64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3543 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2968  putative integral membrane protein  83.99 
 
 
430 aa  659    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3543  putative integral membrane protein  100 
 
 
428 aa  830    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3276  putative integral membrane protein  75.06 
 
 
418 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3338  putative integral membrane protein  75.06 
 
 
418 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3287  putative integral membrane protein  75.3 
 
 
418 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505534  normal  0.641522 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12209  integral membrane protein  67.35 
 
 
427 aa  502  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2502  Protein of unknown function DUF2029  40.5 
 
 
414 aa  227  3e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5506  hypothetical protein  42.39 
 
 
395 aa  210  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344164  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5433  hypothetical protein  37.86 
 
 
420 aa  184  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2198  hypothetical protein  36.66 
 
 
408 aa  182  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4234  sugar transporter superfamily protein  36.36 
 
 
402 aa  163  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3057  hypothetical protein  36.66 
 
 
494 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1126  Protein of unknown function DUF2029  34.57 
 
 
425 aa  152  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0139  hypothetical protein  35.26 
 
 
437 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2916  hypothetical protein  40.19 
 
 
470 aa  149  7e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189824  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3224  hypothetical protein  37.89 
 
 
378 aa  149  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0243  putative integral membrane protein  35.05 
 
 
417 aa  146  8.000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155978 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1016  hypothetical protein  36.34 
 
 
419 aa  143  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2282  Protein of unknown function DUF2029  33.12 
 
 
469 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291881  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4020  Protein of unknown function DUF2029  30.45 
 
 
426 aa  137  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.643753  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21610  Protein of unknown function (DUF2029)  36.34 
 
 
421 aa  135  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0338543  normal  0.0110628 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4545  hypothetical protein  31.78 
 
 
477 aa  130  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0070  hypothetical protein  36.07 
 
 
455 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06020  Protein of unknown function (DUF2029)  34.82 
 
 
444 aa  127  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.179625 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5329  hypothetical protein  31.48 
 
 
478 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5055  hypothetical protein  28.96 
 
 
477 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2153  mannosyltransferase  33.78 
 
 
369 aa  121  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0955915  normal  0.0100871 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3060  hypothetical protein  32.38 
 
 
434 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.647331  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4120  mannosyltransferase  33.78 
 
 
443 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.703888 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4045  mannosyltransferase  33.78 
 
 
443 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4274  mannosyltransferase  33.78 
 
 
443 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6115  hypothetical protein  29.21 
 
 
479 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112096  normal  0.027736 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11183  mannosyltransferase  33.77 
 
 
431 aa  114  5e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000655823  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0743  mannosyltransferase  31.88 
 
 
398 aa  113  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.186012  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1385  hypothetical protein  35.67 
 
 
412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488241  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4550  mannosyltransferase  33.22 
 
 
406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.185586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0468  mannosyltransferase  33.44 
 
 
422 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0455  mannosyltransferase  33.44 
 
 
422 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0479  mannosyltransferase  33.44 
 
 
422 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4322  mannosyltransferase  31.44 
 
 
417 aa  108  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0425  hypothetical protein  29.02 
 
 
417 aa  103  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0435  hypothetical protein  29.02 
 
 
417 aa  103  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0119  hypothetical protein  36.39 
 
 
429 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21600  Protein of unknown function (DUF2029)  30.45 
 
 
467 aa  102  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0988113  hitchhiker  0.00696231 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1125  hypothetical protein  34.78 
 
 
408 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.51418  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0993  hypothetical protein  33.77 
 
 
411 aa  101  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  32.78 
 
 
570 aa  101  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3057  Protein of unknown function DUF2029  30.48 
 
 
455 aa  100  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0888832  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3685  hypothetical protein  31.45 
 
 
420 aa  97.8  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1343  hypothetical protein  32.23 
 
 
410 aa  96.3  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0453  mannosyltransferase  29.68 
 
 
438 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355546  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0466  mannosyltransferase  29.68 
 
 
438 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0477  mannosyltransferase  29.68 
 
 
438 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2285  Protein of unknown function DUF2029  31.61 
 
 
463 aa  94.4  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4089  hypothetical protein  32.24 
 
 
408 aa  92.8  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0478  mannosyltransferase  30.92 
 
 
428 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0454  mannosyltransferase  30.92 
 
 
428 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0467  mannosyltransferase  30.92 
 
 
428 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3880  putative conserved membrane protein  30.56 
 
 
375 aa  65.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561968 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3146  Thiolase  29.62 
 
 
468 aa  60.8  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0205  hypothetical protein  27.43 
 
 
734 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.746079  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3867  hypothetical protein  26.22 
 
 
734 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0838155  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5286  hypothetical protein  29.07 
 
 
431 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.32718 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1896  Protein of unknown function DUF2029  27.8 
 
 
429 aa  43.5  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.73633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>