61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6115 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6115  hypothetical protein  100 
 
 		 479 aa  949    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112096  normal  0.027736 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2198  hypothetical protein  36.27 
 
 		 408 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21600  Protein of unknown function (DUF2029)  30.73 
 
 		 467 aa  149  9e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0988113  hitchhiker  0.00696231 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0425  hypothetical protein  38.49 
 
 		 417 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0435  hypothetical protein  38.49 
 
 		 417 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2282  Protein of unknown function DUF2029  31.96 
 
 		 469 aa  134  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291881  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1385  hypothetical protein  36.01 
 
 		 412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21610  Protein of unknown function (DUF2029)  32.67 
 
 		 421 aa  132  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0338543  normal  0.0110628 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0243  putative integral membrane protein  35.74 
 
 		 417 aa  130  7.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155978 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5506  hypothetical protein  31.97 
 
 		 395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344164  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12209  integral membrane protein  29.98 
 
 		 427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4020  Protein of unknown function DUF2029  33.45 
 
 		 426 aa  126  7e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.643753  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5433  hypothetical protein  28.08 
 
 		 420 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1126  Protein of unknown function DUF2029  31.66 
 
 		 425 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4322  mannosyltransferase  30.24 
 
 		 417 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0743  mannosyltransferase  32.47 
 
 		 398 aa  120  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.186012  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0993  hypothetical protein  37.5 
 
 		 411 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3543  putative integral membrane protein  28.96 
 
 		 428 aa  118  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11183  mannosyltransferase  31.71 
 
 		 431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2502  Protein of unknown function DUF2029  28.79 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5055  hypothetical protein  37.56 
 
 		 477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5329  hypothetical protein  31.83 
 
 		 478 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4545  hypothetical protein  31.83 
 
 		 477 aa  113  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06020  Protein of unknown function (DUF2029)  30.56 
 
 		 444 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.179625 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3057  hypothetical protein  28.6 
 
 		 494 aa  109  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1343  hypothetical protein  34.04 
 
 		 410 aa  107  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4234  sugar transporter superfamily protein  33.92 
 
 		 402 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3685  hypothetical protein  38.12 
 
 		 420 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0139  hypothetical protein  31.45 
 
 		 437 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3060  hypothetical protein  29.79 
 
 		 434 aa  104  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.647331  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1016  hypothetical protein  31.2 
 
 		 419 aa  103  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3287  putative integral membrane protein  29.63 
 
 		 418 aa  103  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505534  normal  0.641522 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2153  mannosyltransferase  33.77 
 
 		 369 aa  103  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0955915  normal  0.0100871 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3276  putative integral membrane protein  29.63 
 
 		 418 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3338  putative integral membrane protein  29.63 
 
 		 418 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4089  hypothetical protein  31.13 
 
 		 408 aa  103  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3057  Protein of unknown function DUF2029  31.3 
 
 		 455 aa  98.6  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0888832  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2968  putative integral membrane protein  28.4 
 
 		 430 aa  99  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0479  mannosyltransferase  30.59 
 
 		 422 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0468  mannosyltransferase  30.59 
 
 		 422 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0455  mannosyltransferase  30.59 
 
 		 422 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0119  hypothetical protein  36.6 
 
 		 429 aa  94.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4120  mannosyltransferase  35.09 
 
 		 443 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.703888 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4045  mannosyltransferase  35.09 
 
 		 443 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4274  mannosyltransferase  35.09 
 
 		 443 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3224  hypothetical protein  32.22 
 
 		 378 aa  94.4  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2285  Protein of unknown function DUF2029  34.04 
 
 		 463 aa  93.2  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0453  mannosyltransferase  28.86 
 
 		 438 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0466  mannosyltransferase  28.86 
 
 		 438 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1125  hypothetical protein  38.83 
 
 		 408 aa  92.4  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.51418  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0477  mannosyltransferase  28.86 
 
 		 438 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2916  hypothetical protein  34.08 
 
 		 470 aa  91.3  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189824  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0070  hypothetical protein  30.28 
 
 		 455 aa  90.5  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4550  mannosyltransferase  31.88 
 
 		 406 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.185586 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  30.67 
 
 		 570 aa  84.3  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0454  mannosyltransferase  30.8 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0478  mannosyltransferase  30.8 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0467  mannosyltransferase  30.8 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2630  hypothetical protein  28.45 
 
 		 454 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31513  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2230  hypothetical protein  26.64 
 
 		 430 aa  45.1  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.615453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1662  hypothetical protein  29.29 
 
 		 427 aa  43.5  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>