More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_11810 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  100 
 
 
131 aa  268  1e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  56 
 
 
132 aa  143  7.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  45.74 
 
 
139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11430  ADP-ribose pyrophosphatase  48.03 
 
 
129 aa  111  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.250404  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1921  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 
133 aa  110  7.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.11755  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
143 aa  101  4e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  43.2 
 
 
134 aa  101  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  41.13 
 
 
132 aa  97.4  6e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 
131 aa  95.5  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2684  CTP pyrophosphohydrolase  37.12 
 
 
134 aa  95.9  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00235226  normal  0.16537 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  39.37 
 
 
154 aa  94.4  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 
130 aa  91.7  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 
130 aa  91.7  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  38.66 
 
 
138 aa  90.5  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 
133 aa  88.2  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 
138 aa  88.2  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  38.58 
 
 
136 aa  88.2  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
137 aa  87.8  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  37.19 
 
 
141 aa  87  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  37.21 
 
 
136 aa  86.3  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  42.28 
 
 
153 aa  84.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  38.52 
 
 
138 aa  84  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  38.52 
 
 
138 aa  84  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 
167 aa  84  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 
129 aa  83.6  8e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.4 
 
 
135 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  42.4 
 
 
135 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  42.4 
 
 
135 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2457  putative mutT-like protein  40.16 
 
 
147 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.4 
 
 
135 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.8 
 
 
138 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3528  NUDIX hydrolase  39.23 
 
 
138 aa  82.4  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.321169  normal  0.283085 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.4 
 
 
135 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 
138 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.8 
 
 
138 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.4 
 
 
135 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  37.7 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3053  NUDIX hydrolase  42.4 
 
 
128 aa  81.6  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321786  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3691  NUDIX hydrolase  38.84 
 
 
141 aa  81.3  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
130 aa  81.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  38.76 
 
 
132 aa  81.3  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.6 
 
 
135 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 
151 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 
126 aa  79  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  38.52 
 
 
135 aa  79  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  39.34 
 
 
134 aa  79.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.8 
 
 
138 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  38.71 
 
 
138 aa  79  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3270  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
139 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196596  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  37.4 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 
133 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  39.69 
 
 
132 aa  77.4  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3099  mutator protein; oxidative damage repair protein  28.8 
 
 
137 aa  77.4  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 
138 aa  77.4  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1863  NUDIX hydrolase  41.8 
 
 
132 aa  77.4  0.00000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477977  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  38.76 
 
 
132 aa  77  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0979  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.353962 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  36.13 
 
 
129 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.07 
 
 
133 aa  76.3  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  40.32 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  36.8 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3510  mutator MutT protein  30.47 
 
 
130 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.39786  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  36.51 
 
 
329 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4152  NUDIX hydrolase  42.28 
 
 
128 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641206  decreased coverage  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  36.51 
 
 
329 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0787  NUDIX hydrolase  39.17 
 
 
128 aa  75.9  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.585292  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  38.66 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  39.52 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  38.52 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.8 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
129 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  42.4 
 
 
200 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  37.21 
 
 
132 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  37.21 
 
 
132 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  38.94 
 
 
138 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0755  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 
267 aa  73.9  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0414471  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1031  putative mutator mutT protein  36 
 
 
131 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0898  mutator MutT protein, putative  36 
 
 
131 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0730911  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  36 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  36.29 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1106  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00400603  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  36 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0870  mutator mutT protein  37.5 
 
 
137 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 
141 aa  72  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 
135 aa  72  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.36 
 
 
128 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.36 
 
 
128 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.36 
 
 
128 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  37.08 
 
 
396 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  40 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1170  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  0.0271169 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  39.09 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  39.09 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  37.1 
 
 
128 aa  70.5  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
146 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>