62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3685 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3685  hypothetical protein  100 
 
 		 420 aa  817    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4089  hypothetical protein  38.99 
 
 		 408 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4020  Protein of unknown function DUF2029  38.73 
 
 		 426 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.643753  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2282  Protein of unknown function DUF2029  33.33 
 
 		 469 aa  150  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291881  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0425  hypothetical protein  33.42 
 
 		 417 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0435  hypothetical protein  33.42 
 
 		 417 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4234  sugar transporter superfamily protein  36.09 
 
 		 402 aa  140  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2198  hypothetical protein  35.62 
 
 		 408 aa  140  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0993  hypothetical protein  36.86 
 
 		 411 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21600  Protein of unknown function (DUF2029)  33.33 
 
 		 467 aa  133  7.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0988113  hitchhiker  0.00696231 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12209  integral membrane protein  32.92 
 
 		 427 aa  131  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06020  Protein of unknown function (DUF2029)  35.33 
 
 		 444 aa  129  8.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.179625 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0455  mannosyltransferase  35.41 
 
 		 422 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0479  mannosyltransferase  35.41 
 
 		 422 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0468  mannosyltransferase  35.41 
 
 		 422 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5433  hypothetical protein  32.09 
 
 		 420 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4322  mannosyltransferase  33.75 
 
 		 417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5506  hypothetical protein  34.01 
 
 		 395 aa  120  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344164  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11183  mannosyltransferase  33.63 
 
 		 431 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0743  mannosyltransferase  31.74 
 
 		 398 aa  120  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.186012  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2916  hypothetical protein  37.22 
 
 		 470 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189824  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1016  hypothetical protein  36.26 
 
 		 419 aa  116  7.999999999999999e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5329  hypothetical protein  31.03 
 
 		 478 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0454  mannosyltransferase  32.25 
 
 		 428 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0478  mannosyltransferase  32.25 
 
 		 428 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0243  putative integral membrane protein  33.79 
 
 		 417 aa  114  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0467  mannosyltransferase  32.25 
 
 		 428 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0453  mannosyltransferase  30.65 
 
 		 438 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2502  Protein of unknown function DUF2029  29.97 
 
 		 414 aa  109  9.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0477  mannosyltransferase  30.65 
 
 		 438 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0466  mannosyltransferase  30.65 
 
 		 438 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1126  Protein of unknown function DUF2029  31.93 
 
 		 425 aa  109  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3287  putative integral membrane protein  31.89 
 
 		 418 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505534  normal  0.641522 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3338  putative integral membrane protein  31.89 
 
 		 418 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3276  putative integral membrane protein  31.89 
 
 		 418 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4545  hypothetical protein  30.6 
 
 		 477 aa  106  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21610  Protein of unknown function (DUF2029)  32.4 
 
 		 421 aa  106  9e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0338543  normal  0.0110628 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3543  putative integral membrane protein  30.82 
 
 		 428 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2153  mannosyltransferase  33.33 
 
 		 369 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0955915  normal  0.0100871 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1385  hypothetical protein  30.63 
 
 		 412 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2968  putative integral membrane protein  30.3 
 
 		 430 aa  103  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6115  hypothetical protein  31.46 
 
 		 479 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112096  normal  0.027736 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2285  Protein of unknown function DUF2029  32.06 
 
 		 463 aa  99.4  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0139  hypothetical protein  29.98 
 
 		 437 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1343  hypothetical protein  31.41 
 
 		 410 aa  99  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4120  mannosyltransferase  32.87 
 
 		 443 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.703888 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4045  mannosyltransferase  32.87 
 
 		 443 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4274  mannosyltransferase  32.87 
 
 		 443 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  33.22 
 
 		 570 aa  97.8  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5055  hypothetical protein  39.75 
 
 		 477 aa  96.3  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1125  hypothetical protein  34.08 
 
 		 408 aa  92.4  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.51418  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3057  hypothetical protein  30.38 
 
 		 494 aa  92.8  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4550  mannosyltransferase  32.88 
 
 		 406 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.185586 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0070  hypothetical protein  31.17 
 
 		 455 aa  90.5  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0119  hypothetical protein  30.77 
 
 		 429 aa  87  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3060  hypothetical protein  28.86 
 
 		 434 aa  84  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.647331  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3057  Protein of unknown function DUF2029  30.22 
 
 		 455 aa  83.2  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0888832  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3224  hypothetical protein  32.63 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3880  putative conserved membrane protein  30 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5286  hypothetical protein  21.9 
 
 		 431 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.32718 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2388  hypothetical protein  25.93 
 
 		 469 aa  47.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1213  Protein of unknown function DUF2029  24.2 
 
 		 427 aa  44.3  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0404366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>