64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4020 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4020  Protein of unknown function DUF2029  100 
 
 		 426 aa  846    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.643753  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2282  Protein of unknown function DUF2029  38.44 
 
 		 469 aa  219  7e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291881  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2285  Protein of unknown function DUF2029  39.29 
 
 		 463 aa  202  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0993  hypothetical protein  39.36 
 
 		 411 aa  199  5e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3685  hypothetical protein  38.73 
 
 		 420 aa  166  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2198  hypothetical protein  36.05 
 
 		 408 aa  159  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4234  sugar transporter superfamily protein  41.34 
 
 		 402 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0243  putative integral membrane protein  36.61 
 
 		 417 aa  158  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155978 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1126  Protein of unknown function DUF2029  34.1 
 
 		 425 aa  155  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1385  hypothetical protein  33.33 
 
 		 412 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12209  integral membrane protein  32.39 
 
 		 427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06020  Protein of unknown function (DUF2029)  36.51 
 
 		 444 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.179625 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0425  hypothetical protein  38.01 
 
 		 417 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0435  hypothetical protein  38.01 
 
 		 417 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4545  hypothetical protein  33.12 
 
 		 477 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21610  Protein of unknown function (DUF2029)  34.12 
 
 		 421 aa  143  6e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0338543  normal  0.0110628 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21600  Protein of unknown function (DUF2029)  34.23 
 
 		 467 aa  142  8e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0988113  hitchhiker  0.00696231 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3338  putative integral membrane protein  30.71 
 
 		 418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3276  putative integral membrane protein  30.71 
 
 		 418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1343  hypothetical protein  35.76 
 
 		 410 aa  140  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11183  mannosyltransferase  36.21 
 
 		 431 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4322  mannosyltransferase  36.59 
 
 		 417 aa  139  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4089  hypothetical protein  37.85 
 
 		 408 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3287  putative integral membrane protein  30.71 
 
 		 418 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505534  normal  0.641522 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2968  putative integral membrane protein  31.23 
 
 		 430 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2502  Protein of unknown function DUF2029  33.13 
 
 		 414 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0743  mannosyltransferase  33.83 
 
 		 398 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.186012  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5055  hypothetical protein  34.94 
 
 		 477 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5329  hypothetical protein  33.22 
 
 		 478 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6115  hypothetical protein  33.45 
 
 		 479 aa  134  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112096  normal  0.027736 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5433  hypothetical protein  33.45 
 
 		 420 aa  133  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5506  hypothetical protein  34.23 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344164  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3543  putative integral membrane protein  31.17 
 
 		 428 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1016  hypothetical protein  34.11 
 
 		 419 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4045  mannosyltransferase  36.86 
 
 		 443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4120  mannosyltransferase  36.86 
 
 		 443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.703888 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4274  mannosyltransferase  36.86 
 
 		 443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3057  hypothetical protein  32.82 
 
 		 494 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  34.38 
 
 		 570 aa  123  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0453  mannosyltransferase  33.98 
 
 		 438 aa  123  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0466  mannosyltransferase  33.98 
 
 		 438 aa  123  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0477  mannosyltransferase  33.98 
 
 		 438 aa  123  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2916  hypothetical protein  35.29 
 
 		 470 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189824  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3057  Protein of unknown function DUF2029  33.97 
 
 		 455 aa  121  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0888832  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2153  mannosyltransferase  35.27 
 
 		 369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0955915  normal  0.0100871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0139  hypothetical protein  30.51 
 
 		 437 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1125  hypothetical protein  41.54 
 
 		 408 aa  114  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.51418  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3224  hypothetical protein  34.8 
 
 		 378 aa  113  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0119  hypothetical protein  36.27 
 
 		 429 aa  112  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0070  hypothetical protein  32.13 
 
 		 455 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0454  mannosyltransferase  34.68 
 
 		 428 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0478  mannosyltransferase  34.68 
 
 		 428 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3060  hypothetical protein  32.53 
 
 		 434 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.647331  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0467  mannosyltransferase  34.68 
 
 		 428 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4550  mannosyltransferase  34.35 
 
 		 406 aa  107  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.185586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0455  mannosyltransferase  32.22 
 
 		 422 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0479  mannosyltransferase  32.22 
 
 		 422 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0468  mannosyltransferase  32.22 
 
 		 422 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3880  putative conserved membrane protein  26.86 
 
 		 375 aa  67  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561968 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1896  Protein of unknown function DUF2029  21.25 
 
 		 429 aa  53.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.73633  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3867  hypothetical protein  26.34 
 
 		 734 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0838155  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3146  Thiolase  26.6 
 
 		 468 aa  47.8  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2268  Protein of unknown function DUF2029  22.99 
 
 		 419 aa  43.9  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.32611  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0205  hypothetical protein  28.57 
 
 		 734 aa  43.5  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.746079  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>