12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2488 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2488  putative integral membrane protein  100 
 
 		 421 aa  833    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.59815  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3915  putative integral membrane protein  89.69 
 
 		 417 aa  714    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.279766  normal  0.731534 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2217  putative integral membrane protein  73.63 
 
 		 438 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2263  putative integral membrane protein  73.63 
 
 		 438 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2206  putative integral membrane protein  73.63 
 
 		 433 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.913422  normal  0.531176 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12688  integral membrane protein  70.02 
 
 		 433 aa  525  1e-148  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.1921e-48  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1896  Protein of unknown function DUF2029  51.12 
 
 		 429 aa  386  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.73633  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2268  Protein of unknown function DUF2029  49.12 
 
 		 419 aa  352  8e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.32611  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2388  hypothetical protein  30.92 
 
 		 469 aa  52.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0205  hypothetical protein  27.94 
 
 		 734 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.746079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1016  hypothetical protein  30.65 
 
 		 419 aa  46.6  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5329  hypothetical protein  30 
 
 		 478 aa  46.2  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>