More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0735 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0735  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 193 aa  398  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0971  NUDIX hydrolase  91.62 
 
 		 193 aa  366  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.820775  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3294  NUDIX hydrolase  84.46 
 
 		 194 aa  347  4e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.389654  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3214  NUDIX hydrolase  81.05 
 
 		 191 aa  333  1e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.157336  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3483  NUDIX hydrolase  74.19 
 
 		 191 aa  295  4e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.142952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2613  NUDIX family hydrolase  65.57 
 
 		 191 aa  256  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.819816 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02358  predicted NUDIX hydrolase  65.03 
 
 		 191 aa  256  2e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1203  NUDIX hydrolase  65.03 
 
 		 191 aa  256  2e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02320  hypothetical protein  65.03 
 
 		 191 aa  256  2e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1210  NUDIX hydrolase  65.03 
 
 		 191 aa  256  2e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2596  NUDIX family hydrolase  65.03 
 
 		 191 aa  256  2e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2746  NUDIX family hydrolase  65.03 
 
 		 191 aa  255  3e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3688  hydrolase, NUDIX family  65.03 
 
 		 191 aa  255  3e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2835  hydrolase, NUDIX family  65.03 
 
 		 191 aa  255  3e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2962  NUDIX hydrolase  61.78 
 
 		 191 aa  251  5.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.510189 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2670  putative hydrolase YffH  62.84 
 
 		 191 aa  246  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2843  putative hydrolase YffH  62.84 
 
 		 191 aa  246  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2621  putative hydrolase YffH  62.84 
 
 		 191 aa  246  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2710  putative hydrolase YffH  62.84 
 
 		 191 aa  246  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2736  putative hydrolase YffH  62.84 
 
 		 191 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.738659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1390  NUDIX hydrolase  68.82 
 
 		 198 aa  242  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.136474  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1276  NUDIX family hydrolase  68.82 
 
 		 198 aa  242  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2787  NUDIX family hydrolase  68.82 
 
 		 198 aa  242  1.9999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0175603 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3936  NUDIX hydrolase  57.59 
 
 		 195 aa  234  8e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1170  NUDIX hydrolase  58.73 
 
 		 193 aa  231  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3674  NUDIX hydrolase  59.67 
 
 		 199 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.569185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0621  hypothetical protein  57.37 
 
 		 224 aa  221  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2220  NUDIX hydrolase  56.45 
 
 		 194 aa  220  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0391514  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0740  NUDIX hydrolase  56.98 
 
 		 196 aa  219  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6151  NUDIX hydrolase  54.92 
 
 		 193 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.389113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1164  hypothetical protein  57.53 
 
 		 195 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2947  NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes  57.53 
 
 		 195 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.78552  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0273  hypothetical protein  57.53 
 
 		 195 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2793  NUDIX family hydrolase  57.53 
 
 		 195 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4950  NUDIX hydrolase  59.34 
 
 		 195 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17081  normal  0.0998667 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3265  NUDIX hydrolase  57.07 
 
 		 195 aa  209  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1763  hypothetical protein  56.38 
 
 		 198 aa  209  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00769782  normal  0.0120574 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0463  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  56.22 
 
 		 199 aa  207  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0942  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  56.22 
 
 		 199 aa  207  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0904  NUDIX hydrolase  56.22 
 
 		 199 aa  207  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.682548 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4044  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  57.3 
 
 		 199 aa  207  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0802  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  56.76 
 
 		 201 aa  207  7e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2260  NUDIX hydrolase  61.11 
 
 		 198 aa  203  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.229118  hitchhiker  0.000399165 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2191  NUDIX hydrolase  52.43 
 
 		 199 aa  200  9e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3332  NUDIX hydrolase  54.89 
 
 		 202 aa  199  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5088  NUDIX hydrolase  56.04 
 
 		 200 aa  198  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2291  NUDIX hydrolase  54.35 
 
 		 201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.259047  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4842  NUDIX hydrolase  55.43 
 
 		 195 aa  196  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2384  hypothetical protein  52.91 
 
