285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4044 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4044  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  100 
 
 
199 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0904  NUDIX hydrolase  93.47 
 
 
199 aa  373  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.682548 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0463  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  93.47 
 
 
199 aa  373  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0942  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  93.47 
 
 
199 aa  373  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0802  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  92.96 
 
 
201 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3674  NUDIX hydrolase  75.38 
 
 
199 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.569185 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2191  NUDIX hydrolase  71.88 
 
 
199 aa  292  3e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2291  NUDIX hydrolase  74.87 
 
 
201 aa  287  6e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.259047  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2260  NUDIX hydrolase  75.13 
 
 
198 aa  277  9e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.229118  hitchhiker  0.000399165 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4950  NUDIX hydrolase  72.11 
 
 
195 aa  276  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17081  normal  0.0998667 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3265  NUDIX hydrolase  71.58 
 
 
195 aa  275  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1763  hypothetical protein  65.98 
 
 
198 aa  261  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00769782  normal  0.0120574 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2793  NUDIX family hydrolase  65.97 
 
 
195 aa  257  8e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1164  hypothetical protein  65.97 
 
 
195 aa  257  8e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0273  hypothetical protein  65.97 
 
 
195 aa  257  8e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2947  NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes  65.97 
 
 
195 aa  257  8e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.78552  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5088  NUDIX hydrolase  63.35 
 
 
200 aa  251  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3332  NUDIX hydrolase  67.03 
 
 
202 aa  249  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4842  NUDIX hydrolase  65.96 
 
 
195 aa  247  7e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3567  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  66.15 
 
 
196 aa  242  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0621  hypothetical protein  61.62 
 
 
224 aa  230  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3936  NUDIX hydrolase  56.32 
 
 
195 aa  230  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6151  NUDIX hydrolase  56.68 
 
 
193 aa  226  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.389113  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1170  NUDIX hydrolase  56.22 
 
 
193 aa  222  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0740  NUDIX hydrolase  53.81 
 
 
196 aa  220  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2384  hypothetical protein  56.45 
 
 
193 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.227212  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3294  NUDIX hydrolase  57.84 
 
 
194 aa  208  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.389654  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0971  NUDIX hydrolase  57.3 
 
 
193 aa  207  6e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.820775  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0735  NUDIX hydrolase  57.3 
 
 
193 aa  207  6e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0324  NUDIX hydrolase  55.96 
 
 
209 aa  203  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0106053  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3483  NUDIX hydrolase  55.91 
 
 
191 aa  201  5e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.142952  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3214  NUDIX hydrolase  55.14 
 
 
191 aa  200  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.157336  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2220  NUDIX hydrolase  50.81 
 
 
194 aa  196  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0391514  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2255  NUDIX hydrolase  52.69 
 
 
198 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2613  NUDIX family hydrolase  52.46 
 
 
191 aa  193  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.819816 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3688  hydrolase, NUDIX family  51.35 
 
 
191 aa  192  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2736  putative hydrolase YffH  52.75 
 
 
191 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.738659  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2835  hydrolase, NUDIX family  51.91 
 
 
191 aa  192  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2746  NUDIX family hydrolase  51.91 
 
 
191 aa  192  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02358  predicted NUDIX hydrolase  51.37 
 
 
191 aa  191  5e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1203  NUDIX hydrolase  51.37 
 
 
191 aa  191  5e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1210  NUDIX hydrolase  51.37 
 
 
191 aa  191  5e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2596  NUDIX family hydrolase  51.37 
 
 
191 aa  191  5e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02320  hypothetical protein  51.37 
 
 
191 aa  191  5e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2710  putative hydrolase YffH  52.2 
 
 
191 aa  191  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2843  putative hydrolase YffH  52.2 
 
 
191 aa  191  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2621  putative hydrolase YffH  52.2 
 
 
191 aa  191  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01200  protein containing C-terminal region of TrgB protein  58.92 
 
 
236 aa  190  9e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2670  putative hydrolase YffH  52.2 
 
 
191 aa  190  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2962  NUDIX hydrolase  50.27 
 
