65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1385 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1385  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  802    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1343  hypothetical protein  87.62 
 
 		 410 aa  593  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1016  hypothetical protein  45.97 
 
 		 419 aa  235  9e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5329  hypothetical protein  43.48 
 
 		 478 aa  227  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4545  hypothetical protein  43.77 
 
 		 477 aa  224  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1125  hypothetical protein  46.99 
 
 		 408 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.51418  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5055  hypothetical protein  44.73 
 
 		 477 aa  219  6e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4020  Protein of unknown function DUF2029  33.72 
 
 		 426 aa  162  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.643753  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2282  Protein of unknown function DUF2029  33.98 
 
 		 469 aa  143  6e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291881  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2968  putative integral membrane protein  33.44 
 
 		 430 aa  140  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5506  hypothetical protein  33.73 
 
 		 395 aa  139  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344164  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6115  hypothetical protein  35.31 
 
 		 479 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112096  normal  0.027736 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3543  putative integral membrane protein  34.33 
 
 		 428 aa  136  8e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2198  hypothetical protein  34.55 
 
 		 408 aa  133  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4322  mannosyltransferase  36.24 
 
 		 417 aa  132  7.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0243  putative integral membrane protein  36.81 
 
 		 417 aa  132  7.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0139  hypothetical protein  35.67 
 
 		 437 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2502  Protein of unknown function DUF2029  32.41 
 
 		 414 aa  130  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5433  hypothetical protein  34.47 
 
 		 420 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21610  Protein of unknown function (DUF2029)  38.19 
 
 		 421 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0338543  normal  0.0110628 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0119  hypothetical protein  40.57 
 
 		 429 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0070  hypothetical protein  35.54 
 
 		 455 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3338  putative integral membrane protein  33.33 
 
 		 418 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3276  putative integral membrane protein  33.33 
 
 		 418 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3287  putative integral membrane protein  33.45 
 
 		 418 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505534  normal  0.641522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4234  sugar transporter superfamily protein  35.27 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12209  integral membrane protein  31.8 
 
 		 427 aa  124  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4120  mannosyltransferase  34.42 
 
 		 443 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.703888 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4045  mannosyltransferase  34.42 
 
 		 443 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4274  mannosyltransferase  34.42 
 
 		 443 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06020  Protein of unknown function (DUF2029)  35.11 
 
 		 444 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.179625 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1126  Protein of unknown function DUF2029  30.17 
 
 		 425 aa  121  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0743  mannosyltransferase  36.82 
 
 		 398 aa  119  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.186012  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21600  Protein of unknown function (DUF2029)  30.5 
 
 		 467 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0988113  hitchhiker  0.00696231 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3224  hypothetical protein  38.1 
 
 		 378 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2916  hypothetical protein  36.79 
 
 		 470 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189824  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2153  mannosyltransferase  31.37 
 
 		 369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0955915  normal  0.0100871 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3057  hypothetical protein  32.59 
 
 		 494 aa  111  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  34.19 
 
 		 570 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4089  hypothetical protein  34.3 
 
 		 408 aa  107  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0993  hypothetical protein  32.01 
 
 		 411 aa  106  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11183  mannosyltransferase  31.16 
 
 		 431 aa  106  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3685  hypothetical protein  34.17 
 
 		 420 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4550  mannosyltransferase  31.92 
 
 		 406 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.185586 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3057  Protein of unknown function DUF2029  34.02 
 
 		 455 aa  103  8e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0888832  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0425  hypothetical protein  33.9 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0435  hypothetical protein  33.9 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3060  hypothetical protein  32.57 
 
 		 434 aa  97.4  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.647331  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2285  Protein of unknown function DUF2029  31.95 
 
 		 463 aa  87.8  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0479  mannosyltransferase  29.71 
 
 		 422 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0455  mannosyltransferase  29.71 
 
 		 422 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0468  mannosyltransferase  29.71 
 
 		 422 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0453  mannosyltransferase  29.49 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0477  mannosyltransferase  29.49 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0466  mannosyltransferase  29.49 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0454  mannosyltransferase  28.84 
 
 		 428 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0467  mannosyltransferase  28.84 
 
 		 428 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0478  mannosyltransferase  28.84 
 
 		 428 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3880  putative conserved membrane protein  30.74 
 
 		 375 aa  72.4  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561968 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0205  hypothetical protein  25.85 
 
 		 734 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.746079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3867  hypothetical protein  25 
 
 		 734 aa  57.4  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0838155  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1896  Protein of unknown function DUF2029  28.74 
 
 		 429 aa  53.5  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.73633  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2000  hypothetical protein  27.38 
 
 		 439 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.846413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3146  Thiolase  25.94 
 
 		 468 aa  44.7  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2388  hypothetical protein  24.08 
 
 		 469 aa  44.3  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>