60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0243 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0243  putative integral membrane protein  100 
 
 		 417 aa  800    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0139  hypothetical protein  42.61 
 
 		 437 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0070  hypothetical protein  42.24 
 
 		 455 aa  230  3e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0119  hypothetical protein  45.19 
 
 		 429 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12209  integral membrane protein  34.04 
 
 		 427 aa  153  7e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4020  Protein of unknown function DUF2029  36.61 
 
 		 426 aa  148  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.643753  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2502  Protein of unknown function DUF2029  34.55 
 
 		 414 aa  142  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3543  putative integral membrane protein  34.24 
 
 		 428 aa  140  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3276  putative integral membrane protein  34.37 
 
 		 418 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3338  putative integral membrane protein  34.37 
 
 		 418 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2198  hypothetical protein  33.23 
 
 		 408 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06020  Protein of unknown function (DUF2029)  36.58 
 
 		 444 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.179625 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2968  putative integral membrane protein  34.64 
 
 		 430 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3287  putative integral membrane protein  35.91 
 
 		 418 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505534  normal  0.641522 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2282  Protein of unknown function DUF2029  34.45 
 
 		 469 aa  130  6e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291881  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5506  hypothetical protein  35.31 
 
 		 395 aa  129  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344164  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5433  hypothetical protein  33.67 
 
 		 420 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6115  hypothetical protein  34.24 
 
 		 479 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112096  normal  0.027736 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4322  mannosyltransferase  34.5 
 
 		 417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4234  sugar transporter superfamily protein  36.81 
 
 		 402 aa  126  9e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1126  Protein of unknown function DUF2029  34.55 
 
 		 425 aa  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0993  hypothetical protein  35.43 
 
 		 411 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1385  hypothetical protein  35.21 
 
 		 412 aa  123  8e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0743  mannosyltransferase  31.58 
 
 		 398 aa  122  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.186012  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11183  mannosyltransferase  31.65 
 
 		 431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4545  hypothetical protein  30.46 
 
 		 477 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5055  hypothetical protein  31.38 
 
 		 477 aa  113  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  33.33 
 
 		 570 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1343  hypothetical protein  35.92 
 
 		 410 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5329  hypothetical protein  30.95 
 
 		 478 aa  110  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4274  mannosyltransferase  32.06 
 
 		 443 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4120  mannosyltransferase  32.06 
 
 		 443 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.703888 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4045  mannosyltransferase  32.06 
 
 		 443 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2916  hypothetical protein  34.74 
 
 		 470 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189824  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21610  Protein of unknown function (DUF2029)  36.72 
 
 		 421 aa  107  5e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0338543  normal  0.0110628 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3057  hypothetical protein  30.66 
 
 		 494 aa  107  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1016  hypothetical protein  34.26 
 
 		 419 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3224  hypothetical protein  32.92 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2153  mannosyltransferase  31.44 
 
 		 369 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0955915  normal  0.0100871 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21600  Protein of unknown function (DUF2029)  33.98 
 
 		 467 aa  103  7e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0988113  hitchhiker  0.00696231 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2285  Protein of unknown function DUF2029  33.96 
 
 		 463 aa  103  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3685  hypothetical protein  33.79 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4550  mannosyltransferase  31.86 
 
 		 406 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.185586 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3057  Protein of unknown function DUF2029  31.92 
 
 		 455 aa  100  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0888832  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1125  hypothetical protein  33.1 
 
 		 408 aa  98.6  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.51418  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4089  hypothetical protein  34.77 
 
 		 408 aa  97.8  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0468  mannosyltransferase  29.84 
 
 		 422 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0455  mannosyltransferase  29.84 
 
 		 422 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0479  mannosyltransferase  29.84 
 
 		 422 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3060  hypothetical protein  31.98 
 
 		 434 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.647331  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0466  mannosyltransferase  29.55 
 
 		 438 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0453  mannosyltransferase  29.55 
 
 		 438 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0477  mannosyltransferase  29.55 
 
 		 438 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0425  hypothetical protein  29.63 
 
 		 417 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0435  hypothetical protein  29.63 
 
 		 417 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0454  mannosyltransferase  27.07 
 
 		 428 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0478  mannosyltransferase  27.07 
 
 		 428 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0467  mannosyltransferase  27.07 
 
 		 428 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3880  putative conserved membrane protein  29.87 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561968 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2388  hypothetical protein  27.51 
 
 		 469 aa  51.2  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>