 
191 aa  187  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.510189 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2697  NUDIX hydrolase  53.23 
 
 
335 aa  184  9e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3473  NUDIX hydrolase  52.46 
 
 
201 aa  179  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.672777  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1566  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  48.37 
 
 
194 aa  177  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0790  NUDIX hydrolase  49.47 
 
 
198 aa  174  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14892  normal  0.428027 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1092  NUDIX hydrolase  46.11 
 
 
196 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0217104  hitchhiker  0.00264715 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1276  NUDIX family hydrolase  52.15 
 
 
198 aa  171  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2787  NUDIX family hydrolase  52.15 
 
 
198 aa  171  7.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0175603 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1390  NUDIX hydrolase  52.15 
 
 
198 aa  171  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.136474  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1238  NUDIX hydrolase  46.32 
 
 
197 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0804984  hitchhiker  0.0000559773 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0219  hypothetical protein  39.67 
 
 
192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.170349  normal  0.191205 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0862  NUDIX hydrolase  40.86 
 
 
193 aa  137  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102995  normal  0.491513 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0832  NUDIX hydrolase  45.77 
 
 
188 aa  109  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.341274  normal  0.656048 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7290  NUDIX hydrolase  39.57 
 
 
204 aa  108  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0864  NUDIX hydrolase  44.37 
 
 
188 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426746  normal  0.334935 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0904  NUDIX hydrolase  40.94 
 
 
188 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0381833  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5388  NUDIX hydrolase  36.61 
 
 
191 aa  102  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5997  NUDIX hydrolase  36.46 
 
 
199 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5218  NUDIX hydrolase  31.35 
 
 
195 aa  94  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253692  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0431  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  31.84 
 
 
206 aa  93.6  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000737623  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0775  ADP-ribose diphosphatase  31.05 
 
 
204 aa  91.7  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000156265  unclonable  0.0000000000726693 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3224  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  30 
 
 
207 aa  90.1  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000886574  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4973  mutT/nudix family protein  34.39 
 
 
205 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0726  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  30.11 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0027035  hitchhiker  0.000778949 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0514  NUDIX hydrolase  35.67 
 
 
189 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0222532  hitchhiker  0.000757753 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5441  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 
191 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.391972  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4194  ADP-ribose diphosphatase  29.47 
 
 
200 aa  85.5  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.105257  hitchhiker  0.00339235 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3235  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  28.95 
 
 
203 aa  85.5  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00707793  hitchhiker  0.00000215101 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1355  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  29.41 
 
 
201 aa  84.7  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.127377  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0547  hypothetical protein  34.38 
 
 
215 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3359  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  28.42 
 
 
206 aa  84.7  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0950071 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44580  nudix hydrolase, YffH family  33.33 
 
 
205 aa  84.3  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.286548  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3047  ADP-ribose diphosphatase  30.16 
 
 
204 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000114185  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5700  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  36.42 
 
 
205 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65710  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  36.42 
 
 
205 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004521  ADP-ribose pyrophosphatase  31.94 
 
 
216 aa  82.4  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000302738  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3447  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  30.53 
 
 
210 aa  82  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3558  NUDIX hydrolase  31.77 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.324606  normal  0.411557 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2991  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 
204 aa  81.6  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2012  MutT/nudix family protein  31.05 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000517661  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0608  NUDIX hydrolase  35.06 
 
 
199 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3903  MutT/nudix family protein  27.89 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0807  NUDIX hydrolase  28.49 
 
 
200 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000627891  hitchhiker  0.0000000000549987 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03689  ADP-ribose pyrophosphatase  28 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000876457  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0782  NUDIX hydrolase  28.49 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000245239  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0754  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  28.42 
 
 
203 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0370949  hitchhiker  0.0055541 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0769  ADP-ribose diphosphatase  29.79 
 
 
200 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0814  NUDIX hydrolase  28.49 
 
 
200 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00725628  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3577  NUDIX hydrolase  28.49 
 
 
200 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368158  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1525  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  32.35 
 
 
210 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.411844  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3776  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  29.32 
 
 
211 aa  79.7  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>