21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2608 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2608  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  162  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2812  hypothetical protein  85.71 
 
 		 75 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1811  NUDIX hydrolase  69.01 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2195  NUDIX hydrolase  54.84 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2547  NUDIX hydrolase  45.59 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2614  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2270  NUDIX hydrolase  46.27 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.792713 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2817  NUDIX hydrolase  43.66 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.30538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5523  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  45.16 
 
 		 257 aa  63.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00475491  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0900  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1992  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0853  normal  0.178194 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1355  putative MutT-family protein  38.03 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3237  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778002  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2346  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21040  ADP-ribose pyrophosphatase  44.23 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2246  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 168 aa  45.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171331  decreased coverage  0.0000730626 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1297  NUDIX hydrolase  46.51 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2398  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10425  normal  0.260078 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3844  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1257  NUDIX hydrolase  38.3 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2666  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 182 aa  40  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.167572 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>