More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4272 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4272  NUDIX hydrolase  100 
 
 
132 aa  254  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841219  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4043  NUDIX hydrolase  99.24 
 
 
132 aa  252  9e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.62945  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4118  NUDIX hydrolase  99.24 
 
 
132 aa  252  9e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4548  NUDIX hydrolase  70.08 
 
 
148 aa  167  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223367  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2154  NUDIX hydrolase  71.67 
 
 
206 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114898  hitchhiker  0.00867781 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11185  mutator protein mutT  62.69 
 
 
141 aa  153  7e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0122522  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3053  NUDIX hydrolase  48.39 
 
 
128 aa  110  9e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321786  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  48.85 
 
 
291 aa  107  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4152  NUDIX hydrolase  43.8 
 
 
128 aa  104  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641206  decreased coverage  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0755  NUDIX hydrolase  49.18 
 
 
267 aa  103  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0414471  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  44.72 
 
 
200 aa  102  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  46.51 
 
 
130 aa  101  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1863  NUDIX hydrolase  44.88 
 
 
132 aa  95.9  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477977  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  46.34 
 
 
570 aa  94.4  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  44.72 
 
 
169 aa  93.6  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1106  NUDIX hydrolase  48.15 
 
 
145 aa  89.4  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00400603  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  44.63 
 
 
153 aa  88.2  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31180  ADP-ribose pyrophosphatase  46.51 
 
 
133 aa  85.9  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3856  normal  0.753153 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2457  putative mutT-like protein  39.84 
 
 
147 aa  84.7  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1484  NUDIX hydrolase  41.48 
 
 
138 aa  85.1  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 
167 aa  83.6  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  39.55 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  33.87 
 
 
132 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  44.35 
 
 
135 aa  79  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 
124 aa  79  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.2 
 
 
133 aa  77.8  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1487  NUDIX hydrolase  42.64 
 
 
147 aa  77.4  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000137627 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  41.88 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00520  ADP-ribose pyrophosphatase  38.79 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  41.13 
 
 
134 aa  73.6  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  43.75 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  44.35 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  35.16 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  38.94 
 
 
317 aa  72  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  40 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.17 
 
 
128 aa  72  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 
139 aa  72  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5502  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.17 
 
 
128 aa  72  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.17 
 
 
128 aa  72  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.84 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  37.6 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  37.6 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.84 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1077  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
244 aa  71.2  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643191  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  40.83 
 
 
134 aa  70.9  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.84 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.84 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  41.88 
 
 
137 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 
131 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0183  NUDIX hydrolase  39.34 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0048  NUDIX hydrolase  40 
 
 
166 aa  69.7  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.393224  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.17 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  40.17 
 
 
129 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2065  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 
129 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0097  NUDIX hydrolase  42.16 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.06 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2157  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 
129 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  35.77 
 
 
360 aa  68.6  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.33 
 
 
135 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  35.45 
 
 
386 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.33 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.33 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  37.19 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  38.33 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  42.74 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.33 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  42.74 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.33 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  35.96 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 
133 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  46 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  32.31 
 
 
352 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  38.71 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  32.31 
 
 
352 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  39.67 
 
 
334 aa  67.4  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  41.88 
 
 
132 aa  67  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  40.5 
 
 
133 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  41.03 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17541  A/G-specific DNA glycosylase  29.46 
 
 
399 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  34.38 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  37.1 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1131  NUDIX hydrolase  37.19 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0202346 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.66 
 
 
131 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  41.13 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  36.28 
 
 
129 aa  65.5  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  36.29 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0407  mutator MutT protein  33.59 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  40.17 
 
 
128 aa  65.9  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  34.92 
 
 
363 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>