More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0241 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0241  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 157 aa  310  3.9999999999999997e-84  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.270437 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0079  NUDIX hydrolase  68.79 
 
 		 157 aa  210  5.999999999999999e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.886246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2205  NUDIX hydrolase  72.61 
 
 		 157 aa  206  9e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.453063 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1011  NUDIX hydrolase  68.79 
 
 		 157 aa  186  1e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000869089 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0595  NUDIX hydrolase  42.55 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.652543 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0855  NUDIX hydrolase  37.27 
 
 		 179 aa  94.4  5e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0906  NUDIX hydrolase  40.82 
 
 		 159 aa  92.8  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000252658  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2461  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2953  NUDIX hydrolase  31.68 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1199  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1273  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1265  NUDIX hydrolase  30.4 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  33.07 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0421  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 233 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.218959  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0080  NUDIX hydrolase  33.75 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1464  mutT/nudix family protein  33.96 
 
 		 198 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0721  NUDIX hydrolase  33.97 
 
 		 234 aa  57  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2393  NUDIX hydrolase  30.12 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.024172  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2902  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00219034  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0279  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.113972  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0265  NUDIX hydrolase  28.92 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.306188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4317  NUDIX hydrolase  35.47 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0239  hypothetical protein  30.63 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36090  ADP-ribose pyrophosphatase  31.47 
 
 		 229 aa  54.7  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453332  normal  0.430111 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1010  NUDIX hydrolase  31.1 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79985  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1901  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 231 aa  54.7  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1193  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 196 aa  54.3  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253169  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2465  NUDIX hydrolase  29.79 
 
 		 288 aa  54.3  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316655 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 		 243 aa  54.3  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0694  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 		 214 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.496821  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1626  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 197 aa  52.4  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706755  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  43.08 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1198  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 		 201 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.639623  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  45.21 
 
 		 244 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4757  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 		 231 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0108621  hitchhiker  0.0018252 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39620  NUDIX hydrolase  31.18 
 
 		 200 aa  52.4  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2642  NUDIX hydrolase  30.05 
 
 		 207 aa  51.6  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3018  NUDIX hydrolase  34 
 
 		 208 aa  51.6  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391362  normal  0.0253624 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0415  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 		 154 aa  51.6  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 223 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4166  NUDIX hydrolase  40.2 
 
 		 199 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0778  NUDIX hydrolase  30.26 
 
 		 200 aa  51.2  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4241  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 		 219 aa  51.2  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0685  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 		 235 aa  51.2  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.997472 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 		 142 aa  51.2  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3526  NUDIX hydrolase  31.79 
 
 		 187 aa  51.2  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10636  NUDIX family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07260)  34.86 
 
 		 448 aa  50.8  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  32.17 
 
 		 147 aa  50.8  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0176  NUDIX hydrolase  43.84 
 
 		 196 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4268  NUDIX hydrolase  39.22 
 
 		 210 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127218  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1453  NUDIX hydrolase  39.22 
 
 		 199 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.237622 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4112  NUDIX hydrolase  45.9 
 
 		 219 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0690871  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1058  NUDIX hydrolase  39.22 
 
 		 199 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  43.84 
 
 		 222 aa  50.4  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  24.66 
 
 		 199 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0596  mutT/nudix family protein  30.77 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000504952  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  37.86 
 
 		 226 aa  50.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2346  NUDIX hydrolase  37.72 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1364  hypothetical protein  30.54 
 
 		 203 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2354  hypothetical protein  29.87 
 
 		 199 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.921184  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0165  NUDIX hydrolase  43.84 
 
 		 196 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1637  hypothetical protein  29.87 
 
 		 199 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2450  hypothetical protein  29.87 
 
 		 199 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  32.53 
 
 		 267 aa  49.7  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09303  hypothetical protein  29.27 
 
 		 213 aa  48.9  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.231725  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0158  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 		 196 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.226319  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 		 235 aa  49.7  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1017  NUDIX hydrolase  45 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.803103  normal  0.224803 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0094  NUDIX hydrolase  30.58 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.126747  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0164  NUDIX hydrolase  31.79 
 
 		 196 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.410349  normal  0.0427805 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0578  mutT/nudix family protein  32.48 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1466  ADP-Ribose Pyrophosphatase  43.86 
 
 		 146 aa  48.5  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1169  NUDIX hydrolase  44.07 
 
 		 138 aa  48.5  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0985  NUDIX hydrolase  41.43 
 
 		 211 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.585985  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1929  hypothetical protein  31.41 
 
 		 197 aa  48.5  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2644  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 		 213 aa  48.5  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  35.09 
 
 		 138 aa  48.5  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15860  hypothetical protein  29.94 
 
 		 203 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0480396 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1991  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 213 aa  48.5  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0028  NUDIX hydrolase  32.99 
 
 		 155 aa  48.1  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0521  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 254 aa  48.1  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  38.78 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2809  hypothetical protein  30 
 
 		 192 aa  48.1  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0727  NUDIX hydrolase  29.94 
 
 		 210 aa  48.1  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1041  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 		 154 aa  48.1  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.317547  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1061  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 179 aa  47.8  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0788  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 220 aa  47.8  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3377  MutT/Nudix family protein  27.78 
 
 		 147 aa  47.8  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2431  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 		 132 aa  47.8  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00584965  normal  0.262781 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1697  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 		 158 aa  47.4  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0101183  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0511  mutT/nudix family protein  29.91 
 
 		 164 aa  47.4  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0633443  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3409  NUDIX hydrolase  29.66 
 
 		 201 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.227802  normal  0.542448 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0450  MutT/NUDIX family protein  29.91 
 
 		 164 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290469  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0542  mutT/nudix family protein  29.91 
 
 		 164 aa  47.4  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000238457  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4735  NUDIX hydrolase  28.83 
 
 		 187 aa  47.4  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0687682  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>