More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0183 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0183  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 153 aa  303  4.0000000000000004e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00520  ADP-ribose pyrophosphatase  70.77 
 
 		 145 aa  189  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0048  NUDIX hydrolase  67.16 
 
 		 166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.393224  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0097  NUDIX hydrolase  68.18 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3865  NUDIX hydrolase  58.73 
 
 		 156 aa  147  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal  0.664134 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1131  NUDIX hydrolase  58.78 
 
 		 132 aa  141  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0202346 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1487  NUDIX hydrolase  53.91 
 
 		 147 aa  130  7.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000137627 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1484  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  48.87 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14530  ADP-ribose pyrophosphatase  44.83 
 
 		 170 aa  99.8  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3053  NUDIX hydrolase  50.41 
 
 		 128 aa  95.9  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 		 153 aa  95.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  45.59 
 
 		 291 aa  94.7  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4152  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641206  decreased coverage  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  43.41 
 
 		 200 aa  92.4  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  48.46 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  43.06 
 
 		 167 aa  87.4  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  47.5 
 
 		 124 aa  87.4  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  44.27 
 
 		 169 aa  87.4  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 		 134 aa  83.6  9e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1106  NUDIX hydrolase  44.74 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00400603  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3691  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  43.8 
 
 		 570 aa  78.2  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2457  putative mutT-like protein  44.8 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  34.56 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  38.53 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1863  NUDIX hydrolase  38.35 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477977  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  37.8 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  40.87 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0325  NUDIX hydrolase  43.09 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.626146 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  35.82 
 
 		 142 aa  72  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  38.17 
 
 		 137 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  42.97 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  33.33 
 
 		 363 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4272  NUDIX hydrolase  39.34 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4043  NUDIX hydrolase  39.34 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.62945  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4118  NUDIX hydrolase  39.34 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  39.1 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4548  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223367  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  44.23 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  43.9 
 
 		 334 aa  67.8  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  34.92 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1031  putative mutator mutT protein  33.82 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0898  mutator MutT protein, putative  33.82 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0730911  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  44.21 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.02 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2154  NUDIX hydrolase  38.35 
 
 		 206 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114898  hitchhiker  0.00867781 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  44.21 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  40.77 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1102  NUDIX hydrolase  42.45 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.142351  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  44.21 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11185  mutator protein mutT  37.41 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0122522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  32.28 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  35.61 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  58.06 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  42.86 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  37.8 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  40.29 
 
 		 325 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1205  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  30.51 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  39.34 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  40.2 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  41.54 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  38.24 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  34.53 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  59.32 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  57.14 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20801  adenine glycosylase  31.86 
 
 		 384 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  61.02 
 
 		 329 aa  61.6  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  61.02 
 
 		 329 aa  61.6  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  38.17 
 
 		 347 aa  61.6  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0755  NUDIX hydrolase  37.12 
 
 		 267 aa  61.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0414471  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  32.39 
 
 		 386 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  30.71 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  38.4 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  38.4 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  55.93 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  39.45 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  40.82 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.94 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.94 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1760  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  38.71 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  37.84 
 
 		 319 aa  60.5  0.000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  37.98 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  40.18 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  45.21 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  50 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.94 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>