More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3039 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  100 
 
 
570 aa  1105    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11183  mannosyltransferase  49.6 
 
 
431 aa  312  9e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000655823  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2153  mannosyltransferase  49.32 
 
 
369 aa  293  8e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0955915  normal  0.0100871 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4550  mannosyltransferase  46.7 
 
 
406 aa  289  8e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.185586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4274  mannosyltransferase  46.51 
 
 
443 aa  277  3e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4045  mannosyltransferase  46.51 
 
 
443 aa  277  4e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4120  mannosyltransferase  46.51 
 
 
443 aa  277  4e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.703888 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0468  mannosyltransferase  44.15 
 
 
422 aa  250  5e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0479  mannosyltransferase  44.15 
 
 
422 aa  250  5e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0455  mannosyltransferase  44.15 
 
 
422 aa  250  5e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0453  mannosyltransferase  39.9 
 
 
438 aa  238  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355546  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0466  mannosyltransferase  39.9 
 
 
438 aa  238  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0477  mannosyltransferase  39.9 
 
 
438 aa  238  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3057  Protein of unknown function DUF2029  45.3 
 
 
455 aa  220  7e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0888832  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0467  mannosyltransferase  42.67 
 
 
428 aa  220  7e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0454  mannosyltransferase  42.67 
 
 
428 aa  220  7e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0478  mannosyltransferase  42.67 
 
 
428 aa  220  7e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4322  mannosyltransferase  37.3 
 
 
417 aa  200  7e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0743  mannosyltransferase  40.71 
 
 
398 aa  199  9e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.186012  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5433  hypothetical protein  35.38 
 
 
420 aa  136  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1126  Protein of unknown function DUF2029  36.04 
 
 
425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4020  Protein of unknown function DUF2029  33.91 
 
 
426 aa  123  9e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.643753  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5329  hypothetical protein  33.23 
 
 
478 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2916  hypothetical protein  37.17 
 
 
470 aa  121  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189824  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2968  putative integral membrane protein  33.67 
 
 
430 aa  121  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4234  sugar transporter superfamily protein  35.71 
 
 
402 aa  121  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5506  hypothetical protein  34.13 
 
 
395 aa  120  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344164  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0243  putative integral membrane protein  33.68 
 
 
417 aa  120  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2198  hypothetical protein  36.62 
 
 
408 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21610  Protein of unknown function (DUF2029)  34.75 
 
 
421 aa  116  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0338543  normal  0.0110628 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2282  Protein of unknown function DUF2029  33.53 
 
 
469 aa  111  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291881  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0993  hypothetical protein  39.37 
 
 
411 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1385  hypothetical protein  31.14 
 
 
412 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488241  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  56.6 
 
 
130 aa  109  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3057  hypothetical protein  32.57 
 
 
494 aa  108  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2154  NUDIX hydrolase  46.27 
 
 
206 aa  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114898  hitchhiker  0.00867781 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4545  hypothetical protein  30 
 
 
477 aa  108  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2502  Protein of unknown function DUF2029  35.31 
 
 
414 aa  107  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1863  NUDIX hydrolase  55.24 
 
 
132 aa  107  8e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477977  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3287  putative integral membrane protein  34.24 
 
 
418 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505534  normal  0.641522 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3053  NUDIX hydrolase  50 
 
 
128 aa  106  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321786  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3276  putative integral membrane protein  34.24 
 
 
418 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3338  putative integral membrane protein  34.24 
 
 
418 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06020  Protein of unknown function (DUF2029)  33.78 
 
 
444 aa  105  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.179625 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  46.04 
 
 
144 aa  105  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0755  NUDIX hydrolase  50.39 
 
 
267 aa  104  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0414471  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3543  putative integral membrane protein  34.55 
 
 
428 aa  104  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3224  hypothetical protein  38.16 
 
 
378 aa  103  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12209  integral membrane protein  30.11 
 
 
427 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4548  NUDIX hydrolase  48.41 
 
 
148 aa  103  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223367  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4089  hypothetical protein  33.75 
 
 
408 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1106  NUDIX hydrolase  55.77 
 
 
145 aa  101  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00400603  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31180  ADP-ribose pyrophosphatase  55.73 
 
 
133 aa  100  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3856  normal  0.753153 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5055  hypothetical protein  31.17 
 
 
477 aa  100  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11185  mutator protein mutT  46.27 
 
 
141 aa  100  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0122522  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6115  hypothetical protein  30.56 
 
 
479 aa  99.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112096  normal  0.027736 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3685  hypothetical protein  33.56 
 
 
420 aa  99.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0070  hypothetical protein  31.73 
 
 
455 aa  97.4  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21600  Protein of unknown function (DUF2029)  31.88 
 
 
467 aa  97.4  7e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0988113  hitchhiker  0.00696231 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2457  putative mutT-like protein  45.19 
 
 
147 aa  95.5  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  48.09 
 
 
291 aa  95.5  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4043  NUDIX hydrolase  46.34 
 
 
132 aa  94.7  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.62945  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4118  NUDIX hydrolase  46.34 
 
 
132 aa  94.7  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4272  NUDIX hydrolase  46.34 
 
 
132 aa  94.4  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841219  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2285  Protein of unknown function DUF2029  32.81 
 
 
463 aa  94.4  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1016  hypothetical protein  31.21 
 
 
419 aa  91.7  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1343  hypothetical protein  32.69 
 
 
410 aa  91.3  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  49.06 
 
 
124 aa  90.9  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  51.4 
 
 
200 aa  90.9  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0139  hypothetical protein  28.11 
 
 
437 aa  90.1  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3060  hypothetical protein  36.28 
 
 
434 aa  90.1  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.647331  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  49.12 
 
 
169 aa  88.6  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4152  NUDIX hydrolase  48.6 
 
 
128 aa  88.2  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641206  decreased coverage  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0425  hypothetical protein  32.34 
 
 
417 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0435  hypothetical protein  32.34 
 
 
417 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1131  NUDIX hydrolase  50 
 
 
132 aa  86.3  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0202346 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  45.19 
 
 
138 aa  84.3  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  44 
 
 
153 aa  83.2  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  40.71 
 
 
134 aa  82.8  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  39.01 
 
 
138 aa  81.6  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  39.01 
 
 
138 aa  81.6  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  41.26 
 
 
167 aa  81.6  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3865  NUDIX hydrolase  45.22 
 
 
156 aa  80.1  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal  0.664134 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  38.81 
 
 
137 aa  79  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0183  NUDIX hydrolase  43.8 
 
 
153 aa  78.6  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0048  NUDIX hydrolase  49.04 
 
 
166 aa  77.8  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.393224  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1031  putative mutator mutT protein  36.89 
 
 
131 aa  77.8  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0898  mutator MutT protein, putative  36.89 
 
 
131 aa  77.8  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0730911  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00520  ADP-ribose pyrophosphatase  44.74 
 
 
145 aa  77.4  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  37.31 
 
 
135 aa  77.4  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  38.4 
 
 
139 aa  77  0.0000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  37.5 
 
 
132 aa  77  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  38.41 
 
 
138 aa  75.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  39.84 
 
 
128 aa  75.9  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  35.17 
 
 
136 aa  75.5  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  38.06 
 
 
137 aa  75.5  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 
141 aa  75.1  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1077  NUDIX hydrolase  44.93 
 
 
244 aa  75.1  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643191  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1487  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 
147 aa  74.7  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000137627 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  41.88 
 
 
318 aa  74.7  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>