15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5286 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5286  hypothetical protein  100 
 
 		 431 aa  869    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.32718 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2230  hypothetical protein  23.53 
 
 		 430 aa  77.8  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.615453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2630  hypothetical protein  22.04 
 
 		 454 aa  70.5  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31513  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0468  mannosyltransferase  28.41 
 
 		 422 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0479  mannosyltransferase  28.41 
 
 		 422 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0455  mannosyltransferase  28.41 
 
 		 422 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4234  sugar transporter superfamily protein  29.1 
 
 		 402 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2916  hypothetical protein  26.83 
 
 		 470 aa  47  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189824  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3390  hypothetical protein  37.8 
 
 		 439 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.871087  hitchhiker  0.00472571 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12209  integral membrane protein  21.99 
 
 		 427 aa  46.2  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0466  mannosyltransferase  26.29 
 
 		 438 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0477  mannosyltransferase  26.29 
 
 		 438 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0453  mannosyltransferase  26.29 
 
 		 438 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06020  Protein of unknown function (DUF2029)  25 
 
 		 444 aa  43.5  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.179625 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2000  hypothetical protein  43.55 
 
 		 439 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.846413  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>