More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3214 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3214  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 191 aa  395  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.157336  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3294  NUDIX hydrolase  86.32 
 
 		 194 aa  352  2.9999999999999997e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.389654  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0735  NUDIX hydrolase  81.05 
 
 		 193 aa  333  1e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0971  NUDIX hydrolase  76.32 
 
 		 193 aa  313  7e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.820775  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3483  NUDIX hydrolase  73.8 
 
 		 191 aa  298  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.142952  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02358  predicted NUDIX hydrolase  66.12 
 
 		 191 aa  258  3e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1203  NUDIX hydrolase  66.12 
 
 		 191 aa  258  3e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2596  NUDIX family hydrolase  66.12 
 
 		 191 aa  258  3e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2613  NUDIX family hydrolase  66.12 
 
 		 191 aa  258  3e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.819816 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1210  NUDIX hydrolase  66.12 
 
 		 191 aa  258  3e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02320  hypothetical protein  66.12 
 
 		 191 aa  258  3e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2746  NUDIX family hydrolase  66.12 
 
 		 191 aa  258  4e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3688  hydrolase, NUDIX family  64.71 
 
 		 191 aa  258  4e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2835  hydrolase, NUDIX family  66.12 
 
 		 191 aa  258  4e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1390  NUDIX hydrolase  70.05 
 
 		 198 aa  253  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.136474  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2787  NUDIX family hydrolase  70.05 
 
 		 198 aa  253  1.0000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0175603 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1276  NUDIX family hydrolase  70.05 
 
 		 198 aa  253  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2962  NUDIX hydrolase  62.77 
 
 		 191 aa  251  5.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.510189 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2621  putative hydrolase YffH  62.84 
 
 		 191 aa  246  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2670  putative hydrolase YffH  62.84 
 
 		 191 aa  246  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2843  putative hydrolase YffH  62.84 
 
 		 191 aa  246  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2710  putative hydrolase YffH  62.84 
 
 		 191 aa  246  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2736  putative hydrolase YffH  62.3 
 
 		 191 aa  245  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.738659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3936  NUDIX hydrolase  59.16 
 
 		 195 aa  239  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1170  NUDIX hydrolase  59.57 
 
 		 193 aa  233  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6151  NUDIX hydrolase  56.08 
 
 		 193 aa  222  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.389113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3674  NUDIX hydrolase  60.77 
 
 		 199 aa  221  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.569185 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2220  NUDIX hydrolase  56.45 
 
 		 194 aa  219  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0391514  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0621  hypothetical protein  54.79 
 
 		 224 aa  214  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0740  NUDIX hydrolase  55.19 
 
 		 196 aa  213  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1164  hypothetical protein  56.45 
 
 		 195 aa  210  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0273  hypothetical protein  56.45 
 
 		 195 aa  210  7.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2947  NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes  56.45 
 
 		 195 aa  210  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.78552  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2793  NUDIX family hydrolase  56.45 
 
 		 195 aa  210  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3265  NUDIX hydrolase  56.76 
 
 		 195 aa  209  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4950  NUDIX hydrolase  57.3 
 
 		 195 aa  209  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17081  normal  0.0998667 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1763  hypothetical protein  57.3 
 
 		 198 aa  207  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00769782  normal  0.0120574 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0802  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  56.22 
 
 		 201 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4842  NUDIX hydrolase  56.22 
 
 		 195 aa  201  6e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5088  NUDIX hydrolase  55.14 
 
 		 200 aa  200  8e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4044  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  55.14 
 
 		 199 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2260  NUDIX hydrolase  58.33 
 
 		 198 aa  200  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.229118  hitchhiker  0.000399165 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0463  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  54.59 
 
 		 199 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0942  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  54.59 
 
 		 199 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0904  NUDIX hydrolase  54.59 
 
 		 199 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.682548 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2191  NUDIX hydrolase  51.89 
 
 		 199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2291  NUDIX hydrolase  53.51 
 
 		 201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.259047  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3332  NUDIX hydrolase  52.97 
 
