295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0688 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0688  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 189 aa  373  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653338  normal  0.751646 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0514  NUDIX hydrolase  72.87 
 
 		 189 aa  237  6.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0222532  hitchhiker  0.000757753 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7290  NUDIX hydrolase  55.08 
 
 		 204 aa  202  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0832  NUDIX hydrolase  56.91 
 
 		 188 aa  197  6e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.341274  normal  0.656048 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5388  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 191 aa  190  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0864  NUDIX hydrolase  55.23 
 
 		 188 aa  189  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426746  normal  0.334935 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0904  NUDIX hydrolase  54.65 
 
 		 188 aa  188  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0381833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5441  NUDIX hydrolase  54.35 
 
 		 191 aa  185  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.391972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5997  NUDIX hydrolase  51.09 
 
 		 199 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1238  NUDIX hydrolase  38.32 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0804984  hitchhiker  0.0000559773 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1092  NUDIX hydrolase  37.13 
 
 		 196 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0217104  hitchhiker  0.00264715 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1566  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  33.52 
 
 		 194 aa  105  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0790  NUDIX hydrolase  38.31 
 
 		 198 aa  105  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14892  normal  0.428027 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2384  hypothetical protein  38.19 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.227212  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6151  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.389113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3332  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 		 202 aa  99.4  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0621  hypothetical protein  40.14 
 
 		 224 aa  97.8  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1170  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 		 193 aa  97.4  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4950  NUDIX hydrolase  32.96 
 
 		 195 aa  97.1  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17081  normal  0.0998667 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02358  predicted NUDIX hydrolase  36.88 
 
 		 191 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2613  NUDIX family hydrolase  36.88 
 
 		 191 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.819816 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1210  NUDIX hydrolase  36.88 
 
 		 191 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1203  NUDIX hydrolase  36.88 
 
 		 191 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02320  hypothetical protein  36.88 
 
 		 191 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2596  NUDIX family hydrolase  36.88 
 
 		 191 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2746  NUDIX family hydrolase  36.88 
 
 		 191 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2835  hydrolase, NUDIX family  36.88 
 
 		 191 aa  95.9  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0324  NUDIX hydrolase  35.93 
 
 		 209 aa  95.9  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0106053  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3688  hydrolase, NUDIX family  36.88 
 
 		 191 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2220  NUDIX hydrolase  35.86 
 
 		 194 aa  95.5  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0391514  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1763  hypothetical protein  31.18 
 
 		 198 aa  95.1  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00769782  normal  0.0120574 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3674  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 199 aa  94.7  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.569185 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3483  NUDIX hydrolase  34.74 
 
 		 191 aa  93.2  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.142952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2947  NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes  35.42 
 
 		 195 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.78552  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1164  hypothetical protein  35.42 
 
 		 195 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2793  NUDIX family hydrolase  35.42 
 
 		 195 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0273  hypothetical protein  35.42 
 
 		 195 aa  93.6  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3265  NUDIX hydrolase  34.84 
 
 		 195 aa  92.4  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2255  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 		 198 aa  92.4  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0971  NUDIX hydrolase  32.02 
 
 		 193 aa  92  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.820775  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3936  NUDIX hydrolase  35.86 
 
 		 195 aa  91.3  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0735  NUDIX hydrolase  35.67 
 
 		 193 aa  90.9  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2191  NUDIX hydrolase  33.55 
 
 		 199 aa  90.1  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3294  NUDIX hydrolase  36.55 
 
 		 194 aa  90.1  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.389654  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2843  putative hydrolase YffH  36.02 
 
 		 191 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2670  putative hydrolase YffH  36.6 
 
 		 191 aa  89  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2621  putative hydrolase YffH  36.02 
 
 		 191 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2710  putative hydrolase YffH  36.02 
 
 		 191 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5088  NUDIX hydrolase  34.93 
 
 		 200 aa  89.4  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0862  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 193 aa  89  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102995  normal  0.491513 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2736  putative hydrolase YffH  36.02 
 
 		 191 aa  89  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.738659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0740  NUDIX hydrolase  32.45 
 
 		 196 aa  88.2  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0463  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  36.84 
 
 		 199 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0942  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  36.84 
 
 		 199 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0904  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 199 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.682548 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2260  NUDIX hydrolase  34.87 
 
 		 198 aa  85.9  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.229118  hitchhiker  0.000399165 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0802  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  34.19 
 
 		 201 aa  85.1  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3214  NUDIX hydrolase  36.55 
 
 		 191 aa  84.7  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.157336  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4044  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  36.18 
 
 		 199 aa  84.7  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2962  NUDIX hydrolase  34.39 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.510189 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4842  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3224  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  35.48 
 
 		 207 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000886574  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  38.82 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2291  NUDIX hydrolase  36.55 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.259047  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44580  nudix hydrolase, YffH family  42.06 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.286548  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1377  NUDIX hydrolase  34.57 
 
 		 196 aa  77.8  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.340086  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  37.97 
 
 		 178 aa  77.8  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3331  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  40.65 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0444683  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01200  protein containing C-terminal region of TrgB protein  34.48 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0219  hypothetical protein  31.54 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.170349  normal  0.191205 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0545  ADP-ribose diphosphatase  36.22 
 
 		 202 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3567  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  34.03 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3473  NUDIX hydrolase  31.29 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.672777  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3562  NUDIX hydrolase  32.46 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  34.57 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3047  ADP-ribose diphosphatase  35.86 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000114185  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03689  ADP-ribose pyrophosphatase  36.29 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000876457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0820  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 		 361 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.397397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5700  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  38.22 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2146  tellurite resistance protein  35.85 
 
 		 361 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65710  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  38.22 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0608  NUDIX hydrolase  37.58 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1355  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  32.63 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.127377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0804  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1063  ADP-ribose diphosphatase  32.82 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0495  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  37.66 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0431  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  31.29 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000737623  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0818  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 		 362 aa  68.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2991  NUDIX hydrolase  33.7 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2012  MutT/nudix family protein  33.95 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000517661  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3235  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  30.97 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00707793  hitchhiker  0.00000215101 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4973  mutT/nudix family protein  32.73 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3860  NUDIX hydrolase  34.27 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1525  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  36.99 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.411844  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0754  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  31.65 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0370949  hitchhiker  0.0055541 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0547  hypothetical protein  33.77 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0775  ADP-ribose diphosphatase  33.59 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000156265  unclonable  0.0000000000726693 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>