18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2630 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2230  hypothetical protein  87.18 
 
 
430 aa  734    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.615453  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2630  hypothetical protein  100 
 
 
454 aa  915    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31513  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5286  hypothetical protein  22.04 
 
 
431 aa  73.2  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.32718 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1126  Protein of unknown function DUF2029  28.4 
 
 
425 aa  62.4  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2000  hypothetical protein  27.36 
 
 
439 aa  53.5  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.846413  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4044  hypothetical protein  31.02 
 
 
442 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345379  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6115  hypothetical protein  28.07 
 
 
479 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112096  normal  0.027736 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5329  hypothetical protein  27.6 
 
 
478 aa  49.7  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2198  hypothetical protein  30.52 
 
 
408 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4322  mannosyltransferase  32.69 
 
 
417 aa  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0455  mannosyltransferase  28.49 
 
 
422 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0479  mannosyltransferase  28.49 
 
 
422 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0468  mannosyltransferase  28.49 
 
 
422 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5433  hypothetical protein  29.14 
 
 
420 aa  47  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0649  hypothetical protein  33.53 
 
 
420 aa  47  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2153  mannosyltransferase  30.88 
 
 
369 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0955915  normal  0.0100871 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21610  Protein of unknown function (DUF2029)  27.64 
 
 
421 aa  45.1  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0338543  normal  0.0110628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4234  sugar transporter superfamily protein  26 
 
 
402 aa  44.3  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>