62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2916 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2916  hypothetical protein  100 
 
 		 470 aa  900    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189824  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4234  sugar transporter superfamily protein  42.15 
 
 		 402 aa  209  7e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2502  Protein of unknown function DUF2029  34.62 
 
 		 414 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06020  Protein of unknown function (DUF2029)  38.78 
 
 		 444 aa  166  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.179625 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4089  hypothetical protein  40.41 
 
 		 408 aa  165  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3543  putative integral membrane protein  38.67 
 
 		 428 aa  160  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2968  putative integral membrane protein  38.3 
 
 		 430 aa  159  9e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21610  Protein of unknown function (DUF2029)  36.52 
 
 		 421 aa  157  3e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0338543  normal  0.0110628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5433  hypothetical protein  36.51 
 
 		 420 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2198  hypothetical protein  38.24 
 
 		 408 aa  153  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3276  putative integral membrane protein  37.69 
 
 		 418 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3338  putative integral membrane protein  37.69 
 
 		 418 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3287  putative integral membrane protein  38.76 
 
 		 418 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505534  normal  0.641522 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5506  hypothetical protein  33.33 
 
 		 395 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344164  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12209  integral membrane protein  36.31 
 
 		 427 aa  145  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4545  hypothetical protein  30.8 
 
 		 477 aa  145  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4020  Protein of unknown function DUF2029  35.85 
 
 		 426 aa  140  7e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.643753  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11183  mannosyltransferase  37.45 
 
 		 431 aa  137  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0743  mannosyltransferase  33.85 
 
 		 398 aa  133  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.186012  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4322  mannosyltransferase  37.95 
 
 		 417 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0993  hypothetical protein  33.93 
 
 		 411 aa  130  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21600  Protein of unknown function (DUF2029)  31.37 
 
 		 467 aa  129  8.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0988113  hitchhiker  0.00696231 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0243  putative integral membrane protein  34.33 
 
 		 417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3685  hypothetical protein  37.66 
 
 		 420 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2153  mannosyltransferase  35.86 
 
 		 369 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0955915  normal  0.0100871 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  33.24 
 
 		 570 aa  127  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5055  hypothetical protein  32.08 
 
 		 477 aa  124  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2282  Protein of unknown function DUF2029  34.29 
 
 		 469 aa  124  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291881  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0425  hypothetical protein  35.24 
 
 		 417 aa  123  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0435  hypothetical protein  35.24 
 
 		 417 aa  123  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6115  hypothetical protein  31.75 
 
 		 479 aa  123  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112096  normal  0.027736 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3057  hypothetical protein  33.03 
 
 		 494 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1385  hypothetical protein  36.25 
 
 		 412 aa  121  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5329  hypothetical protein  29.93 
 
 		 478 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1126  Protein of unknown function DUF2029  35.47 
 
 		 425 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3057  Protein of unknown function DUF2029  33.42 
 
 		 455 aa  116  7.999999999999999e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0888832  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0139  hypothetical protein  35.07 
 
 		 437 aa  116  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4274  mannosyltransferase  37 
 
 		 443 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4045  mannosyltransferase  37 
 
 		 443 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4120  mannosyltransferase  37 
 
 		 443 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.703888 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0468  mannosyltransferase  34.88 
 
 		 422 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0455  mannosyltransferase  34.88 
 
 		 422 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4550  mannosyltransferase  35.64 
 
 		 406 aa  111  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.185586 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0479  mannosyltransferase  34.88 
 
 		 422 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0070  hypothetical protein  33.87 
 
 		 455 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1016  hypothetical protein  33.64 
 
 		 419 aa  110  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3224  hypothetical protein  37.21 
 
 		 378 aa  109  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2285  Protein of unknown function DUF2029  36.36 
 
 		 463 aa  108  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0453  mannosyltransferase  34.64 
 
 		 438 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0477  mannosyltransferase  34.64 
 
 		 438 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0466  mannosyltransferase  34.64 
 
 		 438 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1343  hypothetical protein  35.96 
 
 		 410 aa  106  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3060  hypothetical protein  34.71 
 
 		 434 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.647331  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0454  mannosyltransferase  32.96 
 
 		 428 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0478  mannosyltransferase  32.96 
 
 		 428 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0467  mannosyltransferase  32.96 
 
 		 428 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0119  hypothetical protein  31.22 
 
 		 429 aa  89.7  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1125  hypothetical protein  31.52 
 
 		 408 aa  86.3  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.51418  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3880  putative conserved membrane protein  30.79 
 
 		 375 aa  79.7  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5286  hypothetical protein  22.22 
 
 		 431 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.32718 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3146  Thiolase  28.15 
 
 		 468 aa  46.6  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2000  hypothetical protein  37.33 
 
 		 439 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.846413  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>