270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3332 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3332  NUDIX hydrolase  100 
 
 
202 aa  409  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3265  NUDIX hydrolase  74.07 
 
 
195 aa  288  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4950  NUDIX hydrolase  73.02 
 
 
195 aa  287  9e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17081  normal  0.0998667 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5088  NUDIX hydrolase  65.8 
 
 
200 aa  263  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1164  hypothetical protein  66.84 
 
 
195 aa  262  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0273  hypothetical protein  66.84 
 
 
195 aa  262  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2947  NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes  66.84 
 
 
195 aa  262  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.78552  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2793  NUDIX family hydrolase  66.84 
 
 
195 aa  262  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1763  hypothetical protein  64.58 
 
 
198 aa  259  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00769782  normal  0.0120574 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2291  NUDIX hydrolase  64.1 
 
 
201 aa  254  5e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.259047  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4842  NUDIX hydrolase  65.8 
 
 
195 aa  253  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4044  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  67.03 
 
 
199 aa  249  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0802  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  67.39 
 
 
201 aa  250  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0463  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  66.49 
 
 
199 aa  248  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0942  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  66.49 
 
 
199 aa  248  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0904  NUDIX hydrolase  66.49 
 
 
199 aa  248  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.682548 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2191  NUDIX hydrolase  62.5 
 
 
199 aa  247  8e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2384  hypothetical protein  60.94 
 
 
193 aa  244  8e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.227212  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3674  NUDIX hydrolase  63.04 
 
 
199 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.569185 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2260  NUDIX hydrolase  64.21 
 
 
198 aa  240  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.229118  hitchhiker  0.000399165 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0621  hypothetical protein  62.7 
 
 
224 aa  234  9e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1170  NUDIX hydrolase  58.92 
 
 
193 aa  228  6e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3936  NUDIX hydrolase  54.84 
 
 
195 aa  221  4e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6151  NUDIX hydrolase  55.56 
 
 
193 aa  218  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.389113  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0324  NUDIX hydrolase  56.54 
 
 
209 aa  218  7e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0106053  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3567  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  60.54 
 
 
196 aa  216  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0971  NUDIX hydrolase  55.9 
 
 
193 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.820775  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0740  NUDIX hydrolase  52.85 
 
 
196 aa  210  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3483  NUDIX hydrolase  55.38 
 
 
191 aa  202  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.142952  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3294  NUDIX hydrolase  54.59 
 
 
194 aa  202  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.389654  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2220  NUDIX hydrolase  53.26 
 
 
194 aa  201  6e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0391514  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2697  NUDIX hydrolase  54.3 
 
 
335 aa  199  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0735  NUDIX hydrolase  54.89 
 
 
193 aa  199  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01200  protein containing C-terminal region of TrgB protein  56.68 
 
 
236 aa  195  4.0000000000000005e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3214  NUDIX hydrolase  52.97 
 
 
191 aa  191  6e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.157336  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3688  hydrolase, NUDIX family  52.22 
 
 
191 aa  187  9e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2746  NUDIX family hydrolase  53.18 
 
 
191 aa  186  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2835  hydrolase, NUDIX family  53.18 
 
 
191 aa  186  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2613  NUDIX family hydrolase  53.18 
 
 
191 aa  186  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.819816 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02358  predicted NUDIX hydrolase  52.6 
 
 
191 aa  185  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1203  NUDIX hydrolase  52.6 
 
 
191 aa  185  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1210  NUDIX hydrolase  52.6 
 
 
191 aa  185  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2596  NUDIX family hydrolase  52.6 
 
 
191 aa  185  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02320  hypothetical protein  52.6 
 
 
191 aa  185  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2621  putative hydrolase YffH  52.6 
 
 
191 aa  184  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2255  NUDIX hydrolase  51.34 
 
 
198 aa  184  6e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2710  putative hydrolase YffH  52.6 
 
 
191 aa  184  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2843  putative hydrolase YffH  52.6 
 
 
191 aa  184  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2962  NUDIX hydrolase  51.35 
 
 
191 aa  184  6e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.510189 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2736  putative hydrolase YffH  52.6 
 
