More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5388 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5388  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 191 aa  376  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7290  NUDIX hydrolase  61.29 
 
 		 204 aa  218  6e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0832  NUDIX hydrolase  62.23 
 
 		 188 aa  216  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.341274  normal  0.656048 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0904  NUDIX hydrolase  60.47 
 
 		 188 aa  208  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0381833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0864  NUDIX hydrolase  60.47 
 
 		 188 aa  207  6e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426746  normal  0.334935 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5997  NUDIX hydrolase  57.75 
 
 		 199 aa  206  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0688  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 189 aa  180  9.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653338  normal  0.751646 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5441  NUDIX hydrolase  51.93 
 
 		 191 aa  169  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.391972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0514  NUDIX hydrolase  51.34 
 
 		 189 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0222532  hitchhiker  0.000757753 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1238  NUDIX hydrolase  41.8 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0804984  hitchhiker  0.0000559773 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1092  NUDIX hydrolase  40.11 
 
 		 196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0217104  hitchhiker  0.00264715 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3332  NUDIX hydrolase  41.81 
 
 		 202 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0790  NUDIX hydrolase  40.64 
 
 		 198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14892  normal  0.428027 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2384  hypothetical protein  43.71 
 
 		 193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.227212  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4950  NUDIX hydrolase  39.36 
 
 		 195 aa  115  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17081  normal  0.0998667 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1566  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  37.79 
 
 		 194 aa  112  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6151  NUDIX hydrolase  36.02 
 
 		 193 aa  112  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.389113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1763  hypothetical protein  36.41 
 
 		 198 aa  111  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00769782  normal  0.0120574 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5088  NUDIX hydrolase  39.01 
 
 		 200 aa  109  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2255  NUDIX hydrolase  38.42 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3265  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0862  NUDIX hydrolase  36.41 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102995  normal  0.491513 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1164  hypothetical protein  36.16 
 
 		 195 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4044  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  36.61 
 
 		 199 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0273  hypothetical protein  36.16 
 
 		 195 aa  102  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2793  NUDIX family hydrolase  36.16 
 
 		 195 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2947  NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes  36.16 
 
 		 195 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.78552  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2220  NUDIX hydrolase  35.75 
 
 		 194 aa  101  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0391514  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0621  hypothetical protein  38.76 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3936  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2191  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 		 199 aa  98.2  7e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0802  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  34.41 
 
 		 201 aa  98.2  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3483  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 		 191 aa  98.2  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.142952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3674  NUDIX hydrolase  35.87 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.569185 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4842  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 		 195 aa  96.7  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0219  hypothetical protein  34.04 
 
 		 192 aa  96.7  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.170349  normal  0.191205 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0463  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  35.52 
 
 		 199 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2291  NUDIX hydrolase  37.28 
 
 		 201 aa  95.9  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.259047  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0942  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  35.52 
 
 		 199 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0904  NUDIX hydrolase  35.52 
 
 		 199 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.682548 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2962  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 		 191 aa  94  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.510189 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0740  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0324  NUDIX hydrolase  37.02 
 
 		 209 aa  92.4  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0106053  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2260  NUDIX hydrolase  36.87 
 
 		 198 aa  91.7  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.229118  hitchhiker  0.000399165 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0971  NUDIX hydrolase  34.1 
 
 		 193 aa  91.7  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.820775  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1170  NUDIX hydrolase  35.17 
 
 		 193 aa  90.9  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3562  NUDIX hydrolase  34.64 
 
 		 203 aa  90.9  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3294  NUDIX hydrolase  33.52 
 
 		 194 aa  90.9  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.389654  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65710  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  38.89 
 
 		 205 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5700  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  38.89 
 
 		 205 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0735  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 		 193 aa  90.5  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44580  nudix hydrolase, YffH family  39.13 
 
 		 205 aa  89.4  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.286548  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0545  ADP-ribose diphosphatase  32.24 
 
 		 202 aa  87.4  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2613  NUDIX family hydrolase  32.73 
 
 		 191 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.819816 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3688  hydrolase, NUDIX family  32.53 
 
 		 191 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2710  putative hydrolase YffH  35.53 
 
 		 191 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2746  NUDIX family hydrolase  32.73 
 
 		 191 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2843  putative hydrolase YffH  35.53 
 
 		 191 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2556  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  40 
 
 		 209 aa  86.3  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2835  hydrolase, NUDIX family  32.73 
 
 		 191 aa  86.7  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2621  putative hydrolase YffH  35.53 
 
 		 191 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3359  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  33.33 
 
 		 206 aa  86.3  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0950071 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02358  predicted NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 191 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1203  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 191 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02320  hypothetical protein  32.73 
 
 		 191 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2596  NUDIX family hydrolase  32.73 
 
 		 191 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2670  putative hydrolase YffH  35.57 
 
 		 191 aa  86.3  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1210  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 191 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2736  putative hydrolase YffH  35.53 
 
 		 191 aa  85.9  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.738659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4194  ADP-ribose diphosphatase  32.7 
 
 		 200 aa  85.5  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.105257  hitchhiker  0.00339235 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0608  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 		 199 aa  84.3  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1377  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 		 196 aa  84.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.340086  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3567  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  39.33 
 
 		 196 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3047  ADP-ribose diphosphatase  38.99 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000114185  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3214  NUDIX hydrolase  34.1 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.157336  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3473  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.672777  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2012  MutT/nudix family protein  34.19 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000517661  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0775  ADP-ribose diphosphatase  34.59 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000156265  unclonable  0.0000000000726693 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03689  ADP-ribose pyrophosphatase  39.37 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000876457  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3447  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  35.37 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1063  ADP-ribose diphosphatase  36.31 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0431  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  32.69 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000737623  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2697  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 		 335 aa  79  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3235  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  36.88 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00707793  hitchhiker  0.00000215101 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3467  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  35.8 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0321029  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02906  ADP-ribose pyrophosphatase  35.19 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0666  ADP-ribose diphosphatase  35.19 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4919  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  34.15 
 
 		 180 aa  77.4  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4973  mutT/nudix family protein  34.94 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3498  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  35.19 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0634708  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3212  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  35.19 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00741682  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4348  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  35.19 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3436  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  34.57 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0663  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  35.19 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.16672  normal  0.0141721 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3443  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  34.57 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4795  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0726  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  36.25 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0027035  hitchhiker  0.000778949 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3329  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  35.19 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.746955 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3371  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  34.57 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.337716 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>