More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1863 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1863  NUDIX hydrolase  100 
 
 
132 aa  254  2e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477977  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1106  NUDIX hydrolase  59.84 
 
 
145 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00400603  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  52.31 
 
 
130 aa  124  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3053  NUDIX hydrolase  51.59 
 
 
128 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321786  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  47.79 
 
 
144 aa  113  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  53.72 
 
 
200 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4152  NUDIX hydrolase  53.72 
 
 
128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641206  decreased coverage  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2457  putative mutT-like protein  52.46 
 
 
147 aa  108  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  55.24 
 
 
570 aa  106  9.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31180  ADP-ribose pyrophosphatase  50.43 
 
 
133 aa  102  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3856  normal  0.753153 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  48.39 
 
 
153 aa  101  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4272  NUDIX hydrolase  44.88 
 
 
132 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841219  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  47.5 
 
 
167 aa  94.4  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4043  NUDIX hydrolase  44.09 
 
 
132 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.62945  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4118  NUDIX hydrolase  44.09 
 
 
132 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0755  NUDIX hydrolase  46.4 
 
 
267 aa  92.8  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0414471  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  44.8 
 
 
169 aa  92  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2154  NUDIX hydrolase  46.43 
 
 
206 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114898  hitchhiker  0.00867781 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1484  NUDIX hydrolase  40.46 
 
 
138 aa  91.3  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1131  NUDIX hydrolase  44.96 
 
 
132 aa  90.1  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0202346 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3865  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 
156 aa  87  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal  0.664134 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11185  mutator protein mutT  44.92 
 
 
141 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0122522  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
137 aa  84.3  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  48.36 
 
 
124 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  33.33 
 
 
132 aa  82.4  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4548  NUDIX hydrolase  44.64 
 
 
148 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223367  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0048  NUDIX hydrolase  45.3 
 
 
166 aa  81.6  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.393224  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 
132 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  45.69 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  37.9 
 
 
134 aa  79  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  34.88 
 
 
136 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1487  NUDIX hydrolase  39.85 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000137627 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1077  NUDIX hydrolase  45.19 
 
 
244 aa  78.2  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643191  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  41.8 
 
 
131 aa  77.4  0.00000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0183  NUDIX hydrolase  38.35 
 
 
153 aa  77  0.00000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1031  putative mutator mutT protein  33.86 
 
 
131 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0898  mutator MutT protein, putative  33.86 
 
 
131 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0730911  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 
130 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 
130 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0097  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
151 aa  73.6  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.94 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  38.28 
 
 
318 aa  70.1  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.59 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 
139 aa  70.1  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.59 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.59 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  34.38 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.94 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.94 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.94 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.94 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00520  ADP-ribose pyrophosphatase  38.28 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1687  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.19 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5502  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 
134 aa  67.8  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  36.97 
 
 
128 aa  67.8  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 
131 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  35.65 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  32.59 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3099  mutator protein; oxidative damage repair protein  30.4 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  32.5 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.36 
 
 
133 aa  64.7  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14530  ADP-ribose pyrophosphatase  40.6 
 
 
170 aa  64.3  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  30.95 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11430  ADP-ribose pyrophosphatase  35.16 
 
 
129 aa  63.5  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.250404  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  30.95 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  32.2 
 
 
129 aa  62.8  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  33.33 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1760  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 
134 aa  62  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  35.29 
 
 
136 aa  62.8  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 
138 aa  61.6  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.48 
 
 
132 aa  60.8  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  34.4 
 
 
360 aa  60.8  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.77 
 
 
131 aa  60.8  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  34.96 
 
 
316 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  34.15 
 
 
314 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  33.33 
 
 
132 aa  60.5  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0659  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.29 
 
 
134 aa  60.5  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 
149 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.04 
 
 
135 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 
142 aa  60.5  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2684  CTP pyrophosphohydrolase  29.1 
 
 
134 aa  60.5  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00235226  normal  0.16537 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  35.96 
 
 
312 aa  60.1  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  34.38 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 
154 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  35.2 
 
 
130 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  33.88 
 
 
129 aa  60.1  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  34.38 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  36.28 
 
 
146 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  35.65 
 
 
138 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.616604 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  35.48 
 
 
314 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  36.28 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  34.31 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  36.28 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>