 		 193 aa  194  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.227212  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3567  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  53.37 
 
 		 196 aa  186  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01200  protein containing C-terminal region of TrgB protein  53.98 
 
 		 236 aa  181  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2697  NUDIX hydrolase  52.15 
 
 		 335 aa  180  9.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2255  NUDIX hydrolase  49.74 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0219  hypothetical protein  42.71 
 
 		 192 aa  171  3.9999999999999995e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.170349  normal  0.191205 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3473  NUDIX hydrolase  50.84 
 
 		 201 aa  166  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.672777  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0790  NUDIX hydrolase  48.9 
 
 		 198 aa  164  6.9999999999999995e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14892  normal  0.428027 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1566  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  45.45 
 
 		 194 aa  160  8.000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1092  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 		 196 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0217104  hitchhiker  0.00264715 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0862  NUDIX hydrolase  45.7 
 
 		 193 aa  157  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102995  normal  0.491513 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1238  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 		 197 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0804984  hitchhiker  0.0000559773 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0324  NUDIX hydrolase  45.81 
 
 		 209 aa  147  8e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0106053  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7290  NUDIX hydrolase  36.98 
 
 		 204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0864  NUDIX hydrolase  36.93 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426746  normal  0.334935 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0904  NUDIX hydrolase  36.93 
 
 		 188 aa  105  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0381833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0832  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 188 aa  104  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.341274  normal  0.656048 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2012  MutT/nudix family protein  36.41 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000517661  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5218  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 		 195 aa  101  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0105  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 		 201 aa  102  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5997  NUDIX hydrolase  35.87 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0431  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  33.68 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000737623  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0726  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  33.7 
 
 		 203 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0027035  hitchhiker  0.000778949 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2991  NUDIX hydrolase  34.05 
 
 		 204 aa  95.1  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4194  ADP-ribose diphosphatase  33.15 
 
 		 200 aa  94  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.105257  hitchhiker  0.00339235 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0775  ADP-ribose diphosphatase  34.25 
 
 		 204 aa  93.2  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000156265  unclonable  0.0000000000726693 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0545  ADP-ribose diphosphatase  31.49 
 
 		 202 aa  91.3  7e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3235  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  32.6 
 
 		 203 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00707793  hitchhiker  0.00000215101 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004521  ADP-ribose pyrophosphatase  33.7 
 
 		 216 aa  90.9  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000302738  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5388  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 		 191 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0754  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  33.15 
 
 		 203 aa  90.1  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0370949  hitchhiker  0.0055541 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3447  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  30.94 
 
 		 210 aa  89.4  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3331  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  31.91 
 
 		 208 aa  89.7  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0444683  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3682  UDP-sugar diphosphatase  35.48 
 
 		 190 aa  88.6  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0514  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 		 189 aa  87.8  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0222532  hitchhiker  0.000757753 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3903  MutT/nudix family protein  32.6 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02906  ADP-ribose pyrophosphatase  30.39 
 
 		 209 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0666  ADP-ribose diphosphatase  30.39 
 
 		 209 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4348  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  30.39 
 
 		 209 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3212  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  30.39 
 
 		 209 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00741682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0663  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  30.39 
 
 		 209 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.16672  normal  0.0141721 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3329  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  30.39 
 
 		 209 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.746955 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02856  hypothetical protein  30.39 
 
 		 209 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3498  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  30.39 
 
 		 209 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0634708  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3467  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  30.39 
 
 		 209 aa  85.5  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0321029  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3359  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  32.6 
 
 		 206 aa  85.5  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0950071 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0782  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 		 200 aa  85.5  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000245239  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0807  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 		 200 aa  85.1  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000627891  hitchhiker  0.0000000000549987 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0814  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 		 200 aa  85.1  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00725628  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3577  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 		 200 aa  85.1  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368158  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3661  UDP-sugar diphosphatase  34.84 
 
 		 190 aa  85.1  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3558  NUDIX hydrolase  30.21 
 
 		 206 aa  85.1  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.324606  normal  0.411557 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>