More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1390 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1276  NUDIX family hydrolase  100 
 
 
198 aa  415  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2787  NUDIX family hydrolase  100 
 
 
198 aa  415  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0175603 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1390  NUDIX hydrolase  100 
 
 
198 aa  415  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.136474  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3483  NUDIX hydrolase  75.4 
 
 
191 aa  300  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.142952  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3294  NUDIX hydrolase  73.26 
 
 
194 aa  282  3.0000000000000004e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.389654  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3214  NUDIX hydrolase  70.05 
 
 
191 aa  272  3e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.157336  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0735  NUDIX hydrolase  68.82 
 
 
193 aa  261  4e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0971  NUDIX hydrolase  67.38 
 
 
193 aa  261  6e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.820775  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3936  NUDIX hydrolase  62.57 
 
 
195 aa  239  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02358  predicted NUDIX hydrolase  61.08 
 
 
191 aa  238  4e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1203  NUDIX hydrolase  61.08 
 
 
191 aa  238  4e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1210  NUDIX hydrolase  61.08 
 
 
191 aa  238  4e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02320  hypothetical protein  61.08 
 
 
191 aa  238  4e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2596  NUDIX family hydrolase  61.08 
 
 
191 aa  238  4e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2746  NUDIX family hydrolase  61.08 
 
 
191 aa  237  6.999999999999999e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3688  hydrolase, NUDIX family  60.75 
 
 
191 aa  237  6.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2835  hydrolase, NUDIX family  61.08 
 
 
191 aa  237  6.999999999999999e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2613  NUDIX family hydrolase  61.08 
 
 
191 aa  236  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.819816 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2962  NUDIX hydrolase  61.29 
 
 
191 aa  236  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.510189 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2843  putative hydrolase YffH  60.54 
 
 
191 aa  234  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2670  putative hydrolase YffH  60.54 
 
 
191 aa  234  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2710  putative hydrolase YffH  60.54 
 
 
191 aa  234  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2621  putative hydrolase YffH  60.54 
 
 
191 aa  234  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1170  NUDIX hydrolase  60.11 
 
 
193 aa  233  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2736  putative hydrolase YffH  60 
 
 
191 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.738659  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6151  NUDIX hydrolase  59.26 
 
 
193 aa  231  4.0000000000000004e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.389113  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1164  hypothetical protein  57.46 
 
 
195 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0273  hypothetical protein  57.46 
 
 
195 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2793  NUDIX family hydrolase  57.46 
 
 
195 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2947  NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes  57.46 
 
 
195 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.78552  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3265  NUDIX hydrolase  55.32 
 
 
195 aa  210  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0740  NUDIX hydrolase  51.32 
 
 
196 aa  208  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1763  hypothetical protein  57.54 
 
 
198 aa  205  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00769782  normal  0.0120574 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0621  hypothetical protein  54.3 
 
 
224 aa  205  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3674  NUDIX hydrolase  54.95 
 
 
199 aa  203  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.569185 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2220  NUDIX hydrolase  53.51 
 
 
194 aa  203  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0391514  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5088  NUDIX hydrolase  54.89 
 
 
200 aa  197  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4950  NUDIX hydrolase  53.19 
 
 
195 aa  192  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17081  normal  0.0998667 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2260  NUDIX hydrolase  54.84 
 
 
198 aa  189  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.229118  hitchhiker  0.000399165 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0802  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  52.69 
 
 
201 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4044  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  52.69 
 
 
199 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4842  NUDIX hydrolase  51.79 
 
 
195 aa  187  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2291  NUDIX hydrolase  52.15 
 
 
201 aa  186  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.259047  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3332  NUDIX hydrolase  48.44 
 
 
202 aa  185  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0904  NUDIX hydrolase  51.08 
 
 
199 aa  184  9e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.682548 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0463  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  51.08 
 
 
199 aa  184  9e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0942  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  51.08 
 
 
199 aa  184  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2384  hypothetical protein  48.69 
 
 
193 aa  178  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.227212  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3567  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  52.15 
 
 
196 aa  176  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2191  NUDIX hydrolase  47.57 
 
 
199 aa  174  6e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01200  protein containing C-terminal region of TrgB protein  48.9 
 
 
236 aa  171  7.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0219  hypothetical protein  44.44 
 
 
192 aa  167  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.170349  normal  0.191205 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0324  NUDIX hydrolase  46.52 
 
 
209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0106053  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2697  NUDIX hydrolase  48.17 
 
 
335 aa  162  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2255  NUDIX hydrolase  44.97 
 
 
198 aa  159  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0862  NUDIX hydrolase  44.69 
 
 
193 aa  154  6e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102995  normal  0.491513 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3473  NUDIX hydrolase  47.46 
 
 
201 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.672777  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1238  NUDIX hydrolase  45.25 
 
 
197 aa  151  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0804984  hitchhiker  0.0000559773 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0790  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
198 aa  150  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14892  normal  0.428027 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1092  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 
196 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0217104  hitchhiker  0.00264715 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1566  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  40.74 
 
 
194 aa  146  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5218  NUDIX hydrolase  31.79 
 
 
195 aa  94.4  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253692  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7290  NUDIX hydrolase  37.09 
 
 
204 aa  94.4  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2991  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
204 aa  94.4  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0105  NUDIX hydrolase  31.02 
 
 
201 aa  94  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5997  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 
199 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2012  MutT/nudix family protein  33.86 
 
 
208 aa  92.8  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000517661  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0832  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 
188 aa  91.3  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.341274  normal  0.656048 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0545  ADP-ribose diphosphatase  31.82 
 
 
202 aa  90.9  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0775  ADP-ribose diphosphatase  31.09 
 
 
204 aa  89.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000156265  unclonable  0.0000000000726693 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004521  ADP-ribose pyrophosphatase  34.39 
 
 
216 aa  88.6  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000302738  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3235  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  32.09 
 
 
203 aa  88.6  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00707793  hitchhiker  0.00000215101 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4180  ADP-ribose pyrophosphatase  32.16 
 
 
214 aa  88.6  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0431  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  32.97 
 
 
206 aa  88.2  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000737623  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3359  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  34.03 
 
 
206 aa  88.2  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0950071 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1063  ADP-ribose diphosphatase  31.94 
 
 
194 aa  87.8  9e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0904  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
188 aa  87  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0381833  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0726  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  32.28 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0027035  hitchhiker  0.000778949 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0782  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 
200 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000245239  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0864  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
188 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426746  normal  0.334935 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0814  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 
200 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00725628  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3447  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  31.22 
 
 
210 aa  86.3  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3577  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 
200 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368158  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0807  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 
200 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000627891  hitchhiker  0.0000000000549987 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3047  ADP-ribose diphosphatase  33.33 
 
 
204 aa  85.5  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000114185  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3538  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  30.53 
 
 
210 aa  84.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129822  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3562  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 
203 aa  84.7  8e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0754  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  31.55 
 
 
203 aa  84  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0370949  hitchhiker  0.0055541 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4194  ADP-ribose diphosphatase  31.75 
 
 
200 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.105257  hitchhiker  0.00339235 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3903  MutT/nudix family protein  32.46 
 
 
200 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3371  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  30 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.337716 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3436  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  30 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3443  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  30 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3366  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  30 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65710  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  36.71 
 
 
205 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5700  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  36.71 
 
 
205 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3224  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  31.32 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000886574  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5441  NUDIX hydrolase  29.89 
 
 
191 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.391972  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0580  ADP-ribose diphosphatase  31.38 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0547  hypothetical protein  33.52 
 
 
215 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>