More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0595 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0595  NUDIX hydrolase  100 
 
 
156 aa  329  1e-89  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.652543 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0906  NUDIX hydrolase  48.55 
 
 
159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000252658  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0241  NUDIX hydrolase  42.55 
 
 
157 aa  96.7  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.270437 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0079  NUDIX hydrolase  40.43 
 
 
157 aa  86.3  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.886246  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2953  NUDIX hydrolase  34.18 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0265  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 
200 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.306188  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2902  NUDIX hydrolase  30 
 
 
219 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00219034  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2205  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.453063 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1011  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000869089 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3159  mutT/nudix family protein  30.13 
 
 
184 aa  63.9  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  41.98 
 
 
171 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0080  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 
195 aa  62.4  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2461  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 
199 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442515  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  40.86 
 
 
171 aa  61.6  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1199  NUDIX hydrolase  29.38 
 
 
178 aa  60.8  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0279  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 
196 aa  60.5  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.113972  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  40.86 
 
 
171 aa  60.5  0.000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  39.76 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0855  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 
179 aa  59.7  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  30.72 
 
 
199 aa  58.2  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  36.79 
 
 
159 aa  57.4  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  36.79 
 
 
159 aa  57.4  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  35.92 
 
 
155 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
139 aa  57  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2574  NUDIX hydrolase  30.82 
 
 
195 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.536286  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
269 aa  54.3  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2628  NUDIX hydrolase  28.65 
 
 
200 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.130048  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  34.55 
 
 
137 aa  53.9  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  28.14 
 
 
197 aa  53.9  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 
303 aa  53.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  32.46 
 
 
153 aa  53.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0533  NUDIX hydrolase  24.57 
 
 
202 aa  53.1  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0466336  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2809  hypothetical protein  31.33 
 
 
192 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  35.87 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1918  NUDIX hydrolase  29.86 
 
 
188 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.63498  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  40.23 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4759  NUDIX hydrolase  32.71 
 
 
203 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.420324 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4267  hydrolase, NUDIX family  39.74 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.555582  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0967  hydrolase, NUDIX family  39.74 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00369926  normal  0.920839 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2462  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 
314 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1193  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 
196 aa  52.8  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253169  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  30.54 
 
 
238 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2644  NUDIX hydrolase  28.48 
 
 
213 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
147 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10636  NUDIX family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07260)  51.02 
 
 
448 aa  51.6  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183785  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  40.62 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0815  NUDIX hydrolase  28.39 
 
 
190 aa  51.6  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1061  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 
179 aa  51.6  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  30.97 
 
 
199 aa  51.2  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4290  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
300 aa  51.2  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  44.64 
 
 
147 aa  50.8  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 
132 aa  50.8  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4178  hydrolase, NUDIX family  39.74 
 
 
154 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0036026 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3901  MutT/Nudix family protein  39.74 
 
 
154 aa  50.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267829  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3909  MutT/Nudix family protein  39.74 
 
 
154 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0016299  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2642  NUDIX hydrolase  29.94 
 
 
207 aa  50.8  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
154 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4229  mutT/nudix family protein  38.46 
 
 
154 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000345145  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4063  mutT/nudix family protein  39.74 
 
 
141 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000339826  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3498  NAD(+) diphosphatase  32.14 
 
 
310 aa  50.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.158806  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  41.94 
 
 
149 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4380  mutT/nudix family protein  39.74 
 
 
141 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000407544  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  38.03 
 
 
236 aa  49.7  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4287  hydrolase, NUDIX family  38.46 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000426319  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  30.33 
 
 
155 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1506  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 
390 aa  50.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  30.33 
 
 
155 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  41.94 
 
 
149 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1017  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
144 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.803103  normal  0.224803 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  41.94 
 
 
149 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  41.94 
 
 
149 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1138  NUDIX hydrolase  30 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  33.76 
 
 
199 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  41.94 
 
 
149 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36090  ADP-ribose pyrophosphatase  28.39 
 
 
229 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453332  normal  0.430111 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1295  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 
241 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142759  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  41.94 
 
 
149 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0963  NUDIX hydrolase  28.44 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0985  NUDIX hydrolase  28.28 
 
 
211 aa  48.9  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.585985  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2465  NUDIX hydrolase  29.75 
 
 
288 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.316655 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 
229 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 
147 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2831  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  42.37 
 
 
153 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0396301  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3974  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 
169 aa  48.9  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6007  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 
165 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2852  NUDIX hydrolase  39.74 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000177474  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0468  NUDIX hydrolase  25.93 
 
 
202 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0503  putative mutator mutt protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  41.94 
 
 
137 aa  48.9  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.213775 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3018  NUDIX hydrolase  47.46 
 
 
208 aa  48.5  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391362  normal  0.0253624 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  37.66 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  30.17 
 
 
155 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  41.94 
 
 
334 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  40.68 
 
 
142 aa  48.5  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  30.17 
 
 
155 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28290  hypothetical protein  34.23 
 
 
136 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00379954  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 
149 aa  48.5  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  30.17 
 
 
155 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>