  43.59 
 
 		 192 aa  164  8e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.170349  normal  0.191205 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0862  NUDIX hydrolase  43.85 
 
 		 193 aa  159  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102995  normal  0.491513 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7290  NUDIX hydrolase  35.5 
 
 		 204 aa  106  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0864  NUDIX hydrolase  39.72 
 
 		 188 aa  105  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426746  normal  0.334935 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5997  NUDIX hydrolase  34.76 
 
 		 199 aa  105  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0904  NUDIX hydrolase  39.72 
 
 		 188 aa  104  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0381833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0832  NUDIX hydrolase  40.43 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.341274  normal  0.656048 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5218  NUDIX hydrolase  31.41 
 
 		 195 aa  102  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5388  NUDIX hydrolase  39.33 
 
 		 191 aa  101  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3224  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  31.25 
 
 		 207 aa  95.1  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000886574  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0431  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  29.84 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000737623  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0105  NUDIX hydrolase  29.95 
 
 		 201 aa  92.8  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4711  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 		 205 aa  92  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.754787 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4972  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 		 205 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3558  NUDIX hydrolase  30.21 
 
 		 206 aa  91.3  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.324606  normal  0.411557 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4919  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4973  mutT/nudix family protein  32.57 
 
 		 205 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4795  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0514  NUDIX hydrolase  32.9 
 
 		 189 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0222532  hitchhiker  0.000757753 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1063  ADP-ribose diphosphatase  30.56 
 
 		 194 aa  89.4  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0495  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  31.91 
 
 		 205 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3235  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  31.75 
 
 		 203 aa  89  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00707793  hitchhiker  0.00000215101 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0775  ADP-ribose diphosphatase  30.65 
 
 		 204 aa  88.2  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000156265  unclonable  0.0000000000726693 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0547  hypothetical protein  34.42 
 
 		 215 aa  87  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4267  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  31.55 
 
 		 210 aa  87  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839672 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44580  nudix hydrolase, YffH family  31.05 
 
 		 205 aa  87  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.286548  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03689  ADP-ribose pyrophosphatase  30.46 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000876457  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0726  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  31.05 
 
 		 203 aa  86.7  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0027035  hitchhiker  0.000778949 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4194  ADP-ribose diphosphatase  30 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.105257  hitchhiker  0.00339235 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2991  NUDIX hydrolase  29.74 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3447  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  31.41 
 
 		 210 aa  85.5  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3331  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  29.41 
 
 		 208 aa  85.5  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0444683  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5441  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 191 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.391972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0608  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 		 199 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0545  ADP-ribose diphosphatase  30.37 
 
 		 202 aa  84.7  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3562  NUDIX hydrolase  29.23 
 
 		 203 aa  84.7  8e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0769  ADP-ribose diphosphatase  31.22 
 
 		 200 aa  84.7  8e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3903  MutT/nudix family protein  30.69 
 
 		 200 aa  84.3  9e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0754  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  31.22 
 
 		 203 aa  84.7  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0370949  hitchhiker  0.0055541 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  35.12 
 
 		 186 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3577  NUDIX hydrolase  30.69 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>