13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2388 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2388  hypothetical protein  100 
 
 		 469 aa  924    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2387  hypothetical protein  47.36 
 
 		 462 aa  340  4e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00724191  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2282  Protein of unknown function DUF2029  25.69 
 
 		 469 aa  56.2  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291881  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2153  mannosyltransferase  24.42 
 
 		 369 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0955915  normal  0.0100871 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0243  putative integral membrane protein  27.61 
 
 		 417 aa  51.2  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5433  hypothetical protein  23.87 
 
 		 420 aa  50.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11183  mannosyltransferase  24.14 
 
 		 431 aa  45.8  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0753  hypothetical protein  27.59 
 
 		 437 aa  45.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2502  Protein of unknown function DUF2029  27.48 
 
 		 414 aa  44.3  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5506  hypothetical protein  26.57 
 
 		 395 aa  43.9  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344164  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5329  hypothetical protein  25 
 
 		 478 aa  43.9  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2488  putative integral membrane protein  30.92 
 
 		 421 aa  43.5  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.59815  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1126  Protein of unknown function DUF2029  25.84 
 
 		 425 aa  43.5  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>