64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4545 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_5055  hypothetical protein  89.1 
 
 		 477 aa  743    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4545  hypothetical protein  100 
 
 		 477 aa  927    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5329  hypothetical protein  43.52 
 
 		 478 aa  224  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1385  hypothetical protein  41.47 
 
 		 412 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1016  hypothetical protein  43.53 
 
 		 419 aa  208  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1125  hypothetical protein  41.19 
 
 		 408 aa  194  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.51418  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1343  hypothetical protein  41.16 
 
 		 410 aa  190  5e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2282  Protein of unknown function DUF2029  34.22 
 
 		 469 aa  162  9e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291881  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12209  integral membrane protein  32.96 
 
 		 427 aa  144  5e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4020  Protein of unknown function DUF2029  33.12 
 
 		 426 aa  143  7e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.643753  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3543  putative integral membrane protein  32.07 
 
 		 428 aa  134  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2968  putative integral membrane protein  33.63 
 
 		 430 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2153  mannosyltransferase  34.97 
 
 		 369 aa  131  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0955915  normal  0.0100871 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4045  mannosyltransferase  34.73 
 
 		 443 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4274  mannosyltransferase  34.73 
 
 		 443 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4120  mannosyltransferase  34.73 
 
 		 443 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.703888 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11183  mannosyltransferase  32.97 
 
 		 431 aa  130  6e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21600  Protein of unknown function (DUF2029)  32.92 
 
 		 467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0988113  hitchhiker  0.00696231 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21610  Protein of unknown function (DUF2029)  35.19 
 
 		 421 aa  127  4.0000000000000003e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0338543  normal  0.0110628 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3276  putative integral membrane protein  30.11 
 
 		 418 aa  127  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3338  putative integral membrane protein  30.11 
 
 		 418 aa  127  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5433  hypothetical protein  30.63 
 
 		 420 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0993  hypothetical protein  35.42 
 
 		 411 aa  123  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1126  Protein of unknown function DUF2029  30.84 
 
 		 425 aa  123  8e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3287  putative integral membrane protein  30.77 
 
 		 418 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505534  normal  0.641522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2198  hypothetical protein  33.42 
 
 		 408 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2916  hypothetical protein  31.6 
 
 		 470 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189824  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2502  Protein of unknown function DUF2029  32.09 
 
 		 414 aa  120  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0243  putative integral membrane protein  30.46 
 
 		 417 aa  119  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155978 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4550  mannosyltransferase  34.35 
 
 		 406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.185586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6115  hypothetical protein  31.64 
 
 		 479 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112096  normal  0.027736 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4234  sugar transporter superfamily protein  34.97 
 
 		 402 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0070  hypothetical protein  32.86 
 
 		 455 aa  113  9e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4322  mannosyltransferase  32.01 
 
 		 417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06020  Protein of unknown function (DUF2029)  32.72 
 
 		 444 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.179625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0139  hypothetical protein  32.38 
 
 		 437 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  29.43 
 
 		 570 aa  107  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0743  mannosyltransferase  32.28 
 
 		 398 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.186012  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4089  hypothetical protein  34.09 
 
 		 408 aa  106  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2285  Protein of unknown function DUF2029  32.54 
 
 		 463 aa  104  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0425  hypothetical protein  30.75 
 
 		 417 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0435  hypothetical protein  30.75 
 
 		 417 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3685  hypothetical protein  30.6 
 
 		 420 aa  100  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3057  Protein of unknown function DUF2029  31.03 
 
 		 455 aa  98.6  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0888832  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3057  hypothetical protein  28.53 
 
 		 494 aa  94.7  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5506  hypothetical protein  28.35 
 
 		 395 aa  92.4  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344164  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0468  mannosyltransferase  29.62 
 
 		 422 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0455  mannosyltransferase  29.62 
 
 		 422 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0479  mannosyltransferase  29.62 
 
 		 422 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0467  mannosyltransferase  30 
 
 		 428 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0454  mannosyltransferase  30 
 
 		 428 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0478  mannosyltransferase  30 
 
 		 428 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0119  hypothetical protein  29.78 
 
 		 429 aa  85.1  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0466  mannosyltransferase  31 
 
 		 438 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0477  mannosyltransferase  31 
 
 		 438 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0453  mannosyltransferase  31 
 
 		 438 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3224  hypothetical protein  33.12 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3060  hypothetical protein  29.94 
 
 		 434 aa  74.3  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.647331  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3880  putative conserved membrane protein  30.63 
 
 		 375 aa  69.7  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561968 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1896  Protein of unknown function DUF2029  29.79 
 
 		 429 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.73633  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0205  hypothetical protein  29.92 
 
 		 734 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.746079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3867  hypothetical protein  26.56 
 
 		 734 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0838155  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0753  hypothetical protein  27.71 
 
 		 437 aa  45.8  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2388  hypothetical protein  23.61 
 
 		 469 aa  44.3  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>