More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3746 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 142 aa  292  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  95.77 
 
 		 142 aa  279  8.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  77.7 
 
 		 147 aa  223  5.0000000000000005e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  75.54 
 
 		 147 aa  221  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  66.19 
 
 		 144 aa  196  9e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  67.15 
 
 		 179 aa  192  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0229  NUDIX hydrolase  72.66 
 
 		 153 aa  184  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  38.54 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  30.57 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  37.07 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  38.05 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1303  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  34.45 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0094  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 		 170 aa  67  0.00000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.126747  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2534  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  29.58 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1950  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666959  hitchhiker  0.00341622 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2447  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000652481  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0473  protein of unknown function DUF1152  33.9 
 
 		 530 aa  65.5  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 167 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 167 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  33.96 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2065  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  34.75 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  33.96 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1657  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.809555  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  33.96 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2157  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  34.65 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2201  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2289  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  32.86 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0727  NUDIX/MutT family protein  37.63 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.371838  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  36.13 
 
 		 347 aa  62  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  35.65 
 
 		 473 aa  61.6  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  30.56 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0716  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.343449 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  34.62 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  31.43 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  34.26 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  33.02 
 
 		 163 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1988  NUDIX hydrolase  32.85 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0344946  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2360  putative mutator MutT protein  33.33 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2595  NUDIX hydrolase  41.3 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  50.72 
 
 		 291 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3528  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.321169  normal  0.283085 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2429  mutT like protein  30.91 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3208  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  32.29 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  41.56 
 
 		 181 aa  57.4  0.00000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  34.48 
 
 		 313 aa  57.4  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  40 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  29.77 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  29.32 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  39.24 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  39.24 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  41.89 
 
 		 138 aa  57  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4267  hydrolase, NUDIX family  27.13 
 
 		 154 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.555582  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4221  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 315 aa  57  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292609  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5502  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 		 134 aa  57  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2310  NUDIX hydrolase  32.33 
 
 		 138 aa  57  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  29.23 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  31.88 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1522  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.241436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  32.54 
 
 		 386 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3595  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00459276  normal  0.106205 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>