248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2346 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2346  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 157 aa  311  1.9999999999999998e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2614  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2817  NUDIX hydrolase  39.73 
 
 		 147 aa  111  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.30538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0900  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 145 aa  103  8e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2547  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 143 aa  101  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3237  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 		 177 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778002  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1257  NUDIX hydrolase  42.64 
 
 		 146 aa  94.7  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5523  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  44.94 
 
 		 257 aa  94.4  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00475491  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1992  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 		 145 aa  94  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0853  normal  0.178194 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1355  putative MutT-family protein  44.64 
 
 		 118 aa  92.4  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2270  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 		 174 aa  91.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.792713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1811  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 145 aa  89  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2666  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2398  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10425  normal  0.260078 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2195  NUDIX hydrolase  39.69 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2406  putative Nudix hydrolase family protein  35.16 
 
 		 149 aa  77  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1297  NUDIX hydrolase  35.06 
 
 		 182 aa  74.3  0.0000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21040  ADP-ribose pyrophosphatase  34.06 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2246  NUDIX hydrolase  32.87 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171331  decreased coverage  0.0000730626 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5041  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.216707 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09350  dihydrofolate reductase  32.67 
 
 		 337 aa  58.5  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.32591  normal  0.990964 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0575  MutT/nudix family protein  32.61 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3844  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0146  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.81 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.39 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0153  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.59 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.81 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97066  hitchhiker  0.00538151 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0645  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.71 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.62648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.81 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0349436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  36.13 
 
 		 314 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  36.57 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.82 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0154  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.8 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000120622  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2431  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00584965  normal  0.262781 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1495  NUDIX hydrolase  33.02 
 
 		 163 aa  52.4  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.183085 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  33.33 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0673  NUDIX hydrolase  36.29 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.612507  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  37.14 
 
 		 314 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  39 
 
 		 315 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0107  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.09 
 
 		 132 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000992989  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  36.19 
 
 		 314 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3465  NUDIX hydrolase  33.02 
 
 		 163 aa  50.8  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.592671  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  36.19 
 
 		 314 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2458  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0101  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.25 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708829  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0241  NUDIX hydrolase  37.72 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.270437 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  35.42 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.013842 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00100  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase, marked preference for dGTP  30.25 
 
 		 129 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.126012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3501  mutator MutT protein  30.25 
 
 		 129 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0105  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.25 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000458525  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.75 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2765  NUDIX hydrolase  31.07 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000522672  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1522  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  31.07 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.596031  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0104  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.25 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000574829  normal  0.261189 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2686  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  31.07 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310131  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00099  hypothetical protein  30.25 
 
 		 129 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146865  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3558  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.25 
 
 		 129 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.016637  hitchhiker  0.00136766 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  36.23 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06029  ADP-ribose pyrophosphatase MutT  33.88 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4127  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1901  NUDIX hydrolase  54.17 
 
 		 231 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  31.86 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2812  hypothetical protein  31.82 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1479  NUDIX hydrolase  30.65 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142432  hitchhiker  0.00620383 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  38.2 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2925  mutT/nudix family protein  26.32 
 
 		 164 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.38475e-24 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1584  mutT/nudix family protein  31.58 
 
 		 147 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0325451 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 		 132 aa  48.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  33.33 
 
 		 132 aa  48.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  31.37 
 
 		 312 aa  47.8  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 299 aa  47.8  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  32.71 
 
 		 132 aa  47.4  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  35.05 
 
 		 319 aa  47  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 		 155 aa  47.4  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3231  NUDIX hydrolase  25.41 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2718  mutT/nudix family protein  25.66 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2669  MutT/Nudix family protein  25.66 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277246  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36090  ADP-ribose pyrophosphatase  49.23 
 
 		 229 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453332  normal  0.430111 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2175  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.523963 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  35.9 
 
 		 129 aa  47  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0830  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 		 291 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2608  hypothetical protein  32.2 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0212  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 		 186 aa  46.6  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.465676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2926  mutT/nudix family protein  25.66 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  37.21 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  31.48 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0093  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30 
 
 		 129 aa  47  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000316081  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  31.73 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.28 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.28 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2056  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000128394 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.28 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  33.33 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1198  NUDIX hydrolase  35.64 
 
 		 201 aa  46.2  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.639623  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2716  MutT/NUDIX family protein  33.94 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  34.74 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  29.93 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>