63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_06020 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_06020  Protein of unknown function (DUF2029)  100 
 
 		 444 aa  860    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.179625 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2502  Protein of unknown function DUF2029  35.5 
 
 		 414 aa  175  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5506  hypothetical protein  36.73 
 
 		 395 aa  170  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344164  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5433  hypothetical protein  34.44 
 
 		 420 aa  167  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4234  sugar transporter superfamily protein  37.22 
 
 		 402 aa  160  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21610  Protein of unknown function (DUF2029)  36.83 
 
 		 421 aa  159  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0338543  normal  0.0110628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2198  hypothetical protein  36.69 
 
 		 408 aa  157  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2282  Protein of unknown function DUF2029  35.24 
 
 		 469 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291881  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2916  hypothetical protein  38.78 
 
 		 470 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189824  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4020  Protein of unknown function DUF2029  34.98 
 
 		 426 aa  145  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.643753  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12209  integral membrane protein  35.53 
 
 		 427 aa  143  5e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1016  hypothetical protein  35.94 
 
 		 419 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5329  hypothetical protein  34.49 
 
 		 478 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0243  putative integral membrane protein  36.58 
 
 		 417 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155978 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21600  Protein of unknown function (DUF2029)  32.16 
 
 		 467 aa  130  3e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0988113  hitchhiker  0.00696231 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0425  hypothetical protein  35.2 
 
 		 417 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0435  hypothetical protein  35.2 
 
 		 417 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4089  hypothetical protein  34.68 
 
 		 408 aa  130  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1126  Protein of unknown function DUF2029  33.07 
 
 		 425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0743  mannosyltransferase  39.2 
 
 		 398 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.186012  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2968  putative integral membrane protein  32.24 
 
 		 430 aa  124  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3276  putative integral membrane protein  32.64 
 
 		 418 aa  123  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3338  putative integral membrane protein  32.64 
 
 		 418 aa  123  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3287  putative integral membrane protein  34.06 
 
 		 418 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505534  normal  0.641522 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4322  mannosyltransferase  37.46 
 
 		 417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3543  putative integral membrane protein  33.44 
 
 		 428 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11183  mannosyltransferase  34.08 
 
 		 431 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3685  hypothetical protein  40.31 
 
 		 420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3057  Protein of unknown function DUF2029  34.29 
 
 		 455 aa  115  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0888832  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1385  hypothetical protein  34.35 
 
 		 412 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6115  hypothetical protein  29.51 
 
 		 479 aa  113  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112096  normal  0.027736 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0993  hypothetical protein  35.58 
 
 		 411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0479  mannosyltransferase  35.58 
 
 		 422 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0468  mannosyltransferase  35.58 
 
 		 422 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0455  mannosyltransferase  35.58 
 
 		 422 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0467  mannosyltransferase  33.33 
 
 		 428 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0478  mannosyltransferase  33.33 
 
 		 428 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1343  hypothetical protein  35.25 
 
 		 410 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0454  mannosyltransferase  33.33 
 
 		 428 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4045  mannosyltransferase  35.5 
 
 		 443 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4274  mannosyltransferase  35.5 
 
 		 443 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4120  mannosyltransferase  35.5 
 
 		 443 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.703888 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1125  hypothetical protein  31.25 
 
 		 408 aa  107  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.51418  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3224  hypothetical protein  36.2 
 
 		 378 aa  106  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4545  hypothetical protein  32.41 
 
 		 477 aa  106  9e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0070  hypothetical protein  34.86 
 
 		 455 aa  104  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0139  hypothetical protein  33.04 
 
 		 437 aa  104  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2153  mannosyltransferase  32.79 
 
 		 369 aa  103  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0955915  normal  0.0100871 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2285  Protein of unknown function DUF2029  34.4 
 
 		 463 aa  102  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5055  hypothetical protein  33.33 
 
 		 477 aa  97.4  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3057  hypothetical protein  30.7 
 
 		 494 aa  97.8  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0119  hypothetical protein  37.14 
 
 		 429 aa  95.9  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3060  hypothetical protein  35.37 
 
 		 434 aa  92.8  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.647331  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4550  mannosyltransferase  33.66 
 
 		 406 aa  92  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.185586 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  34.83 
 
 		 570 aa  91.7  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0466  mannosyltransferase  32.34 
 
 		 438 aa  90.5  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0477  mannosyltransferase  32.34 
 
 		 438 aa  90.5  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0453  mannosyltransferase  32.34 
 
 		 438 aa  90.5  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3880  putative conserved membrane protein  29.17 
 
 		 375 aa  69.7  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561968 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2268  Protein of unknown function DUF2029  27.78 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.32611  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1896  Protein of unknown function DUF2029  23.77 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.73633  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3146  Thiolase  27.7 
 
 		 468 aa  45.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5286  hypothetical protein  25 
 
 		 431 aa  43.5  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.32718 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>