69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3465 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3465  NUDIX hydrolase  100 
 
 
163 aa  335  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.592671  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1495  NUDIX hydrolase  93.87 
 
 
163 aa  317  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183085 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1427  NUDIX hydrolase  64.97 
 
 
165 aa  213  9e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.145192  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00925  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  57.32 
 
 
162 aa  204  5e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.14238  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2419  NUDIX hydrolase  60 
 
 
162 aa  199  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.217512 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0596  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  58.39 
 
 
166 aa  196  7.999999999999999e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.237906  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0551  NUDIX hydrolase  57.76 
 
 
162 aa  192  1e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.788688  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0065  NUDIX hydrolase  55.97 
 
 
163 aa  191  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.783309 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3582  NUDIX hydrolase  39.87 
 
 
154 aa  106  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1099  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  34.68 
 
 
160 aa  82  0.000000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000230167  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1427  NUDIX hydrolase  30.61 
 
 
151 aa  80.5  0.000000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1196  mutator MutT protein  34.68 
 
 
160 aa  79.3  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0076  NUDIX hydrolase  29.94 
 
 
167 aa  65.5  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000742195  normal  0.603343 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3203  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 
182 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1041  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 
154 aa  57.4  0.00000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.317547  n/a   
 
 
-
 
NC_007106  pE33L80004  phosphohydrolase, MutT/Nudix family protein  27.19 
 
 
161 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0623  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 
167 aa  56.6  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1888  mutT/nudix family protein  28.32 
 
 
161 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0131213  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1627  MutT/Nudix family protein  29.2 
 
 
161 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000898193  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29340  predicted protein  35.42 
 
 
184 aa  54.7  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.914315 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0028  NUDIX hydrolase  26.8 
 
 
155 aa  54.3  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1681  mutT/nudix family protein  29.13 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000627508  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2158  mutT/nudix family protein  31.25 
 
 
174 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1861  mutT/nudix family protein  29.13 
 
 
161 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01503e-50 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1816  mutT/nudix family protein  29.13 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000181059  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1937  mutT/nudix family protein  28.32 
 
 
161 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000234527  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2346  NUDIX hydrolase  33.02 
 
 
157 aa  50.8  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1680  NUDIX hydrolase  27.43 
 
 
161 aa  50.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3077  phosphohydrolase  30.36 
 
 
180 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.848469  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36667  predicted protein  35.71 
 
 
185 aa  50.1  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.179207 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2524  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 
192 aa  50.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.736999  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1217  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 
198 aa  48.9  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00806683  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1662  MutT/Nudix family protein  27.43 
 
 
161 aa  48.9  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.824241  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1377  NUDIX hydrolase  25.32 
 
 
171 aa  48.5  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.054711  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1826  phosphohydrolase  27.18 
 
 
161 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2971  NUDIX hydrolase  28.8 
 
 
153 aa  48.1  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000073091  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3516  phosphohydrolase  27.27 
 
 
145 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1903  NUDIX hydrolase  27.67 
 
 
164 aa  47  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3110  MutT/nudix family protein  31.07 
 
 
176 aa  47  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0202445  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1867  NUDIX hydrolase  34.74 
 
 
183 aa  46.6  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3109  mutT/nudix family protein  31.07 
 
 
192 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2839  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  29.46 
 
 
174 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00481979  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1070  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000247956  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2799  MutT/Nudix family protein  30.1 
 
 
174 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02760  conserved hypothetical protein  26.87 
 
 
248 aa  45.1  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3349  MutT/nudix family protein  23.42 
 
 
162 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0869  NUDIX hydrolase  30 
 
 
148 aa  45.1  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.11667  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  26.92 
 
 
153 aa  44.7  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3148  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
155 aa  44.7  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2861  NUDIX hydrolase  31.07 
 
 
174 aa  43.9  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197962  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  29.7 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  30.69 
 
 
134 aa  43.9  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1456  MutT/nudix family protein  28.28 
 
 
154 aa  43.1  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000100507  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  31.18 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2689  NUDIX hydrolase  26.75 
 
 
180 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.392631  normal  0.210374 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  22 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  31.91 
 
 
133 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0205  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  36.49 
 
 
338 aa  42.4  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.445871 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  33.04 
 
 
315 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  26.89 
 
 
149 aa  42  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1297  NUDIX hydrolase  32.99 
 
 
182 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1843  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 
162 aa  41.6  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06890  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  31.76 
 
 
343 aa  41.6  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.791391  normal  0.0533981 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0862  NUDIX family hydrolase  34.62 
 
 
147 aa  41.2  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000267263  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1522  NUDIX hydrolase  26.67 
 
 
163 aa  41.2  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467089  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0122  NUDIX hydrolase  23.47 
 
 
150 aa  41.2  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.151364  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3090  phosphohydrolase, MutT/Nudix family  30.93 
 
 
157 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2869  NUDIX domain-containing protein  25.34 
 
 
159 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218254  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1522  NUDIX hydrolase  27.21 
 
 
160 aa  40.4  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000261274 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>