70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1016 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1016  hypothetical protein  100 
 
 		 419 aa  815    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1125  hypothetical protein  84.35 
 
 		 408 aa  532  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.51418  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5329  hypothetical protein  44.86 
 
 		 478 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1385  hypothetical protein  43.73 
 
 		 412 aa  241  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4545  hypothetical protein  43.53 
 
 		 477 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1343  hypothetical protein  44.59 
 
 		 410 aa  219  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5055  hypothetical protein  44.16 
 
 		 477 aa  218  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2282  Protein of unknown function DUF2029  34.3 
 
 		 469 aa  165  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291881  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06020  Protein of unknown function (DUF2029)  36.34 
 
 		 444 aa  155  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.179625 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12209  integral membrane protein  35.01 
 
 		 427 aa  155  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2968  putative integral membrane protein  36.2 
 
 		 430 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3543  putative integral membrane protein  35.24 
 
 		 428 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3287  putative integral membrane protein  34.26 
 
 		 418 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505534  normal  0.641522 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3338  putative integral membrane protein  34.26 
 
 		 418 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3276  putative integral membrane protein  34.26 
 
 		 418 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4020  Protein of unknown function DUF2029  35.08 
 
 		 426 aa  141  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.643753  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5433  hypothetical protein  33.11 
 
 		 420 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5506  hypothetical protein  35.26 
 
 		 395 aa  130  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344164  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2285  Protein of unknown function DUF2029  35.94 
 
 		 463 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0993  hypothetical protein  35.61 
 
 		 411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2198  hypothetical protein  35.84 
 
 		 408 aa  126  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0139  hypothetical protein  38.16 
 
 		 437 aa  126  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0243  putative integral membrane protein  31.85 
 
 		 417 aa  123  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155978 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1126  Protein of unknown function DUF2029  34.69 
 
 		 425 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0070  hypothetical protein  33.33 
 
 		 455 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6115  hypothetical protein  29.5 
 
 		 479 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112096  normal  0.027736 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3685  hypothetical protein  36.26 
 
 		 420 aa  116  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2502  Protein of unknown function DUF2029  27.76 
 
 		 414 aa  116  8.999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21610  Protein of unknown function (DUF2029)  31.39 
 
 		 421 aa  114  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0338543  normal  0.0110628 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21600  Protein of unknown function (DUF2029)  30.99 
 
 		 467 aa  113  6e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0988113  hitchhiker  0.00696231 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4274  mannosyltransferase  33.54 
 
 		 443 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0743  mannosyltransferase  34.04 
 
 		 398 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.186012  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4045  mannosyltransferase  33.54 
 
 		 443 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4120  mannosyltransferase  33.54 
 
 		 443 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.703888 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4234  sugar transporter superfamily protein  37.04 
 
 		 402 aa  109  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2916  hypothetical protein  32.11 
 
 		 470 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189824  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3057  hypothetical protein  31.15 
 
 		 494 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2153  mannosyltransferase  31.35 
 
 		 369 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0955915  normal  0.0100871 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0119  hypothetical protein  39.15 
 
 		 429 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11183  mannosyltransferase  31.19 
 
 		 431 aa  103  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4089  hypothetical protein  30.28 
 
 		 408 aa  104  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4322  mannosyltransferase  34.71 
 
 		 417 aa  99.8  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0435  hypothetical protein  30.72 
 
 		 417 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0425  hypothetical protein  30.72 
 
 		 417 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3224  hypothetical protein  36.68 
 
 		 378 aa  93.6  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4550  mannosyltransferase  32.56 
 
 		 406 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.185586 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  31.04 
 
 		 570 aa  92.4  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0478  mannosyltransferase  28.13 
 
 		 428 aa  90.1  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0454  mannosyltransferase  28.13 
 
 		 428 aa  90.1  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0467  mannosyltransferase  28.13 
 
 		 428 aa  90.1  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3060  hypothetical protein  27.95 
 
 		 434 aa  89.7  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.647331  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3057  Protein of unknown function DUF2029  31.71 
 
 		 455 aa  86.3  9e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0888832  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0466  mannosyltransferase  26.4 
 
 		 438 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0477  mannosyltransferase  26.4 
 
 		 438 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0453  mannosyltransferase  26.4 
 
 		 438 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0479  mannosyltransferase  30.72 
 
 		 422 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0468  mannosyltransferase  30.72 
 
 		 422 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0455  mannosyltransferase  30.72 
 
 		 422 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3880  putative conserved membrane protein  29.73 
 
 		 375 aa  67  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561968 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2488  putative integral membrane protein  31.21 
 
 		 421 aa  57  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.59815  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0205  hypothetical protein  29.28 
 
 		 734 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.746079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0754  hypothetical protein  25.91 
 
 		 373 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.110422 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1896  Protein of unknown function DUF2029  25.68 
 
 		 429 aa  51.2  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.73633  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3867  hypothetical protein  27.63 
 
 		 734 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0838155  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1662  hypothetical protein  27.46 
 
 		 427 aa  48.9  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2263  putative integral membrane protein  31.85 
 
 		 438 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2217  putative integral membrane protein  31.85 
 
 		 438 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2268  Protein of unknown function DUF2029  28.19 
 
 		 419 aa  47.4  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.32611  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2206  putative integral membrane protein  31.85 
 
 		 433 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.913422  normal  0.531176 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3915  putative integral membrane protein  27.4 
 
 		 417 aa  43.1  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.279766  normal  0.731534 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>