63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0743 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0743  mannosyltransferase  100 
 
 		 398 aa  774    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.186012  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2153  mannosyltransferase  43.48 
 
 		 369 aa  281  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0955915  normal  0.0100871 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4322  mannosyltransferase  46.56 
 
 		 417 aa  278  9e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4274  mannosyltransferase  41.87 
 
 		 443 aa  262  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4120  mannosyltransferase  41.79 
 
 		 443 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.703888 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4045  mannosyltransferase  41.79 
 
 		 443 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4550  mannosyltransferase  43.99 
 
 		 406 aa  260  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.185586 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11183  mannosyltransferase  42.35 
 
 		 431 aa  247  3e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0468  mannosyltransferase  40.83 
 
 		 422 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0479  mannosyltransferase  40.83 
 
 		 422 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0455  mannosyltransferase  40.83 
 
 		 422 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0477  mannosyltransferase  37.69 
 
 		 438 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0466  mannosyltransferase  37.69 
 
 		 438 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0453  mannosyltransferase  37.69 
 
 		 438 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0467  mannosyltransferase  37.41 
 
 		 428 aa  212  7e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0478  mannosyltransferase  37.41 
 
 		 428 aa  212  7e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0454  mannosyltransferase  37.41 
 
 		 428 aa  212  7e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  41.53 
 
 		 570 aa  196  8.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3057  Protein of unknown function DUF2029  41.64 
 
 		 455 aa  194  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0888832  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2198  hypothetical protein  37.74 
 
 		 408 aa  160  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4234  sugar transporter superfamily protein  40.34 
 
 		 402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5433  hypothetical protein  34.77 
 
 		 420 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5506  hypothetical protein  35.05 
 
 		 395 aa  144  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344164  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12209  integral membrane protein  35.98 
 
 		 427 aa  143  6e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06020  Protein of unknown function (DUF2029)  39.2 
 
 		 444 aa  143  7e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.179625 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1126  Protein of unknown function DUF2029  35 
 
 		 425 aa  138  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4020  Protein of unknown function DUF2029  33.83 
 
 		 426 aa  137  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.643753  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2502  Protein of unknown function DUF2029  29.17 
 
 		 414 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3338  putative integral membrane protein  33.33 
 
 		 418 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3276  putative integral membrane protein  33.33 
 
 		 418 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3287  putative integral membrane protein  33.88 
 
 		 418 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505534  normal  0.641522 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2282  Protein of unknown function DUF2029  35.6 
 
 		 469 aa  129  9.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291881  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0243  putative integral membrane protein  33.11 
 
 		 417 aa  129  9.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6115  hypothetical protein  33.13 
 
 		 479 aa  123  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112096  normal  0.027736 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0993  hypothetical protein  39.66 
 
 		 411 aa  123  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0435  hypothetical protein  34.8 
 
 		 417 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0425  hypothetical protein  34.8 
 
 		 417 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2968  putative integral membrane protein  32.77 
 
 		 430 aa  120  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3543  putative integral membrane protein  31.21 
 
 		 428 aa  119  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21610  Protein of unknown function (DUF2029)  34.06 
 
 		 421 aa  119  7.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0338543  normal  0.0110628 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21600  Protein of unknown function (DUF2029)  32.15 
 
 		 467 aa  119  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0988113  hitchhiker  0.00696231 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2916  hypothetical protein  33.76 
 
 		 470 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189824  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3057  hypothetical protein  29.06 
 
 		 494 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1385  hypothetical protein  36.82 
 
 		 412 aa  116  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3224  hypothetical protein  42.01 
 
 		 378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4089  hypothetical protein  35.15 
 
 		 408 aa  113  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3685  hypothetical protein  32.02 
 
 		 420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5329  hypothetical protein  29.23 
 
 		 478 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4545  hypothetical protein  32.21 
 
 		 477 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1016  hypothetical protein  34.04 
 
 		 419 aa  106  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3060  hypothetical protein  35.87 
 
 		 434 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.647331  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5055  hypothetical protein  32.21 
 
 		 477 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0070  hypothetical protein  30.75 
 
 		 455 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2285  Protein of unknown function DUF2029  35.5 
 
 		 463 aa  100  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1343  hypothetical protein  33.23 
 
 		 410 aa  98.6  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0139  hypothetical protein  28.26 
 
 		 437 aa  87  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1125  hypothetical protein  31.45 
 
 		 408 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.51418  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0119  hypothetical protein  32.09 
 
 		 429 aa  78.2  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3880  putative conserved membrane protein  27.66 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561968 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0690  hypothetical protein  29.61 
 
 		 413 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.115844  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0649  hypothetical protein  32.93 
 
 		 420 aa  46.6  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2388  hypothetical protein  24.01 
 
 		 469 aa  43.9  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3063  hypothetical protein  31.17 
 
 		 395 aa  43.9  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.672578  normal  0.345622 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>