 		 202 aa  191  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2384  hypothetical protein  50.81 
 
 		 193 aa  182  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.227212  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3567  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  52.13 
 
 		 196 aa  174  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2255  NUDIX hydrolase  47.94 
 
 		 198 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01200  protein containing C-terminal region of TrgB protein  49.46 
 
 		 236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1092  NUDIX hydrolase  48.37 
 
 		 196 aa  166  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0217104  hitchhiker  0.00264715 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2697  NUDIX hydrolase  46.56 
 
 		 335 aa  165  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1238  NUDIX hydrolase  50.54 
 
 		 197 aa  164  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0804984  hitchhiker  0.0000559773 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0219  hypothetical protein  41.67 
 
 		 192 aa  164  5.9999999999999996e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.170349  normal  0.191205 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0790  NUDIX hydrolase  50.28 
 
 		 198 aa  160  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14892  normal  0.428027 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1566  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  45.45 
 
 		 194 aa  159  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3473  NUDIX hydrolase  50.28 
 
 		 201 aa  158  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.672777  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0862  NUDIX hydrolase  45.5 
 
 		 193 aa  154  7e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102995  normal  0.491513 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0324  NUDIX hydrolase  45.95 
 
 		 209 aa  150  8.999999999999999e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0106053  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7290  NUDIX hydrolase  37.63 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5997  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 199 aa  109  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2012  MutT/nudix family protein  37.3 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000517661  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0105  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0832  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 		 188 aa  99  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.341274  normal  0.656048 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0864  NUDIX hydrolase  34.66 
 
 		 188 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426746  normal  0.334935 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0904  NUDIX hydrolase  34.66 
 
 		 188 aa  94.4  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0381833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5218  NUDIX hydrolase  35.95 
 
 		 195 aa  91.3  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0726  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  33.7 
 
 		 203 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0027035  hitchhiker  0.000778949 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0431  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  32.28 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000737623  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3235  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  33.15 
 
 		 203 aa  89.4  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00707793  hitchhiker  0.00000215101 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3359  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  32.97 
 
 		 206 aa  89  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0950071 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0545  ADP-ribose diphosphatase  30.94 
 
 		 202 aa  88.2  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3331  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  32.62 
 
 		 208 aa  87.8  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0444683  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004521  ADP-ribose pyrophosphatase  33.15 
 
 		 216 aa  87  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000302738  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0754  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  33.15 
 
 		 203 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0370949  hitchhiker  0.0055541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2991  NUDIX hydrolase  33.51 
 
 		 204 aa  87.8  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3903  MutT/nudix family protein  33.7 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3447  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  33.33 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4194  ADP-ribose diphosphatase  33.15 
 
 		 200 aa  85.9  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.105257  hitchhiker  0.00339235 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1355  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  32.97 
 
 		 201 aa  85.5  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.127377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0775  ADP-ribose diphosphatase  32.6 
 
 		 204 aa  84.7  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000156265  unclonable  0.0000000000726693 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0782  NUDIX hydrolase  32.97 
 
 		 200 aa  84.7  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000245239  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0814  NUDIX hydrolase  32.97 
 
 		 200 aa  84.3  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00725628  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3577  NUDIX hydrolase  32.97 
 
 		 200 aa  84.3  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368158  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0807  NUDIX hydrolase  32.97 
 
 		 200 aa  84.3  9e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000627891  hitchhiker  0.0000000000549987 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5388  NUDIX hydrolase  34.1 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5700  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  36.91 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65710  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  36.91 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3047  ADP-ribose diphosphatase  34.25 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000114185  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3682  UDP-sugar diphosphatase  33.12 
 
 		 190 aa  81.3  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4180  ADP-ribose pyrophosphatase  32.37 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0769  ADP-ribose diphosphatase  32.6 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0514  NUDIX hydrolase  34.39 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0222532  hitchhiker  0.000757753 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0804  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02906  ADP-ribose pyrophosphatase  30.39 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4348  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  30.39 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02856  hypothetical protein  30.39 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3212  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  30.39 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00741682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>