70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1125 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1125  hypothetical protein  100 
 
 		 408 aa  795    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.51418  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1016  hypothetical protein  84.35 
 
 		 419 aa  612  9.999999999999999e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1385  hypothetical protein  44.96 
 
 		 412 aa  257  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5329  hypothetical protein  45.3 
 
 		 478 aa  239  5.999999999999999e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1343  hypothetical protein  45.36 
 
 		 410 aa  230  4e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4545  hypothetical protein  42.37 
 
 		 477 aa  227  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5055  hypothetical protein  43.61 
 
 		 477 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2282  Protein of unknown function DUF2029  33.24 
 
 		 469 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291881  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06020  Protein of unknown function (DUF2029)  34.25 
 
 		 444 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.179625 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12209  integral membrane protein  35.55 
 
 		 427 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3543  putative integral membrane protein  34.11 
 
 		 428 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3287  putative integral membrane protein  33.91 
 
 		 418 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505534  normal  0.641522 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2968  putative integral membrane protein  34.8 
 
 		 430 aa  138  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3338  putative integral membrane protein  33.91 
 
 		 418 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3276  putative integral membrane protein  33.91 
 
 		 418 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5433  hypothetical protein  33.11 
 
 		 420 aa  136  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4020  Protein of unknown function DUF2029  35.71 
 
 		 426 aa  135  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.643753  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2285  Protein of unknown function DUF2029  33.71 
 
 		 463 aa  132  7.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2198  hypothetical protein  39.22 
 
 		 408 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0139  hypothetical protein  35.22 
 
 		 437 aa  130  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0243  putative integral membrane protein  34.71 
 
 		 417 aa  127  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155978 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5506  hypothetical protein  33.75 
 
 		 395 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344164  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0993  hypothetical protein  35.03 
 
 		 411 aa  123  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0070  hypothetical protein  33.51 
 
 		 455 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2502  Protein of unknown function DUF2029  30.31 
 
 		 414 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3057  hypothetical protein  33.01 
 
 		 494 aa  117  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6115  hypothetical protein  31.37 
 
 		 479 aa  116  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112096  normal  0.027736 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1126  Protein of unknown function DUF2029  33.67 
 
 		 425 aa  114  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4274  mannosyltransferase  33.33 
 
 		 443 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4045  mannosyltransferase  33.33 
 
 		 443 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4120  mannosyltransferase  33.33 
 
 		 443 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.703888 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4089  hypothetical protein  32.7 
 
 		 408 aa  109  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3685  hypothetical protein  36.36 
 
 		 420 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21600  Protein of unknown function (DUF2029)  30.12 
 
 		 467 aa  107  5e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0988113  hitchhiker  0.00696231 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11183  mannosyltransferase  31.27 
 
 		 431 aa  105  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4234  sugar transporter superfamily protein  33.99 
 
 		 402 aa  104  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0743  mannosyltransferase  31.8 
 
 		 398 aa  103  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.186012  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21610  Protein of unknown function (DUF2029)  33.76 
 
 		 421 aa  102  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0338543  normal  0.0110628 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0119  hypothetical protein  33.79 
 
 		 429 aa  102  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4322  mannosyltransferase  34.62 
 
 		 417 aa  100  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2153  mannosyltransferase  30.62 
 
 		 369 aa  99.8  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0955915  normal  0.0100871 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2916  hypothetical protein  33.93 
 
 		 470 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189824  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4550  mannosyltransferase  31.9 
 
 		 406 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.185586 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  30.86 
 
 		 570 aa  93.6  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0478  mannosyltransferase  27.83 
 
 		 428 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0467  mannosyltransferase  27.83 
 
 		 428 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0454  mannosyltransferase  27.83 
 
 		 428 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3224  hypothetical protein  35.13 
 
 		 378 aa  91.3  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0435  hypothetical protein  34.85 
 
 		 417 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0425  hypothetical protein  34.85 
 
 		 417 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3057  Protein of unknown function DUF2029  31.09 
 
 		 455 aa  85.5  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0888832  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3060  hypothetical protein  28.37 
 
 		 434 aa  83.6  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.647331  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0479  mannosyltransferase  29.19 
 
 		 422 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0455  mannosyltransferase  29.19 
 
 		 422 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0468  mannosyltransferase  29.19 
 
 		 422 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0466  mannosyltransferase  27.47 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0453  mannosyltransferase  27.47 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0477  mannosyltransferase  27.47 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3880  putative conserved membrane protein  29.05 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561968 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2488  putative integral membrane protein  28 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.59815  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0754  hypothetical protein  27.44 
 
 		 373 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.110422 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0205  hypothetical protein  27.84 
 
 		 734 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.746079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1662  hypothetical protein  37.8 
 
 		 427 aa  49.3  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1896  Protein of unknown function DUF2029  25.66 
 
 		 429 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.73633  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2217  putative integral membrane protein  30.49 
 
 		 438 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3915  putative integral membrane protein  26.41 
 
 		 417 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.279766  normal  0.731534 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2206  putative integral membrane protein  30.49 
 
 		 433 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.913422  normal  0.531176 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2263  putative integral membrane protein  30.49 
 
 		 438 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12688  integral membrane protein  28 
 
 		 433 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.1921e-48  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3867  hypothetical protein  25.97 
 
 		 734 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0838155  normal  0.221167 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>