210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3682 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_3682  UDP-sugar diphosphatase  100 
 
 
190 aa  391  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3661  UDP-sugar diphosphatase  97.35 
 
 
190 aa  378  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1588  UDP-sugar diphosphatase  55.03 
 
 
189 aa  204  9e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0369  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  52.54 
 
 
189 aa  197  7e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.424148  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1625  uridine diphosphate glucose pyrophosphatase  44.9 
 
 
196 aa  172  1.9999999999999998e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0730  uridine diphosphate glucose pyrophosphatase  41.36 
 
 
195 aa  166  2e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.474724  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1333  NUDIX family hydrolase  42.93 
 
 
194 aa  166  2e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.296526  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0698  NUDIX domain-containing protein  38.86 
 
 
194 aa  154  5.0000000000000005e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0079062  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1492  NUDIX domain-containing protein  39.9 
 
 
198 aa  138  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0497  NUDIX domain-containing protein  38.86 
 
 
198 aa  138  6e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0472  NUDIX domain-containing protein  38.86 
 
 
198 aa  137  7e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1033  NUDIX domain protein  38.3 
 
 
189 aa  125  3e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.380959  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0971  NUDIX hydrolase  35.57 
 
 
193 aa  90.1  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.820775  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0735  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
193 aa  88.6  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1164  hypothetical protein  34.36 
 
 
195 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0273  hypothetical protein  34.36 
 
 
195 aa  86.7  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2947  NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes  34.36 
 
 
195 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.78552  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2793  NUDIX family hydrolase  34.36 
 
 
195 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2220  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
194 aa  85.9  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0391514  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3294  NUDIX hydrolase  35.67 
 
 
194 aa  85.1  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.389654  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3214  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 
191 aa  81.3  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.157336  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3936  NUDIX hydrolase  32.45 
 
 
195 aa  80.9  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1566  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  33.09 
 
 
194 aa  80.9  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3483  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
191 aa  79.7  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.142952  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2670  putative hydrolase YffH  33.92 
 
 
191 aa  77.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2843  putative hydrolase YffH  33.92 
 
 
191 aa  77.8  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6151  NUDIX hydrolase  33.77 
 
 
193 aa  77.8  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.389113  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2621  putative hydrolase YffH  33.92 
 
 
191 aa  77.8  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2710  putative hydrolase YffH  33.92 
 
 
191 aa  77.8  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2736  putative hydrolase YffH  33.33 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.738659  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2962  NUDIX hydrolase  32.97 
 
 
191 aa  75.9  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.510189 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3674  NUDIX hydrolase  30.87 
 
 
199 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.569185 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2613  NUDIX family hydrolase  34.56 
 
 
191 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.819816 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1763  hypothetical protein  32.65 
 
 
198 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00769782  normal  0.0120574 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02358  predicted NUDIX hydrolase  33.82 
 
 
191 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1203  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 
191 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3688  hydrolase, NUDIX family  33.82 
 
 
191 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02320  hypothetical protein  33.82 
 
 
191 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2746  NUDIX family hydrolase  33.82 
 
 
191 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2596  NUDIX family hydrolase  33.82 
 
 
191 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2835  hydrolase, NUDIX family  33.82 
 
 
191 aa  74.3  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1210  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 
191 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1238  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 
197 aa  72  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0804984  hitchhiker  0.0000559773 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1170  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 
193 aa  71.2  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0621  hypothetical protein  32.88 
 
 
224 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2291  NUDIX hydrolase  28.19 
 
 
201 aa  70.9  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.259047  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0740  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 
196 aa  70.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1092  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 
196 aa  68.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0217104  hitchhiker  0.00264715 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5088  NUDIX hydrolase  29.79 
 
 
200 aa  67  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0219  hypothetical protein  32.62 
 
 
192 aa  67.4  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.170349  normal  0.191205 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0105  NUDIX hydrolase  27.33 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3265  NUDIX hydrolase  27.06 
 
 
195 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4950  NUDIX hydrolase  30.88 
 
 
195 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17081  normal  0.0998667 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1390  NUDIX hydrolase  32.08 
 
 
198 aa  66.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.136474  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2787  NUDIX family hydrolase  32.08 
 
 
198 aa  66.2  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0175603 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1276  NUDIX family hydrolase  32.08 
 
 
198 aa  66.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  33.52 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  33.52 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  33.52 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  33.52 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  33.52 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  33.52 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2260  NUDIX hydrolase  28.83 
 
 
198 aa  64.7  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.229118  hitchhiker  0.000399165 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  32.22 
 
 
179 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2384  hypothetical protein  30.41 
 
 
193 aa  63.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.227212  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0495  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  31.37 
 
 
205 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0862  NUDIX hydrolase  31.41 
 
 
193 aa  62.4  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102995  normal  0.491513 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4842  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 
195 aa  61.6  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2191  NUDIX hydrolase  25.15 
 
 
199 aa  61.2  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  32.97 
 
 
179 aa  60.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0547  hypothetical protein  30.72 
 
 
215 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  33.51 
 
 
179 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44580  nudix hydrolase, YffH family  29.33 
 
 
205 aa  60.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.286548  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0608  NUDIX hydrolase  28.3 
 
 
199 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  32.97 
 
 
179 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4973  mutT/nudix family protein  33.93 
 
 
205 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3567  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  29.84 
 
 
196 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1808  NUDIX hydrolase  27.7 
 
 
193 aa  59.3  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.801107  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0463  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  28.03 
 
 
199 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0942  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  28.03 
 
 
199 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0904  NUDIX hydrolase  28.03 
 
 
199 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.682548 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3332  NUDIX hydrolase  25.85 
 
 
202 aa  58.5  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0790  NUDIX hydrolase  30.85 
 
 
198 aa  58.5  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14892  normal  0.428027 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1525  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  30.69 
 
 
210 aa  58.2  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.411844  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2255  NUDIX hydrolase  30.14 
 
 
198 aa  58.2  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4044  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  27.27 
 
 
199 aa  57  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65710  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  29.56 
 
 
205 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  29.14 
 
 
187 aa  57.4  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  31.69 
 
 
178 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2012  MutT/nudix family protein  29.61 
 
 
208 aa  57.8  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000517661  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0324  NUDIX hydrolase  29.01 
 
 
209 aa  57.4  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0106053  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5700  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  29.56 
 
 
205 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2556  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  27.59 
 
 
209 aa  56.2  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0802  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  27.27 
 
 
201 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0775  ADP-ribose diphosphatase  29.05 
 
 
204 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000156265  unclonable  0.0000000000726693 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4711  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
205 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.754787 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4972  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
205 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0431  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  25.93 
 
 
206 aa  54.3  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000737623  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  31.32 
 
 
179 aa  54.3  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4919  NUDIX hydrolase  33.7 
 
 
209 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>