64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2968 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2968  putative integral membrane protein  100 
 
 
430 aa  837    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3543  putative integral membrane protein  83.99 
 
 
428 aa  660    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3276  putative integral membrane protein  75.36 
 
 
418 aa  559  1e-158  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3338  putative integral membrane protein  75.36 
 
 
418 aa  559  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3287  putative integral membrane protein  75.36 
 
 
418 aa  549  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505534  normal  0.641522 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12209  integral membrane protein  64.96 
 
 
427 aa  496  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2502  Protein of unknown function DUF2029  39.24 
 
 
414 aa  224  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5506  hypothetical protein  39.79 
 
 
395 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344164  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5433  hypothetical protein  36.44 
 
 
420 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2198  hypothetical protein  37.43 
 
 
408 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4234  sugar transporter superfamily protein  37.11 
 
 
402 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1126  Protein of unknown function DUF2029  34.57 
 
 
425 aa  153  5.9999999999999996e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2916  hypothetical protein  38.11 
 
 
470 aa  150  5e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189824  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3224  hypothetical protein  39.68 
 
 
378 aa  149  8e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2282  Protein of unknown function DUF2029  34.59 
 
 
469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291881  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0139  hypothetical protein  36.44 
 
 
437 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1016  hypothetical protein  36.97 
 
 
419 aa  147  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3057  hypothetical protein  33.33 
 
 
494 aa  144  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0243  putative integral membrane protein  34.96 
 
 
417 aa  143  7e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155978 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4020  Protein of unknown function DUF2029  30.32 
 
 
426 aa  143  7e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.643753  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21610  Protein of unknown function (DUF2029)  35.41 
 
 
421 aa  140  3.9999999999999997e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0338543  normal  0.0110628 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4545  hypothetical protein  33.63 
 
 
477 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5055  hypothetical protein  33.92 
 
 
477 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5329  hypothetical protein  32.82 
 
 
478 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06020  Protein of unknown function (DUF2029)  35.71 
 
 
444 aa  130  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.179625 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2153  mannosyltransferase  33.11 
 
 
369 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0955915  normal  0.0100871 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0070  hypothetical protein  36.28 
 
 
455 aa  125  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1385  hypothetical protein  33.02 
 
 
412 aa  121  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488241  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4550  mannosyltransferase  34.12 
 
 
406 aa  121  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.185586 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  33 
 
 
570 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11183  mannosyltransferase  35.1 
 
 
431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000655823  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4120  mannosyltransferase  34.45 
 
 
443 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.703888 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4045  mannosyltransferase  34.45 
 
 
443 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4274  mannosyltransferase  34.45 
 
 
443 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3060  hypothetical protein  32.19 
 
 
434 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.647331  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4322  mannosyltransferase  28.1 
 
 
417 aa  114  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0743  mannosyltransferase  32.09 
 
 
398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.186012  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6115  hypothetical protein  28.15 
 
 
479 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112096  normal  0.027736 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0993  hypothetical protein  34.44 
 
 
411 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0468  mannosyltransferase  32.9 
 
 
422 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0455  mannosyltransferase  32.9 
 
 
422 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0479  mannosyltransferase  32.9 
 
 
422 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1125  hypothetical protein  35.19 
 
 
408 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.51418  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1343  hypothetical protein  32.56 
 
 
410 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21600  Protein of unknown function (DUF2029)  32.05 
 
 
467 aa  101  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0988113  hitchhiker  0.00696231 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2285  Protein of unknown function DUF2029  32.52 
 
 
463 aa  101  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0425  hypothetical protein  28.98 
 
 
417 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0435  hypothetical protein  28.98 
 
 
417 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3057  Protein of unknown function DUF2029  29.06 
 
 
455 aa  99.8  9e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0888832  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0119  hypothetical protein  32.02 
 
 
429 aa  99  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0453  mannosyltransferase  31.21 
 
 
438 aa  96.3  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355546  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0466  mannosyltransferase  31.21 
 
 
438 aa  96.3  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0477  mannosyltransferase  31.21 
 
 
438 aa  96.3  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4089  hypothetical protein  30.36 
 
 
408 aa  93.6  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3685  hypothetical protein  30.87 
 
 
420 aa  89.7  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0454  mannosyltransferase  28.86 
 
 
428 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0478  mannosyltransferase  28.86 
 
 
428 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0467  mannosyltransferase  28.86 
 
 
428 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3146  Thiolase  30.14 
 
 
468 aa  65.5  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3880  putative conserved membrane protein  30.08 
 
 
375 aa  62.4  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561968 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0753  hypothetical protein  30.99 
 
 
437 aa  50.8  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1896  Protein of unknown function DUF2029  27.15 
 
 
429 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.73633  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0205  hypothetical protein  25.95 
 
 
734 aa  47  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.746079  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3867  hypothetical protein  24.46 
 
 
734 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0838155  normal  0.221167 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>