59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0139 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0139  hypothetical protein  100 
 
 
437 aa  841    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0070  hypothetical protein  62.79 
 
 
455 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0119  hypothetical protein  49.39 
 
 
429 aa  295  8e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0243  putative integral membrane protein  42.61 
 
 
417 aa  252  8.000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155978 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12209  integral membrane protein  34.64 
 
 
427 aa  162  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3276  putative integral membrane protein  35.46 
 
 
418 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3287  putative integral membrane protein  35.46 
 
 
418 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505534  normal  0.641522 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3338  putative integral membrane protein  35.46 
 
 
418 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2968  putative integral membrane protein  36.05 
 
 
430 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3543  putative integral membrane protein  35.46 
 
 
428 aa  150  6e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5506  hypothetical protein  34.16 
 
 
395 aa  136  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344164  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1016  hypothetical protein  35.94 
 
 
419 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2502  Protein of unknown function DUF2029  32.16 
 
 
414 aa  127  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5329  hypothetical protein  34.17 
 
 
478 aa  126  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5433  hypothetical protein  32.01 
 
 
420 aa  126  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1385  hypothetical protein  35.46 
 
 
412 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488241  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2198  hypothetical protein  33.74 
 
 
408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4234  sugar transporter superfamily protein  34.62 
 
 
402 aa  120  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1126  Protein of unknown function DUF2029  34.23 
 
 
425 aa  120  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06020  Protein of unknown function (DUF2029)  34.62 
 
 
444 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.179625 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4020  Protein of unknown function DUF2029  30.51 
 
 
426 aa  117  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.643753  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2916  hypothetical protein  35.28 
 
 
470 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189824  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2282  Protein of unknown function DUF2029  29.26 
 
 
469 aa  114  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291881  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3057  hypothetical protein  30.79 
 
 
494 aa  113  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3224  hypothetical protein  36.01 
 
 
378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1343  hypothetical protein  36.1 
 
 
410 aa  111  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4545  hypothetical protein  32.39 
 
 
477 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4322  mannosyltransferase  31.58 
 
 
417 aa  109  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6115  hypothetical protein  31.45 
 
 
479 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112096  normal  0.027736 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5055  hypothetical protein  35.11 
 
 
477 aa  106  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0993  hypothetical protein  31.51 
 
 
411 aa  103  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0425  hypothetical protein  28.49 
 
 
417 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1125  hypothetical protein  34.53 
 
 
408 aa  99  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.51418  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0435  hypothetical protein  28.49 
 
 
417 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21600  Protein of unknown function (DUF2029)  30.18 
 
 
467 aa  96.7  7e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0988113  hitchhiker  0.00696231 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2153  mannosyltransferase  30.47 
 
 
369 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0955915  normal  0.0100871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3685  hypothetical protein  29.73 
 
 
420 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11183  mannosyltransferase  28.45 
 
 
431 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000655823  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21610  Protein of unknown function (DUF2029)  33.42 
 
 
421 aa  93.2  7e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0338543  normal  0.0110628 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3060  hypothetical protein  31.33 
 
 
434 aa  91.3  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.647331  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0743  mannosyltransferase  27.27 
 
 
398 aa  89.7  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.186012  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  27.61 
 
 
570 aa  89.4  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3057  Protein of unknown function DUF2029  28.97 
 
 
455 aa  88.6  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0888832  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4089  hypothetical protein  32.2 
 
 
408 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4045  mannosyltransferase  29.75 
 
 
443 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4120  mannosyltransferase  29.75 
 
 
443 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.703888 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4274  mannosyltransferase  30.37 
 
 
443 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0479  mannosyltransferase  31.21 
 
 
422 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0455  mannosyltransferase  31.21 
 
 
422 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0468  mannosyltransferase  31.21 
 
 
422 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0453  mannosyltransferase  27.42 
 
 
438 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355546  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0477  mannosyltransferase  27.42 
 
 
438 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0466  mannosyltransferase  27.42 
 
 
438 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4550  mannosyltransferase  29.92 
 
 
406 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.185586 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2285  Protein of unknown function DUF2029  28.61 
 
 
463 aa  71.2  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0478  mannosyltransferase  25.95 
 
 
428 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0454  mannosyltransferase  25.95 
 
 
428 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0467  mannosyltransferase  25.95 
 
 
428 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3880  putative conserved membrane protein  29.34 
 
 
375 aa  51.2  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561968 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>