More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2710 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A2710  putative hydrolase YffH  100 
 
 
191 aa  390  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2621  putative hydrolase YffH  100 
 
 
191 aa  390  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2843  putative hydrolase YffH  100 
 
 
191 aa  390  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2670  putative hydrolase YffH  99.48 
 
 
191 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2736  putative hydrolase YffH  99.48 
 
 
191 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.738659  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2613  NUDIX family hydrolase  88.48 
 
 
191 aa  357  7e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.819816 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2835  hydrolase, NUDIX family  87.96 
 
 
191 aa  355  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2746  NUDIX family hydrolase  87.96 
 
 
191 aa  355  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02358  predicted NUDIX hydrolase  87.43 
 
 
191 aa  354  5e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1203  NUDIX hydrolase  87.43 
 
 
191 aa  354  5e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2596  NUDIX family hydrolase  87.43 
 
 
191 aa  354  5e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02320  hypothetical protein  87.43 
 
 
191 aa  354  5e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1210  NUDIX hydrolase  87.43 
 
 
191 aa  354  5e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3688  hydrolase, NUDIX family  86.91 
 
 
191 aa  351  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2962  NUDIX hydrolase  78.95 
 
 
191 aa  321  4e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.510189 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3483  NUDIX hydrolase  62.3 
 
 
191 aa  265  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.142952  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3294  NUDIX hydrolase  64.86 
 
 
194 aa  262  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.389654  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0735  NUDIX hydrolase  62.84 
 
 
193 aa  246  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3214  NUDIX hydrolase  62.84 
 
 
191 aa  246  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.157336  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0971  NUDIX hydrolase  62.3 
 
 
193 aa  241  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.820775  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1170  NUDIX hydrolase  59.07 
 
 
193 aa  230  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6151  NUDIX hydrolase  56.77 
 
 
193 aa  229  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.389113  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3936  NUDIX hydrolase  55.32 
 
 
195 aa  224  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2793  NUDIX family hydrolase  60.11 
 
 
195 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2947  NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes  60.11 
 
 
195 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.78552  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1164  hypothetical protein  60.11 
 
 
195 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0273  hypothetical protein  60.11 
 
 
195 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2787  NUDIX family hydrolase  60.54 
 
 
198 aa  215  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0175603 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1276  NUDIX family hydrolase  60.54 
 
 
198 aa  215  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1390  NUDIX hydrolase  60.54 
 
 
198 aa  215  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.136474  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0621  hypothetical protein  55.87 
 
 
224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3674  NUDIX hydrolase  55.03 
 
 
199 aa  208  5e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.569185 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0740  NUDIX hydrolase  52.38 
 
 
196 aa  207  6e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1763  hypothetical protein  56.83 
 
 
198 aa  207  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00769782  normal  0.0120574 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2220  NUDIX hydrolase  50.53 
 
 
194 aa  195  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0391514  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3265  NUDIX hydrolase  53.04 
 
 
195 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4950  NUDIX hydrolase  52.72 
 
 
195 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17081  normal  0.0998667 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0463  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  51.63 
 
 
199 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0942  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  51.63 
 
 
199 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0904  NUDIX hydrolase  51.63 
 
 
199 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.682548 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2191  NUDIX hydrolase  48.68 
 
 
199 aa  192  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2260  NUDIX hydrolase  52.66 
 
 
198 aa  191  5e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.229118  hitchhiker  0.000399165 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4044  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  52.2 
 
 
199 aa  191  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0802  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  51.65 
 
 
201 aa  190  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4842  NUDIX hydrolase  55.43 
 
 
195 aa  188  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2291  NUDIX hydrolase  51.65 
 
 
201 aa  186  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.259047  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5088  NUDIX hydrolase  50.52 
 
 
200 aa  185  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3332  NUDIX hydrolase  52.6 
 
 
202 aa  184  5e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01200  protein containing C-terminal region of TrgB protein  52.57 
 
 
236 aa  181  8.000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2255  NUDIX hydrolase  47.15 
 
 
198 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3567  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  51.31 
 
 
196 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0219  hypothetical protein  44.79 
 
 
192 aa  171  5e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.170349  normal  0.191205 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2384  hypothetical protein  48.11 
 
 
193 aa  168  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.227212  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2697  NUDIX hydrolase  46.99 
 
 
335 aa  163  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1092  NUDIX hydrolase  44.2 
 
 
196 aa  158  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0217104  hitchhiker  0.00264715 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1566  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  39.67 
 
 
194 aa  156  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1238  NUDIX hydrolase  46.41 
 
 
197 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0804984  hitchhiker  0.0000559773 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0862  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
193 aa  153  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102995  normal  0.491513 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0324  NUDIX hydrolase  42.16 
 
 
209 aa  151  5.9999999999999996e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0106053  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0790  NUDIX hydrolase  43.02 
 
 
198 aa  145  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14892  normal  0.428027 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3473  NUDIX hydrolase  46.81 
 
 
201 aa  145  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.672777  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5997  NUDIX hydrolase  37.58 
 
 
199 aa  105  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7290  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
204 aa  101  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0832  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 
188 aa  100  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.341274  normal  0.656048 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0904  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 
188 aa  97.8  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0381833  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0864  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 
188 aa  97.8  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426746  normal  0.334935 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004521  ADP-ribose pyrophosphatase  31.77 
 
 
216 aa  95.5  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000302738  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0105  NUDIX hydrolase  29.89 
 
 
201 aa  94.4  9e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1377  NUDIX hydrolase  31.05 
 
 
196 aa  91.3  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.340086  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3359  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  35.33 
 
 
206 aa  90.1  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0950071 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5441  NUDIX hydrolase  30.11 
 
 
191 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.391972  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2012  MutT/nudix family protein  34.23 
 
 
208 aa  88.2  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000517661  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5218  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 
195 aa  87  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253692  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1358  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  30.53 
 
 
202 aa  86.3  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5388  NUDIX hydrolase  35.53 
 
 
191 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65710  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  35.95 
 
 
205 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5700  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  35.95 
 
 
205 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3436  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  33.75 
 
 
210 aa  85.9  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3371  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  33.75 
 
 
210 aa  85.9  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.337716 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3447  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  29.79 
 
 
210 aa  86.3  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3443  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  33.75 
 
 
210 aa  85.9  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3366  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  33.75 
 
 
210 aa  85.9  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0431  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  27.66 
 
 
206 aa  85.9  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000737623  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 
186 aa  85.1  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0818  NUDIX hydrolase  29.95 
 
 
362 aa  85.1  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130315  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4267  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  30.32 
 
 
210 aa  84.7  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00839672 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4194  ADP-ribose diphosphatase  31.12 
 
 
200 aa  84.7  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.105257  hitchhiker  0.00339235 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3538  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  33.12 
 
 
210 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129822  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1355  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  29.53 
 
 
201 aa  84  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.127377  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4973  mutT/nudix family protein  34.21 
 
 
205 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00870  hypothetical protein  30.73 
 
 
216 aa  83.2  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0495  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  33.11 
 
 
205 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0547  hypothetical protein  32.43 
 
 
215 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0608  NUDIX hydrolase  33.11 
 
 
199 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02906  ADP-ribose pyrophosphatase  28.34 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4348  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  28.34 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3498  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  28.34 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0634708  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3212  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  28.34 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00741682  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02856  hypothetical protein  28.34 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0663  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  28.34 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.16672  normal  0.0141721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>