12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2387 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2387  hypothetical protein  100 
 
 
462 aa  908    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00724191  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2388  hypothetical protein  47.36 
 
 
469 aa  370  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5433  hypothetical protein  26.62 
 
 
420 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12209  integral membrane protein  30.69 
 
 
427 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4089  hypothetical protein  25.74 
 
 
408 aa  51.2  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4545  hypothetical protein  26.2 
 
 
477 aa  48.9  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5055  hypothetical protein  25.54 
 
 
477 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5329  hypothetical protein  28.12 
 
 
478 aa  48.5  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0468  mannosyltransferase  27.34 
 
 
422 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0479  mannosyltransferase  27.34 
 
 
422 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0455  mannosyltransferase  27.34 
 
 
422 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0743  mannosyltransferase  30.88 
 
 
398 aa  43.1  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.186012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>