 
191 aa  184  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.738659  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2670  putative hydrolase YffH  52.6 
 
 
191 aa  184  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0790  NUDIX hydrolase  51.35 
 
 
198 aa  182  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14892  normal  0.428027 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1276  NUDIX family hydrolase  46.88 
 
 
198 aa  172  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1566  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  45.21 
 
 
194 aa  172  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2787  NUDIX family hydrolase  46.88 
 
 
198 aa  172  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0175603 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1390  NUDIX hydrolase  46.88 
 
 
198 aa  172  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.136474  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1092  NUDIX hydrolase  47.89 
 
 
196 aa  170  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0217104  hitchhiker  0.00264715 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3473  NUDIX hydrolase  51.61 
 
 
201 aa  168  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.672777  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1238  NUDIX hydrolase  46.84 
 
 
197 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0804984  hitchhiker  0.0000559773 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0219  hypothetical protein  41.9 
 
 
192 aa  149  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.170349  normal  0.191205 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0862  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 
193 aa  146  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102995  normal  0.491513 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5388  NUDIX hydrolase  41.81 
 
 
191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7290  NUDIX hydrolase  40.11 
 
 
204 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0832  NUDIX hydrolase  44.29 
 
 
188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.341274  normal  0.656048 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0864  NUDIX hydrolase  42.14 
 
 
188 aa  115  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426746  normal  0.334935 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0904  NUDIX hydrolase  42.14 
 
 
188 aa  115  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0381833  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5997  NUDIX hydrolase  37.63 
 
 
199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0514  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
189 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0222532  hitchhiker  0.000757753 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5441  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
191 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.391972  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1063  ADP-ribose diphosphatase  31.94 
 
 
194 aa  96.3  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0105  NUDIX hydrolase  33.69 
 
 
201 aa  96.3  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5218  NUDIX hydrolase  29.19 
 
 
195 aa  95.5  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253692  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0775  ADP-ribose diphosphatase  31.67 
 
 
204 aa  93.2  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000156265  unclonable  0.0000000000726693 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3224  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  31.55 
 
 
207 aa  92.4  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000886574  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2991  NUDIX hydrolase  35.23 
 
 
204 aa  92  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44580  nudix hydrolase, YffH family  36.36 
 
 
205 aa  92  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.286548  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3047  ADP-ribose diphosphatase  31.55 
 
 
204 aa  91.7  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000114185  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3235  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  31.18 
 
 
203 aa  91.7  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00707793  hitchhiker  0.00000215101 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0726  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  31.18 
 
 
203 aa  91.3  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0027035  hitchhiker  0.000778949 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0782  NUDIX hydrolase  30.11 
 
 
200 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000245239  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4973  mutT/nudix family protein  33.71 
 
 
205 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0814  NUDIX hydrolase  30.11 
 
 
200 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00725628  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2012  MutT/nudix family protein  32.45 
 
 
208 aa  90.5  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000517661  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3577  NUDIX hydrolase  30.11 
 
 
200 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368158  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0807  NUDIX hydrolase  30.11 
 
 
200 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000627891  hitchhiker  0.0000000000549987 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0547  hypothetical protein  35.71 
 
 
215 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0769  ADP-ribose diphosphatase  33.68 
 
 
200 aa  89.7  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0754  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  31.18 
 
 
203 aa  89.4  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0370949  hitchhiker  0.0055541 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0688  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 
189 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653338  normal  0.751646 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3903  MutT/nudix family protein  31.72 
 
 
200 aa  88.2  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3447  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  36.6 
 
 
210 aa  88.2  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2556  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  32.39 
 
 
209 aa  87.4  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3776  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  32.96 
 
 
211 aa  87.4  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0431  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  30.73 
 
 
206 aa  86.3  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000737623  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4267  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  35.29 
 
 
210 aa  85.5  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00839672 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3558  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 
206 aa  85.5  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.324606  normal  0.411557 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3618  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  32.6 
 
 
211 aa  85.5  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0315  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  30.39 
 
 
210 aa  85.1  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3331  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  29.83 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0444683  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4194  ADP-ribose diphosphatase  27.42 
 
 
200 aa  84  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.105257  hitchhiker  0.00339235 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>