More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3528 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3528  NUDIX hydrolase  100 
 
 
138 aa  276  7e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.321169  normal  0.283085 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2447  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 
129 aa  103  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000652481  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1170  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
137 aa  98.2  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  0.0271169 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0870  mutator mutT protein  38.89 
 
 
137 aa  94.4  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  46.83 
 
 
151 aa  89.4  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 
131 aa  89  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  45.67 
 
 
132 aa  88.6  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  40.65 
 
 
153 aa  87.8  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  44.88 
 
 
132 aa  87  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  44.88 
 
 
132 aa  87  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  42.31 
 
 
142 aa  87  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  42.31 
 
 
137 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2360  putative mutator MutT protein  40 
 
 
150 aa  85.1  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  43.85 
 
 
138 aa  84.7  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  43.85 
 
 
138 aa  84.7  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5502  NUDIX hydrolase  38.76 
 
 
134 aa  84.3  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  44.8 
 
 
133 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  41.98 
 
 
138 aa  84  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  42.4 
 
 
129 aa  83.6  9e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  41.09 
 
 
135 aa  83.2  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  41.86 
 
 
318 aa  82.8  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  42.86 
 
 
138 aa  83.2  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 
154 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  42.4 
 
 
137 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  44.8 
 
 
133 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  39.23 
 
 
131 aa  82.4  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  37.3 
 
 
132 aa  82  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  44.63 
 
 
136 aa  81.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  43.2 
 
 
133 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  43.97 
 
 
138 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  38.89 
 
 
138 aa  80.5  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  41.98 
 
 
134 aa  80.1  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  42.06 
 
 
150 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0787  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 
128 aa  79.3  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.585292  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  40.94 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  33.33 
 
 
136 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  34.85 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  44.74 
 
 
146 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  40.34 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  33.07 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  39.23 
 
 
135 aa  78.2  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 
134 aa  77.8  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  38.21 
 
 
141 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  39.37 
 
 
132 aa  77.4  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  40 
 
 
137 aa  77  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
133 aa  77  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1921  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 
133 aa  77  0.00000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.11755  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  42.98 
 
 
138 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  40.32 
 
 
314 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  42.98 
 
 
138 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  43.97 
 
 
135 aa  75.9  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  40.32 
 
 
314 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  39.02 
 
 
316 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  40.32 
 
 
314 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  39.68 
 
 
128 aa  75.1  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  40.48 
 
 
347 aa  75.1  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  39.84 
 
 
315 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  37.29 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  38.46 
 
 
136 aa  74.7  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
126 aa  74.7  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  38.4 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  37.6 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  39.84 
 
 
315 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  33.33 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  32.54 
 
 
129 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2201  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  39.84 
 
 
314 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  39.02 
 
 
313 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  38.21 
 
 
314 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2289  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 
132 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 
138 aa  73.6  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  32.81 
 
 
130 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 
133 aa  72.8  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  33.58 
 
 
132 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1657  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 
132 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.809555  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  39.52 
 
 
313 aa  73.2  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  36.59 
 
 
316 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
137 aa  72  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 
135 aa  72  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  32.03 
 
 
132 aa  72  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  32.03 
 
 
132 aa  72  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0325  NUDIX hydrolase  39.34 
 
 
129 aa  72  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.626146 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2065  NUDIX hydrolase  37.6 
 
 
129 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  40.48 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3395  mutator mutT protein  31.01 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  32.03 
 
 
132 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2157  NUDIX hydrolase  37.6 
 
 
129 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  38.33 
 
 
302 aa  71.6  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2654  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  32.09 
 
 
134 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004482  MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  33.59 
 
 
132 aa  71.2  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  32.31 
 
 
129 aa  71.2  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 
169 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>