40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3867 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0205  hypothetical protein  74.48 
 
 
734 aa  1009    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.746079  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3867  hypothetical protein  100 
 
 
734 aa  1450    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0838155  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4209  hypothetical protein  32.31 
 
 
688 aa  77.8  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1126  Protein of unknown function DUF2029  26.52 
 
 
425 aa  67.8  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2282  Protein of unknown function DUF2029  25.22 
 
 
469 aa  61.6  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291881  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1385  hypothetical protein  25.25 
 
 
412 aa  61.6  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488241  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0896  hypothetical protein  38.78 
 
 
656 aa  57  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000365013  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4020  Protein of unknown function DUF2029  25.9 
 
 
426 aa  55.5  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.643753  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2230  hypothetical protein  26.03 
 
 
430 aa  55.8  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.615453  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1343  hypothetical protein  24.91 
 
 
410 aa  54.7  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3443  hypothetical protein  30.71 
 
 
655 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.047188  normal  0.0829627 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4545  hypothetical protein  26.56 
 
 
477 aa  53.5  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1851  hypothetical protein  30.72 
 
 
642 aa  53.9  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.365514  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12209  integral membrane protein  25.17 
 
 
427 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3057  hypothetical protein  25.57 
 
 
494 aa  52.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0440  hypothetical protein  35.37 
 
 
705 aa  51.6  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202609  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11183  mannosyltransferase  28.23 
 
 
431 aa  51.2  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000655823  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5055  hypothetical protein  26.7 
 
 
477 aa  51.2  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1718  hypothetical protein  30.22 
 
 
827 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.715066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5433  hypothetical protein  25.35 
 
 
420 aa  50.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3146  Thiolase  28.76 
 
 
468 aa  50.4  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1016  hypothetical protein  27.8 
 
 
419 aa  49.3  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21610  Protein of unknown function (DUF2029)  28.9 
 
 
421 aa  49.3  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0338543  normal  0.0110628 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2502  Protein of unknown function DUF2029  25.65 
 
 
414 aa  49.7  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2968  putative integral membrane protein  24.16 
 
 
430 aa  48.1  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2206  putative integral membrane protein  26.05 
 
 
433 aa  48.1  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.913422  normal  0.531176 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2263  putative integral membrane protein  26.05 
 
 
438 aa  47.8  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2217  putative integral membrane protein  26.05 
 
 
438 aa  47.8  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0243  putative integral membrane protein  28.37 
 
 
417 aa  47.4  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155978 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06020  Protein of unknown function (DUF2029)  27.36 
 
 
444 aa  45.4  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.179625 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3543  putative integral membrane protein  25 
 
 
428 aa  45.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4803  hypothetical protein  25.18 
 
 
623 aa  44.7  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0267485  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3060  hypothetical protein  23.37 
 
 
434 aa  44.7  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.647331  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3908  hypothetical protein  29.33 
 
 
806 aa  44.7  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5506  hypothetical protein  25.55 
 
 
395 aa  44.3  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344164  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3287  putative integral membrane protein  26.36 
 
 
418 aa  44.7  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505534  normal  0.641522 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3338  putative integral membrane protein  26.36 
 
 
418 aa  44.3  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2488  putative integral membrane protein  25.48 
 
 
421 aa  44.3  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.59815  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3276  putative integral membrane protein  26.36 
 
 
418 aa  44.3  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0753  hypothetical protein  24.73 
 
 
437 aa  44.